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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G498240
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 127640873-127645375 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3395 bp · TkA02G498240|TK1151|cDNA

CGGAAACAACTCGACAAGCCTCGCGCTCTCTTGAACCATCCTCTTCCTTCTTCTTATATATTAACTGTGTCAACTCTCTCCTCCACTCATCACTTCACTCACAAGTTTTGCCTTGGAACTTACCAGAACCCTTATCTTTCCCGTATTCCCACTCAATCCCCTCTACTTTTTCATTCCTTGATCTCTCCCAATAACCTTGATTTACTGGTCACTCGACTCACACTTCTTCCGTTACCGATGGCAACGACGGCGTCCTTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

3186 bp · TkA02G498240|TK1151|CDS

CGGAAACAACTCGACAAGCCTCGCGCTCTCTTGAACCATCCTCTTCCTTCTTCTTATATATTAACTGTGTCAACTCTCTCCTCCACTCATCACTTCACTCACAAGTTTTGCCTTGGAACTTACCAGAACCCTTATCTTTCCCGTATTCCCACTCAATCCCCTCTACTTTTTCATTCCTTGATCTCTCCCAATAACCTTGATTTACTGGTCACTCGACTCACACTTCTTCCGTTACCGATGGCAACGACGGCGTCCTTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1061 aa · TkA02G498240|TK1151|PROTEIN

RKQLDKPRALLNHPLPSSYILTVSTLSSTHHFTHKFCLGTYQNPYLSRIPTQSPLLFHSLISPNNLDLLVTRLTLLPLPMATTASFSGVRIHAPSSTCIDRTTLFAQPSVSFSSFSKPRRTTLRSLKLRSRSNDVLLRTRTGDRFGGKSSRSFVVRCDASSNGRITQQEFTEMAWQAIVSSPEVAKENKHQIVETEHLMKALLEQKNGLARRIFSKAGIDNTRLLEATDKYIQRQPKVIGESAGSMLGRDLEALMQRARD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G498240
TK1151 IDTkA02G498240
OH-1004 IDLXL04_013400
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.057 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G498240
位置Chr02:127640873-127645375 (-)
描述Similar to CLPB3: Chaperone protein ClpB3, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g15450 对叶绿体发育和幼苗活力至关重要的分子伴侣。
An Arabidopsis chloroplast-targeted Hsp101 homologue, APG6, has an essential role in chloroplast development as well as heat-stress response.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02873.x
The Arabidopsis ClpB/Hsp100 family of proteins: chaperones for stress and chloroplast development.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02940.x
At2g25140 似乎不参与热应激反应或耐受的分子伴侣。
The Arabidopsis ClpB/Hsp100 family of proteins: chaperones for stress and chloroplast development.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02940.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0426900 可能在叶绿体发育中发挥作用的分子伴护蛋白。 暂无已核实直接文献
Os02g0181900 分子伴侣，可能不参与热应激反应或耐受性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013400 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009532 plastid stroma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ana:alr5084
ath:AT2G25140
ath:AT5G15450
dosa:Os02g0181900
dosa:Os03g0426900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.943
排名 1 · TkA02G498240 · TK1151
线粒体0.074
排名 2 · TkA02G498240 · TK1151
细胞质0.032
排名 3 · TkA02G498240 · TK1151
细胞核0.026
排名 4 · TkA02G498240 · TK1151
过氧化物酶体0.023
排名 5 · TkA02G498240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13207AAA_17166-232 aa
PF02861Clp_N169-292 aa
PF23735KIF9185-271 aa
PF00308Bac_DnaA213-293 aa
PF01656CbiA213-298 aa
PF02861Clp_N285-317 aa
PF14712Snapin_Pallidin285-363 aa
PF13191AAA_16344-394 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G498240PF13207AAA_171662320.06714.2
TkA02G498240PF02861Clp_N1692924.5e-35121.3
TkA02G498240PF23735KIF91852713.18.7
TkA02G498240PF00308Bac_DnaA2132930.001519.5
TkA02G498240PF01656CbiA2132980.04514.4
TkA02G498240PF02861Clp_N2853174.5e-35121.3
TkA02G498240PF14712Snapin_Pallidin2853630.006517.6
TkA02G498240PF13191AAA_163443942.7e-0835.3
TkA02G498240PF00158Sigma54_activat3454461.6e-0938.4
TkA02G498240PF25201nSTAND63453870.04314.6
TkA02G498240PF01637ATPase_23473820.005217.3
TkA02G498240PF23569NBD_SMAX13494512e-0628.5
TkA02G498240PF06414Zeta_toxin3493871.4e-0525.4
TkA02G498240PF20720nSTAND33513892.7e-0731.1
TkA02G498240PF02367TsaE3543870.004117.8
TkA02G498240PF20030bpMoxR3573980.01615.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LF37拟南芥sp|Q9LF37|CLPB3_ARATH Chaperone protein ClpB3, chloroplastic86.800%Swiss-Prot高置信
Q8VYJ7拟南芥sp|Q8VYJ7|CLPB4_ARATH Chaperone protein ClpB4, mitochondrial67.200%Swiss-Prot高置信
Q75GT3水稻sp|Q75GT3|CLPB2_ORYSJ Chaperone protein ClpB2, chloroplastic86.200%Swiss-Prot高置信
Q0E3C8水稻sp|Q0E3C8|CLPB3_ORYSJ Chaperone protein ClpB3, mitochondrial68.900%Swiss-Prot高置信

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