同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00152

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00152

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00152 Chr03 70482338-70860311 Chr04 18431899-18791084 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00152`	Chr03:70482338-70860311	Chr04:18431899-18791084	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G285950 → LXL04_018826

100.0%

TkA03G286130 → LXL04_018825

99.5%

TkA03G286260 → LXL04_018823

98.9%

TkA03G286270 → LXL04_018822

98.7%

TkA03G286570 → LXL04_018814

92.7%

TkA03G286680 → LXL04_018813

99.6%

TkA03G286690 → LXL04_018812

99.2%

TkA03G286810 → LXL04_018807

99.8%

TkA03G286820 → LXL04_018806

82.1%

TkA03G286910 → LXL04_018805

100.0%

TkA03G286920 → LXL04_018805

99.9%

TkA03G286960 → LXL04_018803

96.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G285950`	`LXL04_018826`	`JCVI_TKOH_00152`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G286130`	`LXL04_018825`	`JCVI_TKOH_00152`	99.5	100.0 / 76.718	Complex
`TkA03G286260`	`LXL04_018823`	`JCVI_TKOH_00152`	98.9	98.704 / 83.151	Complex
`TkA03G286270`	`LXL04_018822`	`JCVI_TKOH_00152`	98.7	95.092 / 62.753	待复核
`TkA03G286570`	`LXL04_018814`	`JCVI_TKOH_00152`	92.7	98.783 / 91.784	Complex
`TkA03G286680`	`LXL04_018813`	`JCVI_TKOH_00152`	99.6	92.171 / 66.753	Complex
`TkA03G286690`	`LXL04_018812`	`JCVI_TKOH_00152`	99.2	100.0 / 69.54	Complex
`TkA03G286810`	`LXL04_018807`	`JCVI_TKOH_00152`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G286820`	`LXL04_018806`	`JCVI_TKOH_00152`	82.1	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G286910`	`LXL04_018805`	`JCVI_TKOH_00152`	100.0	87.5 / 11.028	待复核
`TkA03G286920`	`LXL04_018805`	`JCVI_TKOH_00152`	99.9	100.0 / 82.521	Complex
`TkA03G286960`	`LXL04_018803`	`JCVI_TKOH_00152`	96.9	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G287010`	`LXL04_018802`	`JCVI_TKOH_00152`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G287020`	`LXL04_018801`	`JCVI_TKOH_00152`	99.7	95.506 / 100.0	待复核
`TkA03G287070`	`LXL04_018800`	`JCVI_TKOH_00152`	99.5	100.0 / 100.0	Complex