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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G540290
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 139381732-139384543 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2039 bp · TkA02G540290|TK1151|cDNA

TGAAGCATTTTTTGTTAAAATAAAAGCTGAGAGAAAATCTTAACATCGTTTATCAAATGTTTTTTGAGTTTGAAAGACAGAAACGTTTTATAATTGGGTCCGATTACCGTTTTTGTAAATAGACGAGCAAAAAGAATTCGACTTTCTGCAGATACGTATGATTTCGGAAGATCAGCAGAGAAAAACCAAGAAGAAGATTAGATTTTCAAGCCATTTCCTCCTCCAAGTTCTGTTGTCGTTTTCTTCTGAAATCCTATTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1596 bp · TkA02G540290|TK1151|CDS

ATGGTGAAACTGGGTGCGTTTTCAAGGTTCGGATTTGGATTGATTCTCTTATTATCTCTGAATCAAATTCCACCAACAGCTTCGGCTTCAAAATCTAAGGAAGCGTATGTAACTCTTTTATACGGAGATGAATTCGTGTTGGGAGCACGTGTTCTTGGGAAGTCGATTCGGGATACCAGATCCACCAAAGACATGGTCGTTTTGGTCTCCGATGGTGTTTCCGACTACGCCAAAACTCTTCTCCAGGCTGATGGCTGGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

531 aa · TkA02G540290|TK1151|PROTEIN

MVKLGAFSRFGFGLILLLSLNQIPPTASASKSKEAYVTLLYGDEFVLGARVLGKSIRDTRSTKDMVVLVSDGVSDYAKTLLQADGWIVNPISLLENPNQVRPTRFWGVYTKLKIFNMTDYSKVVYLDADTIVVKNIDVLFKCGKFCANLKHSERLNSGVMVVEPSEKLFKDMVSKVATLHSYTGGDQGFLNAYYSGFPSARVFDPTKTRPVAEMERLSTLYNADVGLYMLANKWMVDEKELCVIHYTLGPLKPWDWWTSW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G540290
TK1151 IDTkA02G540290
OH-1004 IDLXL04_012749
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.812 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G540290
位置Chr02:139381732-139384543 (-)
描述Similar to IPUT1: Inositol phosphorylceramide glucuronosyltransferase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g18480 介导葡萄糖醛酸 从 UDP-GlcA 到糖基肌醇磷酸神经酰胺 的转移。
Identification of a sphingolipid α-glucuronosyltransferase that is essential for pollen function in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.129171
Glycosylation of inositol phosphorylceramide sphingolipids is required for normal growth and reproduction in Arabidopsis.2017 · DOI: 10.1111/tpj.13382
At1g77130 可能参与茎中葡萄糖醛酸木聚糖的木聚糖主链修饰。 暂无已核实直接文献
At1g08990 可能参与茎中葡萄糖醛酸木聚糖的木聚糖主链修饰。 暂无已核实直接文献
At3g18660 将葡萄糖醛酸和 4-O-甲基葡萄糖醛酸分支添加到干细胞壁中的木聚糖所需的糖基转移酶。
Absence of branches from xylan in Arabidopsis gux mutants reveals potential for simplification of lignocellulosic biomass.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005456107
An integrative approach to the identification of Arabidopsis and rice genes involved in xylan and secondary wall development.2010 · DOI: 10.1371/journal.pone.0015481
At1g54940 可能参与茎中葡萄糖醛酸木聚糖的木聚糖主链修饰。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012749 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006673 inositol phosphoceramide metabolic process 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010417 glucuronoxylan biosynthetic process 生物过程
GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程
GO:0046513 ceramide biosynthetic process 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08990
ath:AT1G77130
ath:AT2G35710
ath:AT3G18660
ath:AT5G18480
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.576
排名 1 · TkA02G540290 · TK1151
内质网0.171
排名 2 · TkA02G540290 · TK1151
溶酶体／液泡0.121
排名 3 · TkA02G540290 · TK1151
细胞质0.099
排名 4 · TkA02G540290 · TK1151
细胞膜0.077
排名 5 · TkA02G540290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01501Glyco_transf_838-141 aa
PF11051Mannosyl_trans3118-145 aa
PF01501Glyco_transf_8155-257 aa
PF21976SMIM43296-308 aa
PF11992TgpA_N296-419 aa
PF21976SMIM43397-443 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G540290PF01501Glyco_transf_8381412.6e-1144.3
TkA02G540290PF11051Mannosyl_trans31181450.04513.9
TkA02G540290PF01501Glyco_transf_81552572.6e-1144.3
TkA02G540290PF21976SMIM432963080.1313.0
TkA02G540290PF11992TgpA_N2964192.08.0
TkA02G540290PF21976SMIM433974430.1313.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GWB7拟南芥sp|Q8GWB7|GUX6_ARATH Inositol phosphorylceramide glucuronosyltransferase 164.600%Swiss-Prot高置信
Q8W4A7拟南芥sp|Q8W4A7|GUX3_ARATH Putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 333.000%Swiss-Prot中等置信
F4HZC3拟南芥sp|F4HZC3|GUX5_ARATH Putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 542.400%Swiss-Prot低置信
Q9LSB1拟南芥sp|Q9LSB1|GUX1_ARATH UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 136.600%Swiss-Prot低置信
Q9FZ37拟南芥sp|Q9FZ37|GUX4_ARATH Putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 438.200%Swiss-Prot低置信

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