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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G037000
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 9853199-9855282 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1806 bp · TkA07G037000|TK1151|cDNA

ATGGGTATGGCTCTTAGAAGATCTGGTGTTATAAACCGTATATGCATAAGATGCTTGTATGTCTTGATAATTGCATTACAACATATCAAGGGAACTGATATATTGACAAAAGATAGTCCGCTCTTCTCAGGAGAGACTCTAGTCTCTTCCAATCAAATCTTTGAGTTAGGCTTCTTCACTCCAGGTAATTCCACTAACCAATATCTTGGTCTATGGTTCAAAGATATTCTTCCAAGAAAAATTCTATGGGTTGCAAACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1806 bp · TkA07G037000|TK1151|CDS

ATGGGTATGGCTCTTAGAAGATCTGGTGTTATAAACCGTATATGCATAAGATGCTTGTATGTCTTGATAATTGCATTACAACATATCAAGGGAACTGATATATTGACAAAAGATAGTCCGCTCTTCTCAGGAGAGACTCTAGTCTCTTCCAATCAAATCTTTGAGTTAGGCTTCTTCACTCCAGGTAATTCCACTAACCAATATCTTGGTCTATGGTTCAAAGATATTCTTCCAAGAAAAATTCTATGGGTTGCAAACAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

601 aa · TkA07G037000|TK1151|PROTEIN

MGMALRRSGVINRICIRCLYVLIIALQHIKGTDILTKDSPLFSGETLVSSNQIFELGFFTPGNSTNQYLGLWFKDILPRKILWVANRQNPISFSNTNSILTIGNDGNLRILDANQTTVWSTRLRVQSNKTIAKLTNIGDFTLNDTISGLTFWKSFDHPSNILLPGMRLGTNETTQGKNLLTSWKSSDDPTPGDFVLGLSEEQPPQAFTWRGSKPYWRSGPWDAGKFIGIPEQDPGYSNRMTLMPENSQGGAYLTINLHSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G037000
TK1151 IDTkA07G037000
OH-1004 IDLXL04_027170
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G037000
位置Chr07:9853199-9855282 (-)
描述Similar to At1g61550: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61550
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g61480 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61480。 暂无已核实直接文献
At1g61550 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61550。 暂无已核实直接文献
At1g61500 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61500。 暂无已核实直接文献
At1g61370 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61370。 暂无已核实直接文献
At1g61390 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61390。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027170 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61370
ath:AT1G61390
ath:AT1G61440
ath:AT1G61480
ath:AT1G61550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.799
排名 1 · TkA07G037000 · TK1151
内质网0.090
排名 2 · TkA07G037000 · TK1151
细胞质0.069
排名 3 · TkA07G037000 · TK1151
细胞外0.057
排名 4 · TkA07G037000 · TK1151
细胞核0.034
排名 5 · TkA07G037000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin81-184 aa
PF00954S_locus_glycop94-128 aa
PF12779WXXGXW208-221 aa
PF00954S_locus_glycop216-320 aa
PF08276PAN_2297-311 aa
PF08276PAN_2356-413 aa
PF01453B_lectin481-500 aa
PF00069Pkinase515-598 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G037000PF01453B_lectin811848.9e-29100.7
TkA07G037000PF00954S_locus_glycop941283.3e-2176.6
TkA07G037000PF12779WXXGXW2082214.88.1
TkA07G037000PF00954S_locus_glycop2163203.3e-2176.6
TkA07G037000PF08276PAN_22973116e-1555.8
TkA07G037000PF08276PAN_23564136e-1555.8
TkA07G037000PF01453B_lectin4815008.9e-29100.7
TkA07G037000PF00069Pkinase5155983.4e-1143.8
TkA07G037000PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5175993.1e-1453.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64771拟南芥sp|O64771|Y1148_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6148043.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SY95拟南芥sp|Q9SY95|Y1155_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6155043.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SYA0拟南芥sp|Q9SYA0|Y1150_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6150042.000%Swiss-Prot中等置信
O64783拟南芥sp|O64783|Y1137_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6137042.700%Swiss-Prot中等置信
O64781拟南芥sp|O64781|Y1639_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6139041.400%Swiss-Prot中等置信

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