基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G243680 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:63666189-63668117 (+) |
| 描述 | Similar to PCMP-H13: Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_033245 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g13980 |
特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g17750 |
特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g18880 |
特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0496100 |
转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0749300 |
转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009451 | RNA modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.461; 覆盖度=58.371; E 值=2.44e-144; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016554 | cytidine to uridine editing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G25360 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.981; 覆盖度=57.091; E 值=1.13e-142 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G22070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.461; 覆盖度=58.371; E 值=2.44e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.484; 覆盖度=55.535; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |