基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_001748
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 32392190-32395382
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1418 bp · LXL04_001748|LXL04_001748|OH1004|cDNA
ATGGCGAAACAAGAAGAAGTAATTCTCCTGGATTTCTGGCCGAGCATGTATGGGATGAGGGTCAGGATCGCACTTGCCGAAAAGGGTGTTTCATATGAATACAGAGAAGAGGATTTGGGGAGCAGAATCAAAAGCCAGCTTCTCGTTGAGATGAACCCGATTCACAAGAAAATCCCGGTCCTCATTCACAACGGCAAACCGATCTGCGAGTCCACAATCGTCTTTGAGTATATCGATGAAGTCTGGAACGAAAAATGTCC...
CDS
下载 CDS FASTA1368 bp · LXL04_001748|LXL04_001748|OH1004|CDS
ATGGCGAAACAAGAAGAAGTAATTCTCCTGGATTTCTGGCCGAGCATGTATGGGATGAGGGTCAGGATCGCACTTGCCGAAAAGGGTGTTTCATATGAATACAGAGAAGAGGATTTGGGGAGCAGAATCAAAAGCCAGCTTCTCGTTGAGATGAACCCGATTCACAAGAAAATCCCGGTCCTCATTCACAACGGCAAACCGATCTGCGAGTCCACAATCGTCTTTGAGTATATCGATGAAGTCTGGAACGAAAAATGTCC...
455 aa · LXL04_001748|LXL04_001748|OH1004|PROTEIN
MAKQEEVILLDFWPSMYGMRVRIALAEKGVSYEYREEDLGSRIKSQLLVEMNPIHKKIPVLIHNGKPICESTIVFEYIDEVWNEKCPLLPSDTYGKARARFWVDFIDKKVFPNGRILCYKSKGEEHEAARKEFMDSVKLLEGELGDKVYFGGESLGYVDATLIPFYAWLIAYETYGELNVEKECPKLIDWAKRCFQKESVSNALPESLKILEFVKQIRKNLGVDDPALNINTSTPPTCTDILRSATISKSPTMAIEEKVI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_001748 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_001748 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:32392190-32395382 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to Probable glutathione S-transferase | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程 GO:0009407 toxin catabolic process 生物过程 GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0046256 2,4,6-trinitrotoluene catabolic process 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0004364 glutathione transferase activity 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G17180 nta:107782951 nta:107823949 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.811
细胞核0.199
线粒体0.072
细胞膜0.062
内质网0.061
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF02798.27GST_N6-80 aaPF13417.13GST_N_315-80 aaPF13409.13GST_N_215-80 aaPF00043.31GST_C122-197 aaPF13410.12GST_C_2125-193 aaPF02798.27GST_N258-330 aaPF13417.13GST_N_3267-330 aaPF13409.13GST_N_2267-330 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_001748 | PF02798.27 | GST_N | 6 | 80 | 8.7e-44 | 148.5 |
| LXL04_001748 | PF13417.13 | GST_N_3 | 15 | 80 | 1.2e-30 | 106.4 |
| LXL04_001748 | PF13409.13 | GST_N_2 | 15 | 80 | 6.7e-28 | 97.8 |
| LXL04_001748 | PF00043.31 | GST_C | 122 | 197 | 1.2e-16 | 61.4 |
| LXL04_001748 | PF13410.12 | GST_C_2 | 125 | 193 | 1.7e-23 | 83.2 |
| LXL04_001748 | PF02798.27 | GST_N | 258 | 330 | 8.7e-44 | 148.5 |
| LXL04_001748 | PF13417.13 | GST_N_3 | 267 | 330 | 1.2e-30 | 106.4 |
| LXL04_001748 | PF13409.13 | GST_N_2 | 267 | 330 | 6.7e-28 | 97.8 |
| LXL04_001748 | PF00043.31 | GST_C | 371 | 446 | 1.2e-16 | 61.4 |
| LXL04_001748 | PF13410.12 | GST_C_2 | 375 | 443 | 1.7e-23 | 83.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。