基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_027170
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 10145116-10147154
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1755 bp · LXL04_027170|LXL04_027170|OH1004|cDNA
ATGGGTATGGCTCTTAGAAGATCTGGTGTTATAAACCGTATATGCATAAGATGCTTGTATGTCTTGATAATTGCATTACAACATATCAAGGGAACTGATATATTGACAAAAGATAGTCCGCTCTTCTCAGGAGAGACTCTAGTCTCTTCCAATCAAATCTTTGAGTTAGGCTTCTTCACTCCAGGTAATTCCACTAACCAATATCTTGGTCTATGGTTCAAAGATATTCTTCCAAGAAAAATTCTATGGGTTGCAAACAG...
CDS
下载 CDS FASTA1755 bp · LXL04_027170|LXL04_027170|OH1004|CDS
ATGGGTATGGCTCTTAGAAGATCTGGTGTTATAAACCGTATATGCATAAGATGCTTGTATGTCTTGATAATTGCATTACAACATATCAAGGGAACTGATATATTGACAAAAGATAGTCCGCTCTTCTCAGGAGAGACTCTAGTCTCTTCCAATCAAATCTTTGAGTTAGGCTTCTTCACTCCAGGTAATTCCACTAACCAATATCTTGGTCTATGGTTCAAAGATATTCTTCCAAGAAAAATTCTATGGGTTGCAAACAG...
584 aa · LXL04_027170|LXL04_027170|OH1004|PROTEIN
MGMALRRSGVINRICIRCLYVLIIALQHIKGTDILTKDSPLFSGETLVSSNQIFELGFFTPGNSTNQYLGLWFKDILPRKILWVANRQNPISFSNTNSILTIGNDGNLRILDANQTTVWSTRLTGPLTNIGDFTLNDTISGLTFWKSFDHPSNILLPGMRLGTNETTQGKNLLTSWKSSDDPTPGDFVLGLSEEQPPQAFTWRGSKPYWRSGPWDAGKFIGIPEQDPGYSNRMTLMPENSQGGSYLTINLHSSFDTRWLF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_027170 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_027170 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:10145116-10147154 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At1g61550: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61550 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006955 immune response 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0048544 recognition of pollen 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005516 calmodulin binding 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G61370 ath:AT1G61390 ath:AT1G61440 ath:AT1G61480 ath:AT1G61550 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.650
内质网0.117
细胞外0.107
细胞质0.078
溶酶体／液泡0.045
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01453.31B_lectin81-177 aaPF00954.26S_locus_glycop209-313 aaPF08276.18PAN_2349-406 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr499-582 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_027170 | PF01453.31 | B_lectin | 81 | 177 | 6.2e-24 | 85.2 |
| LXL04_027170 | PF00954.26 | S_locus_glycop | 209 | 313 | 2.8e-21 | 76.8 |
| LXL04_027170 | PF08276.18 | PAN_2 | 349 | 406 | 5.8e-15 | 55.9 |
| LXL04_027170 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 499 | 582 | 4.3e-07 | 30.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SY95 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61550 | 42.430% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O64771 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61480 | 41.446% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O64783 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61370 | 40.885% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O64776 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61440 | 42.295% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O64781 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61390 | 40.198% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |