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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G243680
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 63666189-63668117 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1595 bp · TkA08G243680|TK1151|cDNA

CAAATGACGACTACCCGTAGACGGTAAAGAGTCAACTGTCATCGTCTTCTTGTAAGAGACTCCAATTTAGGGGTTTTCCAAAATCTTAAGCCGGTACGTCCGAAGATCCCCCAAAATGGAAGCAAATCAGGCGGCATCCGGTGGCGGAAGTGGAGGAGGCGGAGGAGGACCAGCTCCCTTTCTTCTCAAGACGTACGATATGGTTGATGACTCCATGACTGACGAAATAGTGTCGTGGAGCACAAACAGAAACAGTTTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1281 bp · TkA08G243680|TK1151|CDS

ATGGAAGCAAATCAGGCGGCATCCGGTGGCGGAAGTGGAGGAGGCGGAGGAGGACCAGCTCCCTTTCTTCTCAAGACGTACGATATGGTTGATGACTCCATGACTGACGAAATAGTGTCGTGGAGCACAAACAGAAACAGTTTCGTCGTGTGGAACCCTCCTGAATTTGCTCGCCTCTTGTTACCTACCTATTTTAAGCACAACAATTTTTCCAGCTTCATTAGACAGCTCAATACCTATGGTTTCAGAAAGATCGATCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

426 aa · TkA08G243680|TK1151|PROTEIN

MEANQAASGGGSGGGGGGPAPFLLKTYDMVDDSMTDEIVSWSTNRNSFVVWNPPEFARLLLPTYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKIDPERWEFANEEFVKDQKHLLKNIHRRKPIHSHSTNPQASAIDPERAAFEEEIDKLTREKASLEKNISRFKQQQPVSKLQLEDLTHRVNTIEERQDTLLSFLKKAAQNPDFVEHLAQKLESMDLSADNKKRRFFPDDNNNNNNNSLPQSPPRPDFGNIFHRDFSNKLRLELSPAVS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G243680
TK1151 IDTkA08G243680
OH-1004 IDLXL04_033245
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)94.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 38.975
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G243680
位置Chr08:63666189-63668117 (+)
描述Similar to PCMP-H13: Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g13980 特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 暂无已核实直接文献
At4g17750 特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 暂无已核实直接文献
At4g18880 特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0496100 转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 暂无已核实直接文献
Os01g0749300 转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033245 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:0016554 cytidine to uridine editing 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G25360
ath:AT2G22070
ath:AT4G14050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.845
排名 1 · TkA08G243680 · TK1151
细胞质0.274
排名 2 · TkA08G243680 · TK1151
线粒体0.027
排名 3 · TkA08G243680 · TK1151
细胞膜0.025
排名 4 · TkA08G243680 · TK1151
内质网0.016
排名 5 · TkA08G243680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00447HSF_DNA-bind22-111 aa
PF24525TTC393-207 aa
PF28019HmpF96-208 aa
PF27575Map3k7cl96-158 aa
PF17675APG6_N119-157 aa
PF11932DUF3450119-189 aa
PF26095CC_Bre1119-180 aa
PF04977DivIC124-156 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G243680PF00447HSF_DNA-bind221113.1e-29102.2
TkA08G243680PF24525TTC3932070.05513.6
TkA08G243680PF28019HmpF962080.03813.2
TkA08G243680PF27575Map3k7cl961580.7610.9
TkA08G243680PF17675APG6_N1191570.01716.2
TkA08G243680PF11932DUF34501191890.03114.3
TkA08G243680PF26095CC_Bre11191800.1113.5
TkA08G243680PF04977DivIC1241560.00119.5
TkA08G243680PF12325TMF_TATA_bd1271870.009916.7
TkA08G243680PF27720SSNA11271920.1413.0
TkA08G243680PF29997SPC25_N1281840.05214.6
TkA08G243680PF25078DUF78011301770.02615.4
TkA08G243680PF16326ABC_tran_CTD1311810.4711.4
TkA08G243680PF17675APG6_N1332250.01716.2
TkA08G243680PF29310ZK6521352070.01216.3
TkA08G243680PF04977DivIC1622010.00119.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94BZ5拟南芥sp|Q94BZ5|HSFA5_ARATH Heat stress transcription factor A-551.900%Swiss-Prot高置信
P41151拟南芥sp|P41151|HFA1A_ARATH Heat stress transcription factor A-1a51.200%Swiss-Prot低置信
O49403拟南芥sp|O49403|HFA4A_ARATH Heat stress transcription factor A-4a53.800%Swiss-Prot低置信
Q6K6S5水稻sp|Q6K6S5|HSFA5_ORYSJ Heat stress transcription factor A-547.200%Swiss-Prot中等置信
Q94J16水稻sp|Q94J16|HFA4B_ORYSJ Heat stress transcription factor A-4b36.000%Swiss-Prot中等置信

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