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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G185800
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 48465033-48466826 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1671 bp · TkA06G185800|TK1151|cDNA

ATGAACTGGTTCAGAGGATCGGCGTCTTCAACGTGGAATTTTTCCAATACTACTAGAGGATTCATCTGCAGCTTCTATGGCGTCACCTGCTGGAACGATCAGGAGAATCGTGTAATTACGCTCACACTTCGGGACGCTGGACTTGCCGGACCAGTTCCTTCGGATTTACAGTCCTGTCGGAGCTTACAGAACCTGGATCTCTCGGGTAATAGTCTAACTGGTTCTATTCCTAGTGAAATTTGTACCTGGCTGCCTTATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1671 bp · TkA06G185800|TK1151|CDS

ATGAACTGGTTCAGAGGATCGGCGTCTTCAACGTGGAATTTTTCCAATACTACTAGAGGATTCATCTGCAGCTTCTATGGCGTCACCTGCTGGAACGATCAGGAGAATCGTGTAATTACGCTCACACTTCGGGACGCTGGACTTGCCGGACCAGTTCCTTCGGATTTACAGTCCTGTCGGAGCTTACAGAACCTGGATCTCTCGGGTAATAGTCTAACTGGTTCTATTCCTAGTGAAATTTGTACCTGGCTGCCTTATCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

556 aa · TkA06G185800|TK1151|PROTEIN

MNWFRGSASSTWNFSNTTRGFICSFYGVTCWNDQENRVITLTLRDAGLAGPVPSDLQSCRSLQNLDLSGNSLTGSIPSEICTWLPYLVSLDLSNNEFTGEIPASLGNCSFLNSLVLSGNKLSGSIPAQFSNLGRLNKFSVADNDLSGSIPSRLSNFDSSSFDGNNGLCGEPLTKCGSLSKKNLVIIIAAGVLGAVGSLLLGFGLWWWCSTKSMKKRRNGIDRDDDSSSWADRLRAYKLVQVSLFQKPLVKVKVVDLMMAT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G185800
TK1151 IDTkA06G185800
OH-1004 IDLXL04_024037
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.101 / OH-1004 92.295
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G185800
位置Chr06:48465033-48466826 (-)
描述Similar to BIR2: Inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28450 缺乏蛋白激酶活性且无法结合 ATP 类似物的假激酶。
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
At1g27190 可能失活的受体激酶At1g27190。 暂无已核实直接文献
At1g69990 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g69990。 暂无已核实直接文献
At5g48380 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶At5g48380。 暂无已核实直接文献
At3g13380 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024037 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27190
ath:AT1G55610
ath:AT1G69990
ath:AT3G28450
ath:AT5G48380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.870
排名 1 · TkA06G185800 · TK1151
细胞质0.075
排名 2 · TkA06G185800 · TK1151
内质网0.073
排名 3 · TkA06G185800 · TK1151
细胞核0.058
排名 4 · TkA06G185800 · TK1151
溶酶体／液泡0.022
排名 5 · TkA06G185800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00560LRR_139-59 aa
PF24758LRR_At5g5637048-120 aa
PF13855LRR_853-72 aa
PF13516LRR_659-74 aa
PF13855LRR_860-121 aa
PF00560LRR_161-82 aa
PF12799LRR_461-95 aa
PF13855LRR_885-145 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G185800PF00560LRR_139591.7e-1554.5
TkA06G185800PF24758LRR_At5g56370481200.1312.6
TkA06G185800PF13855LRR_853725.6e-0936.4
TkA06G185800PF13516LRR_659740.001219.4
TkA06G185800PF13855LRR_8601215.6e-0936.4
TkA06G185800PF00560LRR_161821.7e-1554.5
TkA06G185800PF12799LRR_461954.7e-0833.7
TkA06G185800PF13855LRR_8851455.6e-0936.4
TkA06G185800PF13516LRR_6851000.001219.4
TkA06G185800PF00560LRR_1871081.7e-1554.5
TkA06G185800PF13516LRR_61081230.001219.4
TkA06G185800PF00560LRR_11111321.7e-1554.5
TkA06G185800PF12799LRR_41111474.7e-0833.7
TkA06G185800PF00560LRR_11351561.7e-1554.5
TkA06G185800PF13516LRR_61371470.001219.4
TkA06G185800PF13855LRR_81521675.6e-0936.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSI9拟南芥sp|Q9LSI9|BIR2_ARATH Inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR261.500%Swiss-Prot高置信
O04567拟南芥sp|O04567|Y1719_ARATH Probable inactive receptor kinase At1g2719058.900%Swiss-Prot高置信
C0LGI5拟南芥sp|C0LGI5|Y1699_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6999054.800%Swiss-Prot高置信
Q9ASS4拟南芥sp|Q9ASS4|Y5838_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g4838044.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LJF3拟南芥sp|Q9LJF3|BRL3_ARATH Receptor-like protein kinase BRI1-like 336.600%Swiss-Prot中等置信

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