基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA04G066840
当前版本: TK1151
染色体: Chr04
坐标: 17713220-17716686
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1089 bp · TkA04G066840|TK1151|cDNA
ATGAATGAACTAGAAGCATGCAACTGGTCACAAGGGTTTGAAGATGATCTTCTAAGAGAGCTTCTTTACGACGAATCCCCATATCTTCTTTTGCCTCAAAAAATCGCTAGTGATTCATTAGACAATCACTCGGTAAACAATTTGATATCAAGCATATATTCTGGCCCCACAATAACGGATTTTGAAAAAGCACTAGAGGCTTCAAGTGACACAAATAATAATACTCCTGATTTTTCAGCATTGACCAGAATTGCAGATAT...
CDS
下载 CDS FASTA1089 bp · TkA04G066840|TK1151|CDS
ATGAATGAACTAGAAGCATGCAACTGGTCACAAGGGTTTGAAGATGATCTTCTAAGAGAGCTTCTTTACGACGAATCCCCATATCTTCTTTTGCCTCAAAAAATCGCTAGTGATTCATTAGACAATCACTCGGTAAACAATTTGATATCAAGCATATATTCTGGCCCCACAATAACGGATTTTGAAAAAGCACTAGAGGCTTCAAGTGACACAAATAATAATACTCCTGATTTTTCAGCATTGACCAGAATTGCAGATAT...
362 aa · TkA04G066840|TK1151|PROTEIN
MNELEACNWSQGFEDDLLRELLYDESPYLLLPQKIASDSLDNHSVNNLISSIYSGPTITDFEKALEASSDTNNNTPDFSALTRIADMERGVPRVENKYVLKIKCSGNVMADDGYKWRKYGQKSIKNSSNPRSYYKCTNPRCGAKKQVERSSEDHETLIITYEGLHLHYMYPFFIFGQSENLDPPTKKFRTLNFEPGAHQNYKQPTIDMDENIGHVSHDLPSTMLRDYQEGLPEEVPINSQVKLKSIIEITWRITWFTASF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA04G066840 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G066840 |
| OH-1004 ID | LXL04_036164 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 97.200 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 97.514 / OH-1004 46.023覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA04G066840 |
|---|---|
| 位置 | Chr04:17713220-17716686 (+) |
| 描述 | Similar to WRKY49: Probable WRKY transcription factor 49 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程 GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010055 atrichoblast differentiation 生物过程 GO:0032107 regulation of response to nutrient levels 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0048527 lateral root development 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G69310 ath:AT2G04880 ath:AT5G13080 ath:AT5G43290 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.783
细胞质0.261
线粒体0.039
细胞膜0.035
内质网0.022
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03106WRKY111-167 aaPF04606Ogr_Delta131-146 aaPF03106WRKY270-297 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA04G066840 | PF03106 | WRKY | 111 | 167 | 3.7e-25 | 88.6 |
| TkA04G066840 | PF04606 | Ogr_Delta | 131 | 146 | 0.062 | 14.0 |
| TkA04G066840 | PF03106 | WRKY | 270 | 297 | 3.7e-25 | 88.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FHR7 | 拟南芥 | sp|Q9FHR7|WRK49_ARATH Probable WRKY transcription factor 49 | 44.000% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q9C983 | 拟南芥 | sp|Q9C983|WRK57_ARATH Probable WRKY transcription factor 57 | 62.900% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q93WY4 | 拟南芥 | sp|Q93WY4|WRK12_ARATH Probable WRKY transcription factor 12 | 56.200% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q9FYA2 | 拟南芥 | sp|Q9FYA2|WRK75_ARATH Probable WRKY transcription factor 75 | 47.900% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q8GY11 | 拟南芥 | sp|Q8GY11|WRK43_ARATH Probable WRKY transcription factor 43 | 45.200% | Swiss-Prot | 低置信 |