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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024037
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 78373191-78374984 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1794 bp · LXL04_024037|LXL04_024037|OH1004|cDNA

ATGAACTGGTTCAGAGGTATTCTCTCCACCGTGTTGTTAATCACGTTTGTGCTTTTGTTATGTATTGGGTCGTCGTCGGTCTACGCGCAGGACGATGTCCAGTGTTTGCGAGGTTTTCAGAGGTCGTTCGATGGTCCAGGATCGGCGTCTTCAACGTGGAATTTTTCCAATACTACTAGAGGATTCATCTGCAGCTTCTATGGCGTCACCTGCTGGAACGATCAGGAGAATCGTGTAATTACGCTCACACTTCGTGACGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1794 bp · LXL04_024037|LXL04_024037|OH1004|CDS

ATGAACTGGTTCAGAGGTATTCTCTCCACCGTGTTGTTAATCACGTTTGTGCTTTTGTTATGTATTGGGTCGTCGTCGGTCTACGCGCAGGACGATGTCCAGTGTTTGCGAGGTTTTCAGAGGTCGTTCGATGGTCCAGGATCGGCGTCTTCAACGTGGAATTTTTCCAATACTACTAGAGGATTCATCTGCAGCTTCTATGGCGTCACCTGCTGGAACGATCAGGAGAATCGTGTAATTACGCTCACACTTCGTGACGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

597 aa · LXL04_024037|LXL04_024037|OH1004|PROTEIN

MNWFRGILSTVLLITFVLLLCIGSSSVYAQDDVQCLRGFQRSFDGPGSASSTWNFSNTTRGFICSFYGVTCWNDQENRVITLTLRDAGLAGPVPSDLQSCRSLQNLDLSGNSLTGSIPSEICTWLPYLVSLDLSNNEFTGEIPASLGNCSFLNSLVLSGNKLSGSIPAQFSNLGRLNKFSVADNDLSGSIPSRLSNFDSSSFDGNNGLCGEPLTKCGSLSKKNLVIIIAAGVLGAVGSLLLGFGLWWWCSTKSMKKRRNG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024037
TK1151 IDTkA06G185800
OH-1004 IDLXL04_024037
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.101 / OH-1004 92.295
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024037
位置Chr05:78373191-78374984 (+)
描述Similar to BIR2: Inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28450 缺乏蛋白激酶活性且无法结合 ATP 类似物的假激酶。
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
At1g27190 可能失活的受体激酶At1g27190。 暂无已核实直接文献
At1g69990 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g69990。 暂无已核实直接文献
At5g48380 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶At5g48380。 暂无已核实直接文献
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024037 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27190
ath:AT1G55610
ath:AT1G69990
ath:AT3G28450
ath:AT5G48380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.873
排名 1 · LXL04_024037 · OH-1004
内质网0.079
排名 2 · LXL04_024037 · OH-1004
细胞质0.067
排名 3 · LXL04_024037 · OH-1004
细胞核0.049
排名 4 · LXL04_024037 · OH-1004
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · LXL04_024037 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_230-72 aa
PF13855.13LRR_8101-162 aa
PF12799.14LRR_4102-136 aa
PF13855.13LRR_8126-186 aa
PF00069.32Pkinase314-564 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr316-565 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024037PF08263.18LRRNT_230721e-0629.6
LXL04_024037PF13855.13LRR_81011627.6e-0935.9
LXL04_024037PF12799.14LRR_41021366.1e-0833.4
LXL04_024037PF13855.13LRR_81261867.6e-0935.9
LXL04_024037PF00069.32Pkinase3145649.4e-2071.8
LXL04_024037PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3165655.1e-2382.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSI9拟南芥Inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR257.025%Swiss-Prot强数据库同源证据
O04567拟南芥Probable inactive receptor kinase At1g2719054.817%Swiss-Prot强数据库同源证据
C0LGI5拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6999051.429%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9ASS4拟南芥Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g4838041.608%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZWC8拟南芥Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 135.465%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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