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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G535530
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 134397273-134397751 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

372 bp · TkA01G535530|TK1151|cDNA

TCTAGATCCGCCAACAACGAATTATTTAGTCCAGAACATGATGAAGAAGGAGGATGGGGCACCAAAATTAAGGAGTATGATCAGTCCGGTGTCGTGCAGAAAAGGGGGAGTCTAGCCTACTTGACGTGGGAGGAGCTTGGAGTAGCTTCGTTAGGGAAAGATGGAGGTAAATCCTTGCTTACTGGTGTCTCTGGTTATGCTAAACCGGGAGAGATGGTGACCATTATGGGTCCTTCTGGGTGTGGAAAATCCACGCTCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

372 bp · TkA01G535530|TK1151|CDS

TCTAGATCCGCCAACAACGAATTATTTAGTCCAGAACATGATGAAGAAGGAGGATGGGGCACCAAAATTAAGGAGTATGATCAGTCCGGTGTCGTGCAGAAAAGGGGGAGTCTAGCCTACTTGACGTGGGAGGAGCTTGGAGTAGCTTCGTTAGGGAAAGATGGAGGTAAATCCTTGCTTACTGGTGTCTCTGGTTATGCTAAACCGGGAGAGATGGTGACCATTATGGGTCCTTCTGGGTGTGGAAAATCCACGCTCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

123 aa · TkA01G535530|TK1151|PROTEIN

SRSANNELFSPEHDEEGGWGTKIKEYDQSGVVQKRGSLAYLTWEELGVASLGKDGGKSLLTGVSGYAKPGEMVTIMGPSGCGKSTLLDSLAGWLASNTRHTGRVLINGRKQRLTYGTLVWKQY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G535530
TK1151 IDTkA01G535530
OH-1004 IDLXL04_001435
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)94.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.935 / OH-1004 57.949
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G535530
位置Chr01:134397273-134397751 (+)
描述Similar to ABCG12: ABC transporter G family member 12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g55100 ABC转运蛋白G家族成员17。 暂无已核实直接文献
At5g13580 ABC 转运蛋白 G 家族成员 6。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8ALI0 在非生物胁迫下对生长和发育必不可少的转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os03g0281900 在非生物胁迫下对生长和发育必不可少的转运蛋白。
Rice shoot branching requires an ATP-binding cassette subfamily G protein.2009 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2008.02724.x
Genome-wide analysis and expression profiling of half-size ABC protein subgroup G in rice in response to abiotic stress and phytohormone treatments.2012 · DOI: 10.1007/s00438-012-0719-3
Rice RCN1/OsABCG5 mutation alters accumulation of essential and nonessential minerals and causes a high Na/K ratio, resulting in a salt-sensitive phenotype.2014 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2014.04.011
RCN1/OsABCG5, an ATP-binding cassette (ABC) transporter, is required for hypodermal suberization of roots in rice (Oryza sativa).2014 · DOI: 10.1111/tpj.12614
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001435 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程
GO:0010222 stem vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010597 green leaf volatile biosynthetic process 生物过程
GO:0015908 fatty acid transport 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17840
ath:AT1G51460
ath:AT1G51500
ath:AT3G21090
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.442
排名 1 · TkA01G535530 · TK1151
细胞质0.166
排名 2 · TkA01G535530 · TK1151
细胞核0.135
排名 3 · TkA01G535530 · TK1151
质体0.127
排名 4 · TkA01G535530 · TK1151
内质网0.097
排名 5 · TkA01G535530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00485PRK8-35 aa
PF13555AAA_2953-65 aa
PF03308MeaB56-98 aa
PF00005ABC_tran60-110 aa
PF09818ABC_ATPase63-106 aa
PF13481AAA_2564-95 aa
PF00437T2SSE67-100 aa
PF14516AAA_3567-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G535530PF00485PRK8350.1712.4
TkA01G535530PF13555AAA_2953651.2e-0525.7
TkA01G535530PF03308MeaB56980.2311.2
TkA01G535530PF00005ABC_tran601101.6e-0939.2
TkA01G535530PF09818ABC_ATPase631060.4510.2
TkA01G535530PF13481AAA_2564950.005317.1
TkA01G535530PF00437T2SSE671000.0214.2
TkA01G535530PF14516AAA_3567920.2810.7
TkA01G535530PF13191AAA_16681020.001519.8
TkA01G535530PF03215Rad1769970.002718.4
TkA01G535530PF25199nSTAND_NTPase5691100.004317.6
TkA01G535530PF01637ATPase_269910.03914.5
TkA01G535530PF03193RsgA_GTPase701090.0001322.5
TkA01G535530PF00931NB-ARC70890.05813.7
TkA01G535530PF13245AAA_19701000.2512.2
TkA01G535530PF00006ATP-synt_ab70940.3911.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2V6拟南芥sp|Q9M2V6|AB17G_ARATH ABC transporter G family member 1751.900%Swiss-Prot低置信
Q9FNB5拟南芥sp|Q9FNB5|AB6G_ARATH ABC transporter G family member 646.200%Swiss-Prot低置信
B8ALI0水稻sp|B8ALI0|AB5G_ORYSI ABC transporter G family member 550.000%Swiss-Prot低置信
Q8H8V7水稻sp|Q8H8V7|AB5G_ORYSJ ABC transporter G family member 550.000%Swiss-Prot低置信

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