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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G522050
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 130991952-130995857 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2587 bp · TkA03G522050|TK1151|cDNA

ATGACATATTACAATCACATAATGCCTTTATTTTGTATCCTTATGTTTGAGTTAGGCTTATCAAACCCAAAATGACAAAACCCTACGCATCACAAATTTAAATTATATTTTATTCAATTTCTATGACTTATGAGCATCATCAACTGCAACACCATCAAATGTCTGTCGGAGTTTCTTCTTCACCATTTCCACTCCACTTCTCCATCTCTAACTCCACCATATCCACTCCTCTACCACCTTCAAACTACCTCTTGAACTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2043 bp · TkA03G522050|TK1151|CDS

ATGAATCATAATTCTTCGTTTTTCATTACAACGCTGTTGATTACAGCTTTCTTCTTCACGTTATCGGAATCATCAACCTGCAACAATACCGACTATGTTCTAATCTCGAAGGCGTTCATGTCGGTTGATAATTTTAATTCTTCATGGTTCGTATGTTCAAAGTCGCAAATCTCGAAGATTAATTTGTCGTCGAGAAATCTCACCGGAGCTATTTCGTGGAAGTTTTTTAAGAACTTGACTCACATCCACACGATTAACCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

680 aa · TkA03G522050|TK1151|PROTEIN

MNHNSSFFITTLLITAFFFTLSESSTCNNTDYVLISKAFMSVDNFNSSWFVCSKSQISKINLSSRNLTGAISWKFFKNLTHIHTINLSNNALKGYIPAWFWSIPNLVEVNLSKNKLGGAIGFESGSGLSSIQVLNLSFNRFTNLAHLSNFSNLSVLDMSYNNLKVLPFGLNSLKNLQHLDLSSCNISGDLKPISNLTSLEFLDVANNHMSGSFPKDFPPFSNINFLNISFNNFTGELPYEKVRRFGNSSFINTGMLFKFS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G522050
TK1151 IDTkA03G522050
OH-1004 IDLXL04_010356
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G522050
位置Chr03:130991952-130995857 (+)
描述Similar to CAMRLK: Calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g45800 体外可磷酸化髓磷脂碱性蛋白。
A receptor-like kinase from Arabidopsis thaliana is a calmodulin-binding protein.2004 · DOI: 10.1042/bj20031045
At2g24230 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24230。 暂无已核实直接文献
At5g58150 可能是非活性富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g58150。 暂无已核实直接文献
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0293500 可能参与根部的油菜素类固醇 感知。
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010356 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009625 response to insect 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24230
ath:AT5G07280
ath:AT5G45800
ath:AT5G58150
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · TkA03G522050 · TK1151
内质网0.085
排名 2 · TkA03G522050 · TK1151
细胞质0.075
排名 3 · TkA03G522050 · TK1151
细胞核0.060
排名 4 · TkA03G522050 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA03G522050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09716ETRAMP6-43 aa
PF14580LRR_956-146 aa
PF13855LRR_857-116 aa
PF00560LRR_158-73 aa
PF12799LRR_459-91 aa
PF23598LRR_1471-111 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2177-112 aa
PF23952LRR_EndoS77-114 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G522050PF09716ETRAMP6430.5211.1
TkA03G522050PF14580LRR_9561460.6110.3
TkA03G522050PF13855LRR_8571166.6e-1864.9
TkA03G522050PF00560LRR_158731.9e-1245.4
TkA03G522050PF12799LRR_459911.1e-1661.2
TkA03G522050PF23598LRR_14711111.6e-0524.6
TkA03G522050PF25019LRR_R13L1-DRL21771120.001319.3
TkA03G522050PF23952LRR_EndoS771140.0614.3
TkA03G522050PF23286LRR_13782050.1112.9
TkA03G522050PF13516LRR_679920.0001722.1
TkA03G522050PF00560LRR_1821021.9e-1245.4
TkA03G522050PF25019LRR_R13L1-DRL21961130.001319.3
TkA03G522050PF12799LRR_41041491.1e-1661.2
TkA03G522050PF13516LRR_61041190.0001722.1
TkA03G522050PF00560LRR_11051191.9e-1245.4
TkA03G522050PF23952LRR_EndoS1231610.0614.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FK63拟南芥sp|Q9FK63|CARLK_ARATH Calmodulin-binding receptor kinase CaMRLK50.300%Swiss-Prot高置信
C0LGK9拟南芥sp|C0LGK9|Y2242_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g2423042.600%Swiss-Prot低置信
Q9LVN2拟南芥sp|Q9LVN2|Y5815_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g5815038.200%Swiss-Prot低置信
Q9LYN8拟南芥sp|Q9LYN8|EMS1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS137.000%Swiss-Prot低置信
Q69JN6水稻sp|Q69JN6|BRL1_ORYSJ Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL134.700%Swiss-Prot低置信

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