ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 11 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA01G532700
Chr01:133721944-133723608 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001472
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CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 37.066 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G532700 |
|
TkA01G532730
Chr01:133730182-133732640 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001472
Chr01:27384508-27389639 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 99.821 / 对象 62.486 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G532730 |
|
TkA01G533010
Chr01:133787279-133789047 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_017256
Chr03:144407820-144411075 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
68.600 查询 97.995 / 对象 41.309 |
TkA01G533010 | |
|
TkA01G533040
Chr01:133794761-133797323 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001470
Chr01:27346526-27349001 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 29.949 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G533040 |
|
TkA01G533120
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_030169
Chr06:109910937-109913531 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 86.316 / 对象 33.131 |
TkA01G533120 | |
|
TkA01G533400
Chr01:133882798-133884100 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001467
Chr01:27275115-27276081 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G533400 |
|
TkA01G533800
Chr01:133962493-133964656 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001461
Chr01:27199571-27201210 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G533800 |
|
TkA01G533870
Chr01:133989363-133991622 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001460
Chr01:27172683-27174322 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G533870 |
|
TkA01G533910
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_004147
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CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
76.100 查询 23.000 / 对象 22.549 |
TkA01G533910 | |
|
TkA01G534000
Chr01:134027184-134030347 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001451
Chr01:27111534-27115049 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.200 查询 26.362 / 对象 18.492 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G534000 |
|
TkA01G534320
Chr01:134096342-134106503 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001448
Chr01:27075069-27085311 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 98.242 / 对象 46.298 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G534320 |
|
TkA01G535390
Chr01:134356229-134357649 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001438
Chr01:26777774-26779698 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 92.444 / 对象 52.261 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G535390 |
|
TkA01G535480
Chr01:134377614-134378023 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_012533
Chr03:14107178-14115626 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
50.700 查询 88.393 / 对象 50.883 |
TkA01G535480 | |
|
TkA01G535520
Chr01:134392147-134394482 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001436
Chr01:26752384-26754375 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 57.524 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G535520 |
|
TkA01G535530
Chr01:134397273-134397751 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001435
Chr01:26748937-26751552 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.100 查询 95.935 / 对象 57.949 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G535530 |
|
TkA01G536620
Chr01:134618270-134624888 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001432
Chr01:26516143-26522773 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G536620 |
|
TkA01G536910
Chr01:134677364-134677915 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001430
Chr01:26458627-26463505 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 63.986 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G536910 |
|
TkA01G537950
Chr01:134904356-134905232 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_029921
Chr06:103402728-103406548 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.200 查询 100.000 / 对象 18.887 |
TkA01G537950 | |
|
TkA01G539060
Chr01:135161678-135166149 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_035874
Chr08:31088103-31092800 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 97.974 / 对象 50.427 |
TkA01G539060 | |
|
TkA01G539190
Chr01:135188706-135190346 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001420
Chr01:25948441-25949188 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G539190 |
|
TkA01G539230
Chr01:135193289-135193782 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001418
Chr01:25944865-25945357 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G539230 |
|
TkA01G539690
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_002434
Chr01:48660874-48667850 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.700 查询 35.766 / 对象 13.243 |
TkA01G539690 | |
|
TkA01G539880
Chr01:135387464-135387920 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_020760
Chr04:108055299-108056016 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 100.000 / 对象 90.667 |
TkA01G539880 | |
|
TkA01G539910
Chr01:135392994-135398228 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001402
Chr01:25703936-25708035 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.800 查询 99.400 / 对象 53.098 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G539910 |
|
TkA01G539920
Chr01:135399971-135400417 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001401
Chr01:25698436-25701561 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 93.243 / 对象 45.545 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G539920 |
|
TkA01G540100
Chr01:135454438-135456998 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001399
Chr01:25642331-25644633 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.100 查询 96.476 / 对象 48.684 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G540100 |
|
TkA01G540190
Chr01:135466792-135469892 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_002159
Chr01:42935859-42937903 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 43.379 / 对象 87.963 |
TkA01G540190 | |
|
TkA01G540720
Chr01:135606285-135616605 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001392
Chr01:25502021-25502659 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G540720 |
|
TkA01G541550
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GWHBCHF00000002
|
LXL04_001384
Chr01:25290823-25291926 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.000 查询 95.513 / 对象 40.599 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G541550 |
|
TkA01G541570
Chr01:135858449-135858876 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001383
Chr01:25289037-25289570 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.700 查询 73.077 / 对象 64.407 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G541570 |
|
TkA01G541640
Chr01:135875223-135875670 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_004710
Chr01:144304255-144306356 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.000 查询 100.000 / 对象 37.269 |
TkA01G541640 | |
|
TkA01G542400
Chr01:136072776-136073745 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001369
Chr01:25056901-25057350 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G542400 |
|
TkA01G542650
Chr01:136161282-136168108 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001364
Chr01:24930206-24946674 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 48.837 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G542650 |
|
TkA01G542800
Chr01:136202798-136203719 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001360
Chr01:24893673-24894595 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.600 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G542800 |
|
TkA01G542860
Chr01:136219452-136220322 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001359
Chr01:24875274-24878118 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 93.491 / 对象 31.102 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G542860 |
|
TkA01G542870
Chr01:136220966-136222426 (+)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001359
Chr01:24875274-24878118 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 60.236 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G542870 |
|
TkA01G544420
Chr01:136573410-136579357 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001352
Chr01:24567038-24572281 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 95.753 / 对象 22.262 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G544420 |
|
TkA01G544890
Chr01:136713400-136716065 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001345
Chr01:24509921-24512283 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G544890 |
|
TkA01G546020
Chr01:137088594-137091178 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_001339
Chr01:24434881-24436011 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G546020 |
|
TkA01G546120
Chr01:137126144-137126551 (-)
GWHBCHF00000002
|
LXL04_014920
Chr03:59623265-59624968 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 100.000 / 对象 23.810 |
TkA01G546120 | |
|
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.300 查询 100.000 / 对象 95.833 |
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LXL04_001166
Chr01:21362080-21362825 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.600 查询 97.059 / 对象 67.010 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G556980 |
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TkA01G557470
Chr01:140184091-140188175 (+)
GWHBCHF00000002
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LXL04_001159
Chr01:21215580-21219325 (-)
CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 89.323 / 对象 40.471 |
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TkA01G557490
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LXL04_001156
Chr01:21195304-21197025 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.200 查询 93.311 / 对象 68.668 |
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TkA01G557650
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LXL04_019929
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.800 查询 43.363 / 对象 28.324 |
TkA01G557650 | |
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TkA01G557670
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LXL04_001154
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CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA01G557690
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 92.989 / 对象 80.769 |
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TkA01G557810
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CM104799.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.800 查询 94.158 / 对象 63.646 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G557810 |
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TkA01G558150
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CM104800.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.000 查询 69.360 / 对象 38.139 |
TkA01G558150 | |
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TkA01G558330
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CM104805.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 100.000 / 对象 88.937 |
TkA01G558330 | |
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TkA01G558430
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CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.000 查询 100.000 / 对象 36.439 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G558430 |
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TkA01G558600
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CM104799.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 100.000 / 对象 58.230 |
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91.900 查询 98.852 / 对象 88.727 |
TkA01G559080 | |
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TkA01G559180
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 57.714 / 对象 99.020 |
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CM104804.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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TkA01G559560 | |
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TkA01G559810
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CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.100 查询 94.388 / 对象 86.742 |
TkA01G559810 | |
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TkA01G559860
Chr01:140831664-140832089 (-)
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LXL04_001111
Chr01:20530664-20534685 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 97.872 / 对象 47.902 |
JCVI_TKOH_00036 | TkA01G559860 |