ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 10 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G500990
Chr01:125517003-125518784 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_025093
Chr05:105837280-105841807 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.300 查询 100.000 / 对象 38.319 |
TkA01G500990 | |
|
TkA01G502060
Chr01:125763624-125764382 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_028360
Chr06:38966376-38971379 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 94.964 / 对象 40.244 |
TkA01G502060 | |
|
TkA01G502280
Chr01:125818667-125820442 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001880
Chr01:35866303-35867782 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G502280 |
|
TkA01G503310
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_017575
Chr03:153861862-153863504 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA01G503310 | |
|
TkA01G503560
Chr01:126092192-126094745 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001855
Chr01:35106689-35108849 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 78.779 / 对象 48.393 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G503560 |
|
TkA01G503690
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_001853
Chr01:35066516-35068291 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 93.168 / 对象 37.783 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G503690 |
|
TkA01G504010
Chr01:126188902-126189528 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001850
Chr01:35001792-35002418 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G504010 |
|
TkA01G504100
Chr01:126214949-126215395 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001847
Chr01:34954633-34956465 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.900 查询 95.270 / 对象 23.115 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G504100 |
|
TkA01G504120
Chr01:126221050-126221562 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001846
Chr01:34949284-34950343 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 53.481 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G504120 |
|
TkA01G504320
Chr01:126278423-126281707 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001843
Chr01:34892129-34899228 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 96.784 / 对象 28.252 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G504320 |
|
TkA01G504520
Chr01:126321162-126326178 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001840
Chr01:34858396-34862839 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.599 / 对象 57.164 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G504520 |
|
TkA01G504850
Chr01:126418107-126424394 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001837
Chr01:34790856-34798052 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.200 查询 100.000 / 对象 61.693 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G504850 |
|
TkA01G506970
Chr01:126966877-126967957 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_025598
Chr05:114013481-114014832 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 95.683 / 对象 57.082 |
TkA01G506970 | |
|
TkA01G506990
Chr01:126972359-126972721 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001822
Chr01:34322947-34329581 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 75.000 / 对象 30.717 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G506990 |
|
TkA01G507260
Chr01:127054981-127055825 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001819
Chr01:34230440-34231000 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G507260 |
|
TkA01G507650
Chr01:127167492-127169270 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001815
Chr01:34094249-34096027 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G507650 |
|
TkA01G507780
Chr01:127198604-127200444 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_026789
Chr06:2913600-2914646 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.900 查询 53.704 / 对象 41.667 |
TkA01G507780 | |
|
TkA01G509410
Chr01:127614684-127615157 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001799
Chr01:33633981-33635078 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 84.713 / 对象 67.172 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G509410 |
|
TkA01G509510
Chr01:127657551-127657955 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001530
Chr01:28449286-28449690 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA01G509510 | |
|
TkA01G509520
Chr01:127658709-127662855 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001795
Chr01:33588829-33591570 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G509520 |
|
TkA01G509540
Chr01:127666106-127666940 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001794
Chr01:33583744-33585832 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 34.226 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G509540 |
|
TkA01G510070
Chr01:127799255-127800282 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001789
Chr01:33471996-33480527 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.259 / 对象 19.007 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G510070 |
|
TkA01G510090
Chr01:127807048-127807727 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001789
Chr01:33471996-33480527 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 19.007 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G510090 |
|
TkA01G510260
Chr01:127848110-127849172 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001789
Chr01:33471996-33480527 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 31.631 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G510260 |
|
TkA01G510280
Chr01:127853745-127855201 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_034453
Chr07:101124695-101125266 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 97.414 / 对象 91.870 |
TkA01G510280 | |
|
TkA01G510640
Chr01:127947223-127947951 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001782
Chr01:33322973-33324418 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 50.312 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G510640 |
|
TkA01G512040
Chr01:128314186-128317237 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001791
Chr01:33492771-33493558 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.400 查询 100.000 / 对象 55.605 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G512040 |
|
TkA01G512140
Chr01:128358633-128358935 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001781
Chr01:33289990-33298155 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 96.000 / 对象 33.803 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G512140 |
|
TkA01G512290
Chr01:128400212-128401017 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_005031
Chr01:153326595-153332682 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 95.378 / 对象 37.152 |
TkA01G512290 | |
|
TkA01G512790
Chr01:128515426-128515923 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001770
Chr01:33074923-33083100 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 73.759 / 对象 33.657 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G512790 |
|
TkA01G512890
Chr01:128544648-128546621 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001768
Chr01:33052774-33054261 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G512890 |
|
TkA01G513150
Chr01:128616031-128621349 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_012962
Chr03:21638711-21645964 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.800 查询 95.726 / 对象 17.116 |
TkA01G513150 | |
|
TkA01G513890
Chr01:128793573-128794523 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_002193
Chr01:43644974-43649658 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.700 查询 16.292 / 对象 23.200 |
TkA01G513890 | |
|
TkA01G515080
Chr01:129064018-129066356 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001751
Chr01:32499207-32503374 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 59.119 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G515080 |
|
TkA01G515090
Chr01:129066171-129067704 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001750
Chr01:32497783-32499106 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 43.539 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G515090 |
|
TkA01G515280
Chr01:129120027-129121175 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001748
Chr01:32392190-32395382 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 97.071 / 对象 50.989 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G515280 |
|
TkA01G515300
Chr01:129122431-129123504 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001748
Chr01:32392190-32395382 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.000 查询 100.000 / 对象 49.451 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G515300 |
|
TkA01G515450
Chr01:129166721-129169720 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001742
Chr01:32262163-32264824 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G515450 |
|
TkA01G515620
Chr01:129208452-129211689 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001737
Chr01:32211645-32222420 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.400 查询 98.417 / 对象 55.689 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G515620 |
|
TkA01G515710
Chr01:129241213-129241714 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_025954
Chr05:118956558-118959887 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 19.101 |
TkA01G515710 | |
|
TkA01G516120
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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