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基因概览

LXL04_018875

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 19476043-19479909 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1470 bp · LXL04_018875|LXL04_018875|OH1004|cDNA

ATGAAGACTACGATTTTGAAGAGGAAGAGGAGCGGTAGTAGCAGAAAGGAAACGCAGAAGAGGATGAAAGGTTCGCTGGCTAGACACTTATCGGCTCAGCTAGGTCAAATCTCTTTCAAGCCGCCGCTTCCTCAGAATAGTAACAATCCTTCGCGGTTTCAGAATCTTCCGGATTACGAGGCTCCCGATACATCGGAATCAGCCCCGTCTACATCGTCGTTTCCGTCGGCGACGGTTCTAGATTTCGATACCGATGTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1470 bp · LXL04_018875|LXL04_018875|OH1004|CDS

ATGAAGACTACGATTTTGAAGAGGAAGAGGAGCGGTAGTAGCAGAAAGGAAACGCAGAAGAGGATGAAAGGTTCGCTGGCTAGACACTTATCGGCTCAGCTAGGTCAAATCTCTTTCAAGCCGCCGCTTCCTCAGAATAGTAACAATCCTTCGCGGTTTCAGAATCTTCCGGATTACGAGGCTCCCGATACATCGGAATCAGCCCCGTCTACATCGTCGTTTCCGTCGGCGACGGTTCTAGATTTCGATACCGATGTCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

489 aa · LXL04_018875|LXL04_018875|OH1004|PROTEIN

MKTTILKRKRSGSSRKETQKRMKGSLARHLSAQLGQISFKPPLPQNSNNPSRFQNLPDYEAPDTSESAPSTSSFPSATVLDFDTDVNVDEKNFILSQDFFCTPDYITPEAPPLPVTLGCDKMEELPCPRSPEKLKSVRSKRHREAFLNLEEDITEETETDNQPVTEPQVSRQGYVSQSAVALRCRVMPPPCMKNPYIKGSSDNDIDPFGDRRSKCAVFLPAAFSGDGLSRYRTDFHEIKQIGTGNFSCVFKALKRIDGCM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018875`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018875

位置 Chr04:19476043-19479909 (-)

描述 Similar to WEE1: Wee1-like protein kinase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g02970`	细胞周期调节激酶，在正常生长条件下不会限制周期进展。	A WEE1 homologue from Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1007/s00425-002-0815-4 Diverse phosphoregulatory mechanisms controlling cyclin-dependent kinase-activating kinases in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02820.x Arabidopsis WEE1 kinase controls cell cycle arrest in response to activation of the DNA integrity checkpoint.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.045047

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0135300`	Wee1 样蛋白激酶。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018875 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000076 DNA replication checkpoint signaling 生物过程

GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程

GO:0010972 negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle 生物过程

GO:0045786 negative regulation of cell cycle 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0051321 meiotic cell cycle 生物过程

GO:0060631 regulation of meiosis I 生物过程

GO:1902750 negative regulation of cell cycle G2/M phase transition 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G02970

dosa:Os02g0135300

dre:327471

xla:398396

xla:399355

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.586

排名 1 · LXL04_018875 · OH-1004

细胞质0.487

排名 2 · LXL04_018875 · OH-1004

线粒体0.063

排名 3 · LXL04_018875 · OH-1004

细胞膜0.047

排名 4 · LXL04_018875 · OH-1004

内质网0.033

排名 5 · LXL04_018875 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase235-477 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr238-475 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018875	`PF00069.32`	Pkinase	235	477	7.1e-49	167.3
LXL04_018875	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	238	475	2.1e-24	86.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8L4H0`	拟南芥	Wee1-like protein kinase	57.143%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q6Z829`	水稻	Wee1-like protein kinase	57.412%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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