基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_012749
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 18104787-18107353
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1807 bp · LXL04_012749|LXL04_012749|OH1004|cDNA
TACGTATGATCAGCAGAGAAAAACCAAGAAGAATATTAGATTTTCAAGCCATTTCCCCCTCCAAGTTTTGTTGTCGTTTTCTTCTGAAATCCTATTTCATAAAATCTAATGCATGGCTCCCCTAACATAATGCTTCATGCAGTTACATATTGGAAAAACCTGAAAATCTTATTTCCAATTTCCACACCATTTTATTAAATTAGACTCCGAGAAGATGAAACTGAGTCCCTTTTCGAGGTTCGGATTTGGATTGATTCTCT...
CDS
下载 CDS FASTA1593 bp · LXL04_012749|LXL04_012749|OH1004|CDS
ATGAAACTGAGTCCCTTTTCGAGGTTCGGATTTGGATTGATTCTCTTATTATCTCTGAATCAAATTCCACCAACAGCTTCTGCTTCAAAATCGAAGGAAGCGTATGTAACTCTTTTATACGGAGATGAATTCGTGTTGGGAGCACGTGTTCTTGGGAAGTCGATTCGGGATACCAGATCCACCAAAGACATGGTCGTTTTGGTCTCCGATGGTGTTTCCGACTACGCCAAAACTCTTCTCCAGGCTGATGGCTGGATTGT...
530 aa · LXL04_012749|LXL04_012749|OH1004|PROTEIN
MKLSPFSRFGFGLILLLSLNQIPPTASASKSKEAYVTLLYGDEFVLGARVLGKSIRDTRSTKDMVVLVSDGVSDYAKTLLQADGWIVNPISLLENPNQVRPTRFWGVYTKLKIFNMTDYSKVVYLDADTIVVKNIDVLFKCGKFCANLKHSERLNSGVMVVEPSEKLFKDMVSKVATLHSYTGGDQGFLNAYYSGFPSARIFDPTKTRPVAEMERLSTLYNADVGLYMLANKWMVDEKELCVIHYTLGPLKPWDWWTSWL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_012749 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_012749 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:18104787-18107353 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to IPUT1: Inositol phosphorylceramide glucuronosyltransferase 1 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006673 inositol phosphoceramide metabolic process 生物过程 GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程 GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0010417 glucuronoxylan biosynthetic process 生物过程 GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程 GO:0046513 ceramide biosynthetic process 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G08990 ath:AT1G77130 ath:AT2G35710 ath:AT3G18660 ath:AT5G18480 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.560
内质网0.176
溶酶体／液泡0.130
细胞质0.101
细胞膜0.078
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01501.27Glyco_transf_837-140 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_012749 | PF01501.27 | Glyco_transf_8 | 37 | 140 | 2.6e-11 | 44.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8GWB7 | 拟南芥 | Inositol phosphorylceramide glucuronosyltransferase 1 | 64.419% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8W4A7 | 拟南芥 | Putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 3 | 34.800% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
F4HZC3 | 拟南芥 | Putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 5 | 42.353% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LSB1 | 拟南芥 | UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 1 | 36.364% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8VZP6 | 拟南芥 | Putative glucuronosyltransferase PGSIP8 | 32.422% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |