TkA01G516120 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G516120

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 129375135-129375737 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

513 bp · TkA01G516120|TK1151|cDNA

GATGAAGGAAAGGCGGTGCTTAAAAGGATAAGAGGAACTGAGAACGTTGAACCAGAGTATTTAGAGCTTGTTGAAGCTAGTCGTATTGCTAAAGAAGTTAAACATCCTTTCCGCAACCTTCTTCAACGCAAGAACCGCCCTCCCCTCATTATCTCTATCGCCTTACAGTTCTTCCAACAATTCACCGGAATCAACGCGATTATGTTCTACGCGCCGGTGCTATTTAGTACCCTAGGGTTTAAAAACGACGCCTCGCTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

513 bp · TkA01G516120|TK1151|CDS

GATGAAGGAAAGGCGGTGCTTAAAAGGATAAGAGGAACTGAGAACGTTGAACCAGAGTATTTAGAGCTTGTTGAAGCTAGTCGTATTGCTAAAGAAGTTAAACATCCTTTCCGCAACCTTCTTCAACGCAAGAACCGCCCTCCCCTCATTATCTCTATCGCCTTACAGTTCTTCCAACAATTCACCGGAATCAACGCGATTATGTTCTACGCGCCGGTGCTATTTAGTACCCTAGGGTTTAAAAACGACGCCTCGCTTTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

170 aa · TkA01G516120|TK1151|PROTEIN

DEGKAVLKRIRGTENVEPEYLELVEASRIAKEVKHPFRNLLQRKNRPPLIISIALQFFQQFTGINAIMFYAPVLFSTLGFKNDASLYSTVITGAVNVVSTIVSIYSVDKLGRQFLLLEVGVQMFFAQVIIAIILGIKVTDTSDNLSTGFAVLVVIMVCTFISAFAWSWGH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G516120`
TK1151 ID	TkA01G516120
OH-1004 ID	LXL04_001233
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	95.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.412 / OH-1004 32.500 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G516120

位置 Chr01:129375135-129375737 (+)

描述 Similar to STP13: Sugar transport protein 13

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g26340`	可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。	暂无已核实直接文献
`At4g02050`	可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0218400`	介导通过糖:质子共转运的果糖主动摄取（可能）。	Molecular cloning and expression analysis of a monosaccharide transporter gene OsMST4 from rice (Oryza sativa L.).2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9228-x

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001233 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0015749 monosaccharide transmembrane transport 生物过程

GO:0042882 L-arabinose transmembrane transport 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0012505 endomembrane system 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0090406 pollen tube 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G02050

ath:AT5G26340

dosa:Os03g0218400

dosa:Os07g0106200

osa:4332079

rcu:8275367

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.737

排名 1 · TkA01G516120 · TK1151

细胞质0.117

排名 2 · TkA01G516120 · TK1151

内质网0.067

排名 3 · TkA01G516120 · TK1151

溶酶体／液泡0.067

排名 4 · TkA01G516120 · TK1151

线粒体0.053

排名 5 · TkA01G516120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00083Sugar_tr2-169 aa

PF11998DUF349327-40 aa

PF11998DUF349364-104 aa

PF00662Proton_antipo_N86-107 aa

PF11998DUF3493120-158 aa

PF00662Proton_antipo_N142-166 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G516120	`PF00083`	Sugar_tr	2	169	2.1e-39	136.4
TkA01G516120	`PF11998`	DUF3493	27	40	7.3	7.6
TkA01G516120	`PF11998`	DUF3493	64	104	7.3	7.6
TkA01G516120	`PF00662`	Proton_antipo_N	86	107	0.91	10.2
TkA01G516120	`PF11998`	DUF3493	120	158	7.3	7.6
TkA01G516120	`PF00662`	Proton_antipo_N	142	166	0.91	10.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q94AZ2`	拟南芥	sp\|Q94AZ2\|STP13_ARATH Sugar transport protein 13	79.300%	Swiss-Prot	高置信
`O04249`	拟南芥	sp\|O04249\|STP7_ARATH Sugar transport protein 7	53.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q10PW9`	水稻	sp\|Q10PW9\|MST4_ORYSJ Sugar transport protein MST4	75.700%	Swiss-Prot	高置信

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