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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G036900
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 9814235-9817262 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1750 bp · TkA07G036900|TK1151|cDNA

GATCTTTCCAATTTCTAAAAACTTAAACTGCAGATGTGTCTTTAAAACCCAATGGGTGTGACTATTAAAAGATCTATTCTTGCAAACTTTTTATACATAATATGCCTGATTATTTCATTAAAACTATGCAAGGCGGCTGATTTTCTGACTAAAGATAGTCCAATCTCATTACAACAGACACTAGTCTCTTTCAATCAAAATTTTGAGCTGGGCTTCTTCGTTCCAGGTAATTCCACTAACCGATATCTTGGTATATGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

807 bp · TkA07G036900|TK1151|CDS

ATGGGGTTTTGTGGTGGCTTTTCAATGTGTACTAATAGGACTCGTATTTGTGAGTGCTTTAAAGGGTTTGTACCACAATCGAATGATGAATGGAGTAAAGGTAATTGGACAAGGGGTTGTGTGAGGGAAAATGAACTTTTATGTGAGAGGAATGAAAGTAGTACTTTAGCTTCTAGAAAAATTAAACCCGATAAGTTTGAAGTGGTAAAAAGGGTCAAGCTGCCGGATCATTATCAATACTTTCTATATATGGATACGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

268 aa · TkA07G036900|TK1151|PROTEIN

MGFCGGFSMCTNRTRICECFKGFVPQSNDEWSKGNWTRGCVRENELLCERNESSTLASRKIKPDKFEVVKRVKLPDHYQYFLYMDTDECQAWCLANCSCKAYAYVEGINCMVWEQDLIDIEQFSFGGENLLLRLAYEESDPKKRRQLDWSTRFNIIQGIGRGLIYLHRDSSLRIIHRDLKCSNILLDDKMNPKISDFGLARTFQMTQELANTRRIVGTYGYMSPEYAMRGVISEKSDVFSYGVMLLEIISGKGTPNLYIA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G036900
TK1151 IDTkA07G036900
OH-1004 IDLXL04_027170
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 53.358 / OH-1004 24.315
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G036900
位置Chr07:9814235-9817262 (-)
描述Similar to At1g61550: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61550
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g61370 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61370。 暂无已核实直接文献
At1g61550 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61550。 暂无已核实直接文献
At1g61380 参与脂多糖(LPS)识别的S域受体蛋白激酶。
A lectin S-domain receptor kinase mediates lipopolysaccharide sensing in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1038/ni.3124
Lipopolysaccharides Trigger Two Successive Bursts of Reactive Oxygen Species at Distinct Cellular Locations.2018 · DOI: 10.1104/pp.17.01637
Tyrosine phosphorylation of the lectin receptor-like kinase LORE regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.15252/embj.2019102856
At1g61420 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61420。 暂无已核实直接文献
At1g61500 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61500。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027170 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61370
ath:AT1G61390
ath:AT1G61440
ath:AT1G61480
ath:AT1G61550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.611
排名 1 · TkA07G036900 · TK1151
内质网0.121
排名 2 · TkA07G036900 · TK1151
细胞质0.109
排名 3 · TkA07G036900 · TK1151
细胞外0.070
排名 4 · TkA07G036900 · TK1151
细胞核0.054
排名 5 · TkA07G036900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00954S_locus_glycop3-26 aa
PF00024PAN_18-20 aa
PF08276PAN_263-120 aa
PF00024PAN_167-115 aa
PF00954S_locus_glycop83-96 aa
PF14295PAN_485-106 aa
PF12330Haspin_kinase111-210 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr142-255 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G036900PF00954S_locus_glycop3260.02316.0
TkA07G036900PF00024PAN_18200.01316.1
TkA07G036900PF08276PAN_2631201.6e-1764.0
TkA07G036900PF00024PAN_1671150.01316.1
TkA07G036900PF00954S_locus_glycop83960.02316.0
TkA07G036900PF14295PAN_4851060.0913.6
TkA07G036900PF12330Haspin_kinase1112100.007816.0
TkA07G036900PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1422557.2e-2588.5
TkA07G036900PF00069Pkinase1502521.9e-2693.7
TkA07G036900PF01636APH1692120.06213.8
TkA07G036900PF17667Pkinase_fungal1722250.1611.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64783拟南芥sp|O64783|Y1137_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6137034.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SY95拟南芥sp|Q9SY95|Y1155_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6155035.300%Swiss-Prot中等置信
O64782拟南芥sp|O64782|SD129_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-2935.600%Swiss-Prot中等置信
O64778拟南芥sp|O64778|Y1142_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6142034.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SYA0拟南芥sp|Q9SYA0|Y1150_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6150034.600%Swiss-Prot中等置信

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