TkA05G070010 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G070010

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 18765484-18771948 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

636 bp · TkA05G070010|TK1151|cDNA

ATGATCTTCATGGGGACAAGATTATACATGGAAGCAACAAACGAGTTGTCAATCAATCAAAGGTCCACGGCATTGGTGTTGCTTAGCACTAGATCTATTGGTAGTTACAAGTCCGTAGATGATATGGTCAAAAATAAAGAAGCTAAAAGTCTATGGGGAAACCAATTTTCACTCTTGCATGTTTATTTGCCGAAGCTTCATCAATATGAGGAGTCTTTAAACCCACTGAGATTTGTTCAAGAAACACAGAATATCATCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

636 bp · TkA05G070010|TK1151|CDS

ATGATCTTCATGGGGACAAGATTATACATGGAAGCAACAAACGAGTTGTCAATCAATCAAAGGTCCACGGCATTGGTGTTGCTTAGCACTAGATCTATTGGTAGTTACAAGTCCGTAGATGATATGGTCAAAAATAAAGAAGCTAAAAGTCTATGGGGAAACCAATTTTCACTCTTGCATGTTTATTTGCCGAAGCTTCATCAATATGAGGAGTCTTTAAACCCACTGAGATTTGTTCAAGAAACACAGAATATCATCAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

211 aa · TkA05G070010|TK1151|PROTEIN

MIFMGTRLYMEATNELSINQRSTALVLLSTRSIGSYKSVDDMVKNKEAKSLWGNQFSLLHVYLPKLHQYEESLNPLRFVQETQNIIRRKRNSGAVYLTGMMLESMRKYRGPEVAAKYIHTTIKNSSMSVSNMIGPLKKMSLSNQPIKGLYFMAANVPQNLMVTITSYMDQLRVAVGTDKCLIDPMKFKTYIKKAFTMIFDDAIKSKGHDKW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G070010`
TK1151 ID	TkA05G070010
OH-1004 ID	LXL04_019922
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	73.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.156 / OH-1004 42.827 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G070010

位置 Chr05:18765484-18771948 (+)

描述 Similar to WSD1: O-acyltransferase WSD1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g49190`	双功能蜡酯合成酶/二酰基甘油酰基转移酶（通过相似性）。	暂无已核实直接文献
`At3g49210`	双功能蜡酯合酶/二酰甘油酰基转移酶，使用含 16、18 和 20 个碳的酰基-CoA 作为底物，优选与 16:0 醇结合使用。	Surface wax esters contribute to drought tolerance in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/tpj.14269
`At3g49200`	双功能蜡酯合成酶/二酰基甘油酰基转移酶（通过相似性）。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019922 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程

GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程

GO:0048441 petal development 生物过程

GO:0048446 petal morphogenesis 生物过程

GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G49190

ath:AT3G49200

ath:AT3G49210

ath:AT5G12420

ath:AT5G53390

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.704

排名 1 · TkA05G070010 · TK1151

细胞核0.100

排名 2 · TkA05G070010 · TK1151

高尔基体0.098

排名 3 · TkA05G070010 · TK1151

细胞质0.083

排名 4 · TkA05G070010 · TK1151

细胞膜0.080

排名 5 · TkA05G070010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06974WS_DGAT_C52-198 aa

PF27772Atp2259-126 aa

PF18814PBECR5163-204 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G070010	`PF06974`	WS_DGAT_C	52	198	1.2e-36	126.6
TkA05G070010	`PF27772`	Atp22	59	126	0.021	14.2
TkA05G070010	`PF18814`	PBECR5	163	204	0.094	13.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M3B3`	拟南芥	sp\|Q9M3B3\|WSD4_ARATH Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 4	29.700%	Swiss-Prot	低置信
`Q9M3B1`	拟南芥	sp\|Q9M3B1\|WSD6_ARATH Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 6	32.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9M3B2`	拟南芥	sp\|Q9M3B2\|WSD5_ARATH Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 5	25.400%	Swiss-Prot	低置信

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