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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G392350
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 98478426-98481745 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2197 bp · TkA07G392350|TK1151|cDNA

AATTGGGCCTTGAAATGTTCTCAAAGGCTAAGAGCCGTTTCTTTTTTTGTTTTTAATTTTGGCATCATATTTGCTGGATTTTAACTTTTTAAGTTTAAATTTACAAATGAAAAAAGCAAAACAAACAAAAAAGAAGTACGTGGGTGACTGGGTGGGGCCTTTGTATTTTTCAAAATTTGCTTTATTCAGTTTACCACCTCATTATCGCCTATTTCCAGCCAGGCTTAAAGCAAGAAAGAGAGAGAGAAGGGCTGACGGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1554 bp · TkA07G392350|TK1151|CDS

ATGGCGGATCGCTTAATGCTTGCTTCTATTTTCGTTTCCGTTGTCGGACTTATACTCTTTTGGATCTCTATTCTCATTAAAAATGGACGCCCACACAAATCCGCATCTGTCACGACCAAATCAACCTCGATCAGCACAGAATGCAGATCCGGAGACGAAACCGACGTCATTATCGTCGGCGCCGGTGTTGCCGGTGCTGCCCTCGCCCATACTCTCGCCAAGGATGGACGCCGTGTACTAGTGATTGAAAGAGACCTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

517 aa · TkA07G392350|TK1151|PROTEIN

MADRLMLASIFVSVVGLILFWISILIKNGRPHKSASVTTKSTSISTECRSGDETDVIIVGAGVAGAALAHTLAKDGRRVLVIERDLTEPDRIVGELLQPGGYLKLMELGLEDCVEDIDAQRVFGYALFKDGKNTRLSYPLEKFHADVAGRSFHNGRFIQKMREKASSLPTIRLQQGTVVSLLEEEGTIKGALYKTKNGKEMKAFAPLTIVCDGCFSNLRRSLCNPQVDVPSCFVGLILENCNLPYENHGHVVLADPSPIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G392350
TK1151 IDTkA07G392350
OH-1004 IDLXL04_001469
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)79.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.362 / OH-1004 86.517
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G392350
位置Chr07:98478426-98481745 (-)
描述Similar to SQE1: Squalene monooxygenase SE1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g58440 可能催化角鲨烯立体特异性氧化为 (S)-2,3-环氧角鲨烯，参与甾醇生物合成。
Arabidopsis thaliana squalene epoxidase 1 is essential for root and seed development.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611831200
Identification of the Arabidopsis dry2/sqe1-5 mutant reveals a central role for sterols in drought tolerance and regulation of reactive oxygen species.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03849.x
Analysis of the arabidopsis dry2/sqe1-5 mutant suggests a role for sterols in signaling.2009 · DOI: 10.4161/psb.4.9.9425
At4g37760 可能催化角鲨烯立体特异性氧化为 (S)-2,3-环氧角鲨烯，参与甾醇生物合成。
Arabidopsis thaliana squalene epoxidase 1 is essential for root and seed development.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611831200
At2g22830 催化角鲨烯立体专一性氧化生成（S）-2,3-环氧角鲨烯，被认为是类固醇生物合成中的限速酶。
Arabidopsis thaliana squalene epoxidase 1 is essential for root and seed development.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m611831200

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001469 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009725 response to hormone 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0016126 sterol biosynthetic process 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0046246 terpene biosynthetic process 生物过程
GO:0071731 response to nitric oxide 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G58440
ath:AT2G22830
ath:AT4G37760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.398
排名 1 · TkA07G392350 · TK1151
线粒体0.154
排名 2 · TkA07G392350 · TK1151
细胞质0.130
排名 3 · TkA07G392350 · TK1151
高尔基体0.121
排名 4 · TkA07G392350 · TK1151
细胞膜0.108
排名 5 · TkA07G392350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01946Thi452-87 aa
PF01488Shikimate_DH52-107 aa
PF00996GDI52-85 aa
PF01494FAD_binding_353-364 aa
PF01262AlaDh_PNT_C53-87 aa
PF01266DAO55-85 aa
PF00890FAD_binding_255-84 aa
PF01134GIDA55-217 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G392350PF01946Thi452878.2e-0522.7
TkA07G392350PF01488Shikimate_DH521070.02415.4
TkA07G392350PF00996GDI52850.3210.2
TkA07G392350PF01494FAD_binding_3533641.4e-1868.0
TkA07G392350PF01262AlaDh_PNT_C53870.2311.6
TkA07G392350PF01266DAO55855.2e-1143.4
TkA07G392350PF00890FAD_binding_255841e-0628.9
TkA07G392350PF01134GIDA552179.3e-0625.7
TkA07G392350PF07992Pyr_redox_255853.3e-0524.2
TkA07G392350PF12831FAD_oxidored55850.0003120.9
TkA07G392350PF05834Lycopene_cycl55830.002217.8
TkA07G392350PF03486HI0933_like55850.003917.4
TkA07G392350PF02254TrkA_N56860.007517.3
TkA07G392350PF00070Pyr_redox56840.01816.2
TkA07G392350PF03435Sacchrp_dh_NADP56950.04414.8
TkA07G392350PF027373HCDH_N56870.09213.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SM02拟南芥sp|Q9SM02|ERG14_ARATH Squalene epoxidase 174.700%Swiss-Prot高置信
Q8VYH2拟南芥sp|Q8VYH2|ERG16_ARATH Squalene epoxidase 378.500%Swiss-Prot高置信
O81000拟南芥sp|O81000|ERG15_ARATH Squalene epoxidase 2, mitochondrial77.400%Swiss-Prot高置信

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