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ID 对照

本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。

版本来源

版本 组装/注释 accession 来源数据库 论文 DOI / PMID 下载日期
TK1151
Taraxacum kok-saghyz
GWHBCHF00000000
GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein
NGDC Genome Warehouse (GWH) Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum
Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022
10.1007/s11427-021-2033-2
PMID: 34939160
2026-08-14
OH-1004 / OSU_TarKok_2.0
Taraxacum kok-saghyz
GCA_047496595.1
GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17)
未发现
未发现 2026-08-14

完整基因 ID 对照表

参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 24458 条。当前显示第 180 / 245 页。

清除
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
TK1151 基因 ID OH-1004 基因 ID 类别 关系 / 置信度 相似度 / 覆盖度 共线性区块 说明
TkA06G465800
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复杂
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TkA06G466190
TkA06G466200
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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TkA06G467380
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复杂
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TkA06G467390
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复杂
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TkA06G468130
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复杂
100.000
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
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复杂
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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TkA06G470520
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复杂
54.200
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TkA06G470750
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复杂
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TkA06G471130
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复杂
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TkA06G471440
TkA06G471450
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多对一 non reciprocal best hit
复杂
52.200
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TkA06G471450
TkA06G471640
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CM104801.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
73.300
查询 90.909 / 对象 75.154
TkA06G471640
TkA06G471900
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复杂
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查询 84.133 / 对象 18.630
TkA06G471900
TkA06G472160
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CM104807.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
81.600
查询 16.450 / 对象 13.620
TkA06G472160
TkA06G472280
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
95.100
查询 70.629 / 对象 61.677
TkA06G472280
TkA06G472930
Chr06:116958190-116965760 (+)
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Chr03:49514222-49522083 (-)
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
50.500
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TkA06G472930
TkA06G472940
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复杂
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TkA06G472940
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多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
99.200
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JCVI_TKOH_00287 TkA06G473100
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CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
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复杂
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JCVI_TKOH_00287 TkA06G473220
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复杂
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JCVI_TKOH_00287 TkA06G473790
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
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复杂
93.700
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复杂
48.100
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复杂
95.200
查询 71.103 / 对象 17.793
TkA07G001470
TkA07G001510
Chr07:391727-395314 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_026677
Chr06:1348871-1352056 (+)
CM104804.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
100.000
查询 100.000 / 对象 100.000
JCVI_TKOH_00302 TkA07G001510
TkA07G001550
Chr07:402438-408759 (+)
GWHBCHF00000008
LXL04_014884
Chr03:58915246-58930624 (+)
CM104801.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
69.000
查询 71.201 / 对象 27.595
TkA07G001550
TkA07G001770
Chr07:441738-448121 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_003357
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CM104799.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
77.400
查询 9.743 / 对象 22.440
TkA07G001770
TkA07G001820
Chr07:459424-466384 (-)
GWHBCHF00000008
LXL04_026688
Chr06:1400516-1411145 (-)
CM104804.1
多对一 non reciprocal best hit
复杂
98.200
查询 83.663 / 对象 18.989
JCVI_TKOH_00302 TkA07G001820
TkA07G001940
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GWHBCHF00000008
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Chr02:55728801-55738940 (+)
CM104800.1
多对一 多个 TK1151 基因对应同一 OH-1004 基因
复杂
47.500
查询 98.381 / 对象 59.383
TkA07G001940
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