基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G026350 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:6783799-6788149 (-) |
| 描述 | Similar to CESA3: Cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming] (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010844 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g17420 |
纤维素合酶末端复合物的催化亚基,是 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶所需的。 |
Multiple cellulose synthase catalytic subunits are required for cellulose synthesis in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.12.2529
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2Z1C8 |
纤维素合酶末端复合物(“花簇”)的催化亚基,参与β-1,4-葡聚糖微纤维的结晶,是细胞壁形成的主要机制(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0422500 |
纤维素合酶末端复合物(“花簇”)的催化亚基,参与β-1,4-葡聚糖微纤维的结晶,是细胞壁形成的主要机制(通过相似性推测)。 | |
UniProt: A2XNT2 |
可能的纤维素合酶终端复合体(‘花状体’)的催化亚基,参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶,这是细胞壁形成的主要机制。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0837100 |
可能的纤维素合酶终端复合体(‘花状体’)的催化亚基,参与 β-1,4-葡聚糖微纤维结晶,这是细胞壁形成的主要机制。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009833 | plant-type primary cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009834 | plant-type secondary cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030244 | cellulose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005802 | trans-Golgi network | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016759 | cellulose synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016760 | cellulose synthase (UDP-forming) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G05170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.878; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0808100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=80.759; 覆盖度=98.452; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0176100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=70.643; 覆盖度=97.723; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0208500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=81.066; 覆盖度=99.089; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |