LXL04_019922 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_019922

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 44360055-44365159 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1425 bp · LXL04_019922|LXL04_019922|OH1004|cDNA

atgGAGTTGAAGGTGAACGTAGGACGTGTGGAAGATGTAGAAATGTCAGAGCCGGTGAGCCCGACCGGTCAGTACTTCAACAGCTCGGTGCTTTCCGTTTCTGTTATTAGCATCTTGGAGTTCGACGACCCCATTGATGACTCTTCAAGCCTTGCACTCATTAACGATGTCTTCCTTCCTATTAATCCTCGTTTCTCTTCCATTATGGTTGAAGACGAAGAGGGAGGGAAGCAATGGAAGAGAGTGGAAGTAAAGGCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1425 bp · LXL04_019922|LXL04_019922|OH1004|CDS

ATGGAGTTGAAGGTGAACGTAGGACGTGTGGAAGATGTAGAAATGTCAGAGCCGGTGAGCCCGACCGGTCAGTACTTCAACAGCTCGGTGCTTTCCGTTTCTGTTATTAGCATCTTGGAGTTCGACGACCCCATTGATGACTCTTCAAGCCTTGCACTCATTAACGATGTCTTCCTTCCTATTAATCCTCGTTTCTCTTCCATTATGGTTGAAGACGAAGAGGGAGGGAAGCAATGGAAGAGAGTGGAAGTAAAGGCCGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

474 aa · LXL04_019922|LXL04_019922|OH1004|PROTEIN

MELKVNVGRVEDVEMSEPVSPTGQYFNSSVLSVSVISILEFDDPIDDSSSLALINDVFLPINPRFSSIMVEDEEGGKQWKRVEVKAEDHITVPCFPEGLSPQSYDHYFNDYLSKMAMDPLPQSKPLWEIHVIKYPTSNASGSVVFKLHHALGDGFSLMGALLSCLQRADNPSLPLTFPNFQKGVLKTEIEEKSLIRVVPQALSGVLNTVMDFGWSILKSSFLEDGRTPIRSSKEGVEFRPINIMTMTFSLDQIKQIKSRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_019922`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_019922

位置 Chr04:44360055-44365159 (+)

描述 Similar to WSD1: O-acyltransferase WSD1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g49190`	双功能蜡酯合成酶/二酰基甘油酰基转移酶（通过相似性）。	暂无已核实直接文献
`At3g49210`	双功能蜡酯合酶/二酰甘油酰基转移酶，使用含 16、18 和 20 个碳的酰基-CoA 作为底物，优选与 16:0 醇结合使用。	Surface wax esters contribute to drought tolerance in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/tpj.14269
`At3g49200`	双功能蜡酯合成酶/二酰基甘油酰基转移酶（通过相似性）。	暂无已核实直接文献
`At5g53390`	双功能蜡酯合成酶/二酰基甘油酰基转移酶（通过相似性）。	Physical interaction of floral organs controls petal morphogenesis in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.112.212084 The Half-Size ABC Transporter FOLDED PETALS 2/ABCG13 Is Involved in Petal Elongation through Narrow Spaces in Arabidopsis thaliana Floral Buds.2014 · DOI: 10.3390/plants3030348
`At5g12420`	双功能蜡酯合酶/二酰甘油酰基转移酶，使用含14、16和18个碳的酰基辅酶A作为底物，优选与16:0醇结合使用。	Surface wax esters contribute to drought tolerance in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/tpj.14269

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019922 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程

GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程

GO:0048441 petal development 生物过程

GO:0048446 petal morphogenesis 生物过程

GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G49190

ath:AT3G49200

ath:AT3G49210

ath:AT5G12420

ath:AT5G53390

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.480

排名 1 · LXL04_019922 · OH-1004

高尔基体0.151

排名 2 · LXL04_019922 · OH-1004

细胞质0.150

排名 3 · LXL04_019922 · OH-1004

细胞膜0.144

排名 4 · LXL04_019922 · OH-1004

溶酶体／液泡0.141

排名 5 · LXL04_019922 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03007.22WS_DGAT_cat108-268 aa

PF06974.19WS_DGAT_C322-466 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_019922	`PF03007.22`	WS_DGAT_cat	108	268	9.4e-14	52.5
LXL04_019922	`PF06974.19`	WS_DGAT_C	322	466	1.1e-38	133.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M3B3`	拟南芥	Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 4	29.328%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9M3B1`	拟南芥	Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 6	29.293%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9M3B2`	拟南芥	Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 5	29.487%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q5KS41`	拟南芥	Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 11	28.629%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q94CK0`	拟南芥	Wax ester synthase/diacylglycerol acyltransferase 7	28.633%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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