ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 44 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G076430
Chr04:20095413-20097956 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036093
Chr08:35538375-35542661 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 80.749 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076430 |
|
TkA04G076450
Chr04:20099892-20103152 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036092
Chr08:35535337-35539631 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
57.100 查询 100.000 / 对象 98.893 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076450 |
|
TkA04G076570
Chr04:20142069-20143517 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036090
Chr08:35513466-35514537 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.600 查询 85.494 / 对象 96.853 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076570 |
|
TkA04G076600
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036088
Chr08:35506823-35509834 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 75.926 / 对象 42.123 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076600 |
|
TkA04G076800
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036085
Chr08:35466003-35467134 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA04G076810
Chr04:20222539-20225678 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036084
Chr08:35460902-35464137 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
91.600 查询 99.432 / 对象 97.449 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076810 |
|
TkA04G076840
Chr04:20234801-20238171 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036087
Chr08:35495370-35496914 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 92.683 / 对象 46.914 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076840 |
|
TkA04G076910
Chr04:20268168-20268665 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036091
Chr08:35522837-35527085 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 90.909 / 对象 26.596 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G076910 |
|
TkA04G077160
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_036083
Chr08:35446282-35448354 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 44.638 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G077160 |
|
TkA04G077200
Chr04:20336752-20337240 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_016173
Chr03:113342709-113344592 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.600 查询 98.148 / 对象 42.175 |
TkA04G077200 | |
|
TkA04G077370
Chr04:20377274-20377657 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036080
Chr08:35332895-35334565 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 64.796 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G077370 |
|
TkA04G077900
Chr04:20479882-20480751 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036079
Chr08:35240734-35242044 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 66.284 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G077900 |
|
TkA04G078390
Chr04:20584150-20586051 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_006094
Chr02:1638876-1642575 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 96.894 / 对象 29.213 |
TkA04G078390 | |
|
TkA04G079060
Chr04:20728065-20730008 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036055
Chr08:34768152-34769770 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 95.116 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G079060 |
|
TkA04G079100
Chr04:20737829-20739773 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036056
Chr08:34782772-34784717 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G079100 |
|
TkA04G079570
Chr04:20885535-20886668 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036061
Chr08:34895987-34896858 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G079570 |
|
TkA04G079890
Chr04:20953431-20960288 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036066
Chr08:34969782-34976331 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.100 查询 100.000 / 对象 35.478 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G079890 |
|
TkA04G080050
Chr04:20995733-20996392 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_012200
Chr03:8202645-8204384 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 100.000 / 对象 45.276 |
TkA04G080050 | |
|
TkA04G080980
Chr04:21260311-21261444 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036061
Chr08:34895987-34896858 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G080980 |
|
TkA04G081200
Chr04:21304206-21307773 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036058
Chr08:34828158-34831786 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 89.272 / 对象 45.155 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G081200 |
|
TkA04G081210
Chr04:21311920-21317416 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036057
Chr08:34819551-34823022 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.312 / 对象 29.672 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G081210 |
|
TkA04G081370
Chr04:21367899-21369764 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036055
Chr08:34768152-34769770 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 95.116 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G081370 |
|
TkA04G081960
Chr04:21484321-21501900 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036046
Chr08:34634121-34646967 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.400 查询 50.000 / 对象 44.711 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G081960 |
|
TkA04G082000
Chr04:21510873-21512340 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036045
Chr08:34628743-34630206 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G082000 |
|
TkA04G082290
Chr04:21559078-21569058 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036041
Chr08:34575956-34582965 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
79.800 查询 99.465 / 对象 34.608 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G082290 |
|
TkA04G082480
Chr04:21611163-21611468 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_027338
Chr06:13791350-13797472 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
86.400 查询 43.564 / 对象 43.137 |
TkA04G082480 | |
|
TkA04G082550
Chr04:21630972-21631658 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036036
Chr08:34517633-34518319 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
82.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G082550 |
|
TkA04G083030
Chr04:21721627-21722266 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_020555
Chr04:89738602-89743338 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.600 查询 95.455 / 对象 27.317 |
TkA04G083030 | |
|
TkA04G083110
Chr04:21750802-21751880 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036032
Chr08:34395619-34396700 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G083110 |
|
TkA04G083190
Chr04:21774178-21776479 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036030
Chr08:34378051-34379939 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 95.539 / 对象 55.870 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G083190 |
|
TkA04G083420
Chr04:21861318-21861707 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036024
Chr08:34253674-34261499 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 86.822 / 对象 12.161 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G083420 |
|
TkA04G083820
Chr04:21949827-21959839 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036024
Chr08:34253674-34261499 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 93.797 / 对象 41.042 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G083820 |
|
TkA04G083950
Chr04:22000217-22002379 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036021
Chr08:34227899-34230061 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G083950 |
|
TkA04G084230
Chr04:22073934-22074779 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036016
Chr08:34155010-34156527 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 100.000 / 对象 55.644 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084230 |
|
TkA04G084250
Chr04:22076704-22077611 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036015
Chr08:34152837-34154033 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 100.000 / 对象 42.714 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084250 |
|
TkA04G084480
Chr04:22121705-22129104 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036010
Chr08:34094084-34103142 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 92.188 / 对象 41.785 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084480 |
|
TkA04G084570
Chr04:22171398-22171829 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036012
Chr08:34131456-34143672 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.400 查询 67.832 / 对象 42.731 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084570 |
|
TkA04G084590
Chr04:22180988-22183514 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036008
Chr08:34039583-34041741 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084590 |
|
TkA04G084640
Chr04:22201495-22212131 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036005
Chr08:34005981-34021161 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 93.558 / 对象 37.286 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084640 |
|
TkA04G084650
Chr04:22215549-22216601 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036005
Chr08:34005981-34021161 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 21.394 |
JCVI_TKOH_00190 | TkA04G084650 |
|
TkA04G086020
Chr04:22510758-22512679 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036000
Chr08:33755554-33757475 (-)
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99.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104805.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.200 查询 99.650 / 对象 97.487 |
TkA04G087240 | |
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CM104806.1
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100.000 查询 100.000 / 对象 36.526 |
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CM104800.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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TkA04G089390 | |
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72.300 查询 98.361 / 对象 35.818 |
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CM104806.1
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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CM104806.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA04G110610
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CM104807.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.100 查询 39.773 / 对象 54.918 |
TkA04G110610 | |
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TkA04G111460
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CM104806.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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TkA04G111490 | |
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CM104806.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.000 查询 73.529 / 对象 59.289 |
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CM104806.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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99.500 查询 100.000 / 对象 63.366 |
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90.200 查询 99.351 / 对象 49.837 |
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95.700 查询 98.893 / 对象 61.136 |
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96.500 查询 86.667 / 对象 27.135 |
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TkA04G114510
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CM104805.1
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99.100 查询 100.000 / 对象 33.971 |
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TkA04G114530
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CM104804.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 99.275 / 对象 21.142 |
TkA04G114530 | |
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TkA04G114670
Chr04:29772318-29777391 (-)
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Chr08:27411230-27419921 (+)
CM104806.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 91.315 / 对象 34.659 |
JCVI_TKOH_00191 | TkA04G114670 |