基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA03G572920
当前版本: TK1151
染色体: Chr03
坐标: 145305802-145306377
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA576 bp · TkA03G572920|TK1151|cDNA
ATGCTGAGAAAACACACATACAATGATGAACTGGAGCAAAGTAAAAGAAACTCCGCCGTCGACAAAACCATTTCACGAACTGGGTTTAATTCTCCTTCCGGTTCTATTACCGTTAAGCCACGAGAACACCTCTTCCAGAAGACTGTTACCCCAAGTGACGTCGGGAAACTGAACCGGCTCGTGATACCAAAACAACACGCAGAAAAACACTTTCCGGTTCAGAGAGGAAGCACTTCAAAAGGAGTTCTTTTACATTTCGA...
CDS
下载 CDS FASTA576 bp · TkA03G572920|TK1151|CDS
ATGCTGAGAAAACACACATACAATGATGAACTGGAGCAAAGTAAAAGAAACTCCGCCGTCGACAAAACCATTTCACGAACTGGGTTTAATTCTCCTTCCGGTTCTATTACCGTTAAGCCACGAGAACACCTCTTCCAGAAGACTGTTACCCCAAGTGACGTCGGGAAACTGAACCGGCTCGTGATACCAAAACAACACGCAGAAAAACACTTTCCGGTTCAGAGAGGAAGCACTTCAAAAGGAGTTCTTTTACATTTCGA...
191 aa · TkA03G572920|TK1151|PROTEIN
MLRKHTYNDELEQSKRNSAVDKTISRTGFNSPSGSITVKPREHLFQKTVTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKHFPVQRGSTSKGVLLHFEDIDSKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKNLNAGDSVSFQRSTGPEKQLYIDWKAKTGSDSTNIQPIQPVNRFRCYGYLGLTFRVLLTAMAREVIQKWIY
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA03G572920 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA03G572920 |
| OH-1004 ID | LXL04_021401 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 77.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 87.958 / OH-1004 49.552覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA03G572920 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:145305802-145306377 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to RAV1: AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor RAV1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程 GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程 GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0048366 leaf development 生物过程 GO:0048527 lateral root development 生物过程 GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能 GO:0003677 DNA binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G13260 ath:AT1G25560 ath:AT1G68840 ath:AT3G25730 dosa:Os01g0693400 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.930
细胞质0.130
细胞膜0.029
内质网0.019
线粒体0.013
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF02362B345-143 aaPF31239At5g26805_C46-131 aaPF12790T6SS-SciN59-99 aaPF03754At2g31720-like79-129 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA03G572920 | PF02362 | B3 | 45 | 143 | 1.1e-26 | 93.4 |
| TkA03G572920 | PF31239 | At5g26805_C | 46 | 131 | 2.6e-07 | 31.8 |
| TkA03G572920 | PF12790 | T6SS-SciN | 59 | 99 | 0.016 | 15.7 |
| TkA03G572920 | PF03754 | At2g31720-like | 79 | 129 | 0.00032 | 21.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
P82280 | 拟南芥 | sp|P82280|RAV2_ARATH AP2/ERF and B3 domain-containing transcription repressor RAV2 | 63.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9ZWM9 | 拟南芥 | sp|Q9ZWM9|RAV1_ARATH AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor RAV1 | 66.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9C6M5 | 拟南芥 | sp|Q9C6M5|RAVL1_ARATH AP2/ERF and B3 domain-containing transcription repressor TEM1 | 60.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LS06 | 拟南芥 | sp|Q9LS06|RAVL4_ARATH AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor ARF14 | 58.500% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8RZX9 | 水稻 | sp|Q8RZX9|Y1934_ORYSJ AP2/ERF and B3 domain-containing protein Os01g0693400 | 55.000% | Swiss-Prot | 高置信 |