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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G076430
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 20095413-20097956 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2171 bp · TkA04G076430|TK1151|cDNA

CCTGTATTCATTCCACCCACCCTACCTCACAAAGACACAAACATCTCGCCACTATATATACTCTTCAATTCTATTTCCATTTCCATCACACCCAATTAAAAGCAAAAGTTGCAATCAGATATGGATACTAAGATTGGAAATATAGATGTTGTTACCAGTGCCAATGGCAATGTCGGTTGTCCTCCCAAAACCGGCGGTGTTAGTTGCGTACAGTCCTCCTCCGTACCATTCAAGTCCGCAGAGGCCACACTCGGCCGCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1815 bp · TkA04G076430|TK1151|CDS

ATGGATACTAAGATTGGAAATATAGATGTTGTTACCAGTGCCAATGGCAATGTCGGTTGTCCTCCCAAAACCGGCGGTGTTAGTTGCGTACAGTCCTCCTCCGTACCATTCAAGTCCGCAGAGGCCACACTCGGCCGCCACCTTGCTCGCCGCCTCGTCCAGATTGGTGTCTCCGACGTATTTTCTGTTCCCGGAGACTTCAACCTAACTCTGCTTGATCATCTCATCGCTGAGCCCGGACTCAATCTCGTTGGATGCTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

604 aa · TkA04G076430|TK1151|PROTEIN

MDTKIGNIDVVTSANGNVGCPPKTGGVSCVQSSSVPFKSAEATLGRHLARRLVQIGVSDVFSVPGDFNLTLLDHLIAEPGLNLVGCCNELNAGYAADGYARSRGVGACVVTFTVGGLSVLNAIAGAFSENLPIICIVGGPNSNDYGTNRILHHTIGLPDFSQELRCFQTVTCYQAVVNNLEDAHELIDTAISTALKESKPVYISVGCNLPAIPHPTFSREPVPFSLSPKLSNQMGLQAAVEAAAEFLNKAVKPVMVGGPK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G076430
TK1151 IDTkA04G076430
OH-1004 IDLXL04_036093
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 80.749
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G076430
位置Chr04:20095413-20097956 (+)
描述Similar to PDC1: Pyruvate decarboxylase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33070 可能在缺氧时的乙醇发酵中发挥作用。
The pyruvate decarboxylase1 gene of Arabidopsis is required during anoxia but not other environmental stresses.2003 · DOI: 10.1104/pp.102.016907
At5g54960 丙酮酸脱羧酶 2。 暂无已核实直接文献
At5g01320 丙酮酸脱羧酶4。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XFI3 丙酮酸脱羧酶 2。 暂无已核实直接文献
Os03g0293500 丙酮酸脱羧酶 2。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2Y5L9 丙酮酸脱羧酶1。 暂无已核实直接文献
Os05g0469600 丙酮酸脱羧酶1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036093 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000949 aromatic amino acid family catabolic process to alcohol via Ehrlich pathway 生物过程
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0034059 response to anoxia 生物过程
GO:0036293 response to decreased oxygen levels 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0090548 response to nitrate starvation 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33070
ath:AT5G01320
ath:AT5G54960
dosa:Os03g0293500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.726
排名 1 · TkA04G076430 · TK1151
细胞核0.350
排名 2 · TkA04G076430 · TK1151
线粒体0.076
排名 3 · TkA04G076430 · TK1151
细胞膜0.064
排名 4 · TkA04G076430 · TK1151
内质网0.054
排名 5 · TkA04G076430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02776TPP_enzyme_N43-148 aa
PF02775TPP_enzyme_C121-205 aa
PF02552CO_dh233-269 aa
PF00205TPP_enzyme_M240-357 aa
PF02775TPP_enzyme_C450-574 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G076430PF02776TPP_enzyme_N431483.2e-29101.8
TkA04G076430PF02775TPP_enzyme_C1212051.5e-1454.7
TkA04G076430PF02552CO_dh2332690.2811.7
TkA04G076430PF00205TPP_enzyme_M2403571.9e-2280.1
TkA04G076430PF02775TPP_enzyme_C4505741.5e-1454.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O82647拟南芥sp|O82647|PDC1_ARATH Pyruvate decarboxylase 182.500%Swiss-Prot高置信
Q9FFT4拟南芥sp|Q9FFT4|PDC2_ARATH Pyruvate decarboxylase 281.100%Swiss-Prot高置信
Q9M040拟南芥sp|Q9M040|PDC4_ARATH Pyruvate decarboxylase 481.100%Swiss-Prot高置信
A2XFI3水稻sp|A2XFI3|PDC2_ORYSI Pyruvate decarboxylase 279.900%Swiss-Prot高置信
Q10MW3水稻sp|Q10MW3|PDC2_ORYSJ Pyruvate decarboxylase 279.700%Swiss-Prot高置信
A2Y5L9水稻sp|A2Y5L9|PDC1_ORYSI Pyruvate decarboxylase 188.600%Swiss-Prot高置信
Q0DHF6水稻sp|Q0DHF6|PDC1_ORYSJ Pyruvate decarboxylase 188.600%Swiss-Prot高置信

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