ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 80 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA08G078040
Chr08:20024100-20024552 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018691
Chr04:16690485-16692332 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
50.700 查询 97.333 / 对象 40.984 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078040 |
|
TkA08G078130
Chr08:20062241-20064987 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018695
Chr04:16780924-16788531 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 99.569 / 对象 26.767 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078130 |
|
TkA08G078290
Chr08:20115823-20117934 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018697
Chr04:16864395-16866051 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 77.297 / 对象 79.444 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078290 |
|
TkA08G078600
Chr08:20170767-20175094 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018699
Chr04:16932437-16934338 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 44.043 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078600 |
|
TkA08G078740
Chr08:20217672-20219980 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018700
Chr04:16980374-16988041 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 97.410 / 对象 48.035 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078740 |
|
TkA08G078750
Chr08:20221061-20227820 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018701
Chr04:16983955-16990416 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 59.740 / 对象 39.485 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078750 |
|
TkA08G078760
Chr08:20222997-20225292 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018700
Chr04:16980374-16988041 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 27.898 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G078760 |
|
TkA08G079710
Chr08:20450591-20451037 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018711
Chr04:17216509-17216955 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G079710 |
|
TkA08G079770
Chr08:20474723-20476607 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018715
Chr04:17261514-17262729 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 100.000 / 对象 48.857 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G079770 |
|
TkA08G079800
Chr08:20484216-20484912 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018717
Chr04:17264938-17267169 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.270 / 对象 58.369 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G079800 |
|
TkA08G079920
Chr08:20515145-20516999 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018720
Chr04:17291488-17294951 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.297 / 对象 44.776 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G079920 |
|
TkA08G079950
Chr08:20519797-20524983 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018721
Chr04:17296405-17301156 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.800 查询 96.961 / 对象 54.714 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G079950 |
|
TkA08G079960
Chr08:20525487-20526179 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018722
Chr04:17301704-17303465 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 87.898 / 对象 58.228 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G079960 |
|
TkA08G080070
Chr08:20547976-20552412 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_036848
Chr08:49135527-49142230 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.200 查询 94.949 / 对象 25.371 |
TkA08G080070 | |
|
TkA08G080400
Chr08:20662322-20664212 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018740
Chr04:17444406-17446027 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 48.325 / 对象 29.882 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G080400 |
|
TkA08G080460
Chr08:20681412-20689468 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018741
Chr04:17472087-17479772 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 95.484 / 对象 48.684 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G080460 |
|
TkA08G080610
Chr08:20718110-20719980 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018744
Chr04:17508244-17509841 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G080610 |
|
TkA08G080770
Chr08:20753994-20755963 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018748
Chr04:17541944-17544914 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 97.704 / 对象 95.902 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G080770 |
|
TkA08G081230
Chr08:20880229-20880672 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018756
Chr04:17676627-17680619 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 41.176 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G081230 |
|
TkA08G081240
Chr08:20883666-20884226 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018756
Chr04:17676627-17680619 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 96.774 / 对象 50.420 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G081240 |
|
TkA08G081440
Chr08:20918584-20919051 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018759
Chr04:17708388-17708855 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G081440 |
|
TkA08G081540
Chr08:20934564-20935804 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_023653
Chr05:59299007-59300392 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.100 查询 60.755 / 对象 62.846 |
TkA08G081540 | |
|
TkA08G082390
Chr08:21180235-21180708 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_014973
Chr03:60667701-60671678 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 90.446 / 对象 55.906 |
TkA08G082390 | |
|
TkA08G082470
Chr08:21193289-21194189 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018772
Chr04:18000001-18000558 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 59.829 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G082470 |
|
TkA08G082580
Chr08:21231604-21231975 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_004434
Chr01:135989317-135993977 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
71.400 查询 47.967 / 对象 21.875 |
TkA08G082580 | |
|
TkA08G082650
Chr08:21238457-21239761 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018776
Chr04:18112146-18116452 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.000 查询 95.078 / 对象 70.339 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G082650 |
|
TkA08G082960
Chr08:21344193-21344498 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_026260
Chr05:124049704-124056835 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.100 查询 50.495 / 对象 18.545 |
TkA08G082960 | |
|
TkA08G083370
Chr08:21454644-21457073 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018796
Chr04:18338210-18346062 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
73.300 查询 81.081 / 对象 28.896 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G083370 |
|
TkA08G083770
Chr08:21579697-21582980 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018801
Chr04:18446030-18448534 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 90.882 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G083770 |
|
TkA08G083820
Chr08:21593403-21595299 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018803
Chr04:18462319-18463821 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G083820 |
|
TkA08G083870
Chr08:21612434-21614283 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018805
Chr04:18474421-18482790 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 91.071 / 对象 11.478 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G083870 |
|
TkA08G084000
Chr08:21644286-21645019 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_009268
Chr02:121674619-121675727 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.100 查询 97.458 / 对象 60.209 |
TkA08G084000 | |
|
TkA08G084020
Chr08:21647927-21648350 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_004882
Chr01:149389412-149394164 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.100 查询 54.615 / 对象 23.826 |
TkA08G084020 | |
|
TkA08G085350
Chr08:21994965-21997155 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018831
Chr04:18855007-18858248 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 99.699 / 对象 69.979 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G085350 |
|
TkA08G085630
Chr08:22074579-22075109 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018835
Chr04:18935370-18935909 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 98.324 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G085630 |
|
TkA08G085930
Chr08:22142241-22148595 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018838
Chr04:19003272-19015671 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 49.027 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G085930 |
|
TkA08G085940
Chr08:22151008-22156579 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018838
Chr04:19003272-19015671 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 49.676 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G085940 |
|
TkA08G086100
Chr08:22225553-22227292 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018842
Chr04:19077388-19081929 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 88.710 / 对象 30.784 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G086100 |
|
TkA08G086120
Chr08:22233444-22246244 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018844
Chr04:19085552-19097677 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.531 / 对象 8.749 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G086120 |
|
TkA08G086250
Chr08:22276397-22280049 (+)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018848
Chr04:19118122-19127464 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 98.452 / 对象 54.828 |
JCVI_TKOH_00339 | TkA08G086250 |
|
TkA08G086320
Chr08:22307077-22312759 (-)
GWHBCHF00000009
|
LXL04_018851
Chr04:19151395-19168022 (-)
CM104802.1
|
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Chr07:2425981-2431242 (-)
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80.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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50.800 查询 83.178 / 对象 74.699 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 53.271 |
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