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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G026350
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 6783799-6788149 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3406 bp · TkA08G026350|TK1151|cDNA

ATTAGGTACATGACTGACACCTCCAATCTAAACCGAAAACAACAACCTTCGATCCTTCATTCTTTCCATTAAAAGGAAACCCATCACCTCCCTCCACTCCCACTTCCACTTCCACCACCGCCACCGCCACCACCATGCAAGCCAGCGCCGGCCTAGTCGCCGGATCTCACAACCGGAACGAGCTCGTTGTCATCCATGGCCACGAAGAACACAAGCCTTTGAAGGATTTGACCGGTCAAGTTTGTGAGATATGTGGGGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3123 bp · TkA08G026350|TK1151|CDS

ATGCAAGCCAGCGCCGGCCTAGTCGCCGGATCTCACAACCGGAACGAGCTCGTTGTCATCCATGGCCACGAAGAACACAAGCCTTTGAAGGATTTGACCGGTCAAGTTTGTGAGATATGTGGGGACGAGATCGGCGTCACAGTTGCCGGAGATTTGTTTGTAGCATGTAACGAATGTGGTTTTCCGGTCTGCCGGCCATGCTACGAGTACGAGAGACGAGAAGGTAGCCAGAACTGCCCTCAATGCAAAACCCGATACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1040 aa · TkA08G026350|TK1151|PROTEIN

MQASAGLVAGSHNRNELVVIHGHEEHKPLKDLTGQVCEICGDEIGVTVAGDLFVACNECGFPVCRPCYEYERREGSQNCPQCKTRYKRLKGSPRVEGDDDEEDVDDIEHEFNIDDDQNKNKNIAEAMLQGKMSYGRGPEDDENAQYPPVIAGRSRPVSGEFPISSQPHGEQMLSSLHKRVHPYSAHENGSGRWDEKRDGGWKERMDDWKMQQGNLGAEVDDSVDPDMAMLDEARQPLSRKVPIASSKINPYRMVIVARLF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G026350
TK1151 IDTkA08G026350
OH-1004 IDLXL04_010844
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)70.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.308 / OH-1004 97.541
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G026350
位置Chr08:6783799-6788149 (-)
描述Similar to CESA3: Cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g17420 纤维素合酶末端复合物的催化亚基，是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。
Multiple cellulose synthase catalytic subunits are required for cellulose synthesis in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.12.2529
Structure of cellulose-deficient secondary cell walls from the irx3 mutant of Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1016/s0031-9422(02)00199-1
Impairment of cellulose synthases required for Arabidopsis secondary cell wall formation enhances disease resistance.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048058

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Z1C8 纤维素合酶末端复合物（“花簇”）的催化亚基，参与β-1,4-葡聚糖微纤维的结晶，是细胞壁形成的主要机制（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
Os09g0422500 纤维素合酶末端复合物（“花簇”）的催化亚基，参与β-1,4-葡聚糖微纤维的结晶，是细胞壁形成的主要机制（通过相似性推测）。
Three distinct rice cellulose synthase catalytic subunit genes required for cellulose synthesis in the secondary wall.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.022442
UniProt: A2XNT2 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
Os03g0837100 可能的纤维素合酶终端复合体（‘花状体’）的催化亚基，参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶，这是细胞壁形成的主要机制。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010844 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G05170
dosa:Os03g0808100
dosa:Os05g0176100
dosa:Os07g0208500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.564
排名 1 · TkA08G026350 · TK1151
内质网0.194
排名 2 · TkA08G026350 · TK1151
高尔基体0.176
排名 3 · TkA08G026350 · TK1151
细胞质0.134
排名 4 · TkA08G026350 · TK1151
溶酶体／液泡0.085
排名 5 · TkA08G026350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14569zf-UDP27-104 aa
PF02318FYVE_231-85 aa
PF26235zf-KKT2_KKT331-69 aa
PF14446Prok-RING_133-71 aa
PF14570zf-RING_437-87 aa
PF05290Baculo_IE-137-89 aa
PF00097zf-C3HC437-82 aa
PF14446Prok-RING_179-88 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G026350PF14569zf-UDP271046e-42142.3
TkA08G026350PF02318FYVE_231850.05114.5
TkA08G026350PF26235zf-KKT2_KKT331690.07313.9
TkA08G026350PF14446Prok-RING_133710.01316.3
TkA08G026350PF14570zf-RING_437872.1e-0524.9
TkA08G026350PF05290Baculo_IE-137890.08213.6
TkA08G026350PF00097zf-C3HC437820.3711.4
TkA08G026350PF14446Prok-RING_179880.01316.3
TkA08G026350PF15713PTPRCAP961780.1813.0
TkA08G026350PF03552Cellulose_synt33110341345.0
TkA08G026350PF13632Glyco_trans_2_35586181.7e-0628.7
TkA08G026350PF13632Glyco_trans_2_36818351.7e-0628.7
TkA08G026350PF13632Glyco_trans_2_396710131.7e-0628.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SWW6拟南芥sp|Q9SWW6|CESA7_ARATH Cellulose synthase A catalytic subunit 7 [UDP-forming]84.100%Swiss-Prot高置信
A2Z1C8水稻sp|A2Z1C8|CESA9_ORYSI Cellulose synthase A catalytic subunit 9 [UDP-forming]82.300%Swiss-Prot高置信
Q69P51水稻sp|Q69P51|CESA9_ORYSJ Cellulose synthase A catalytic subunit 9 [UDP-forming]82.300%Swiss-Prot高置信
A2XNT2水稻sp|A2XNT2|CESA5_ORYSI Probable cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]68.000%Swiss-Prot高置信
Q851L8水稻sp|Q851L8|CESA5_ORYSJ Probable cellulose synthase A catalytic subunit 5 [UDP-forming]68.000%Swiss-Prot高置信

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