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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G421570
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 107038520-107042311 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3418 bp · TkA02G421570|TK1151|cDNA

AGGTTAGGAGGAATGCATGTGATGAAGTAGGTCCACTACAATATTTTATACACCATTTGTCGATTGTCGTTTCATATCTTCACGGAATTCCCCAAAGAAATTTGCCTCAAAACATTCTTTCACACATCTCCATCTTCATAATCACATTCATTCTGTATAACCGTGTTTTTTTCATTTCAGTATGCGCTCCACATAGTTTCTGAAGGGAGAAAGTGTTGATGATGGGTTTTCTCCGACTTTTCGTCTTGGCATTCATCGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

3018 bp · TkA02G421570|TK1151|CDS

ATGATGGGTTTTCTCCGACTTTTCGTCTTGGCATTCATCGCAACAATTGCTTCTTTCACCATTAATGCCGATGAATCCCCTAAGCTAAACGATGAAGTTTTGGGACTTATAGTCTTCAAATCGTCTCTTACAGACCCATCATCACATTTATCTTCATGGAACCAAGATGATGAAACCCCATGTTCTTGGCAGTTCGTTACCTGCAACCCGGTCACTAGCAGGGTCACCGGACTTTCTCTTGACGGATTGAATCTTTCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1005 aa · TkA02G421570|TK1151|PROTEIN

MMGFLRLFVLAFIATIASFTINADESPKLNDEVLGLIVFKSSLTDPSSHLSSWNQDDETPCSWQFVTCNPVTSRVTGLSLDGLNLSGKIGRGLEKLQNLKVLSLAYNNFTGNINHELSLLPNLEQLNLSKNGFSNRIPGSLMSSGSIKFLDLSENSLSGPVSEEFFINCLSLRSLSLSGNNLEGPIPSSLSNCTTLNHLDLSNNRFSGNPDFKSGIWSMIRVRTLDLSHNSFSGSIPNGVFALHDLKELLLQGNDFTGAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G421570
TK1151 IDTkA02G421570
OH-1004 IDLXL04_014493
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.900 / OH-1004 64.535
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G421570
位置Chr02:107038520-107042311 (+)
描述Similar to At3g28040: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g28040
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28040 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 暂无已核实直接文献
At3g56370 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶IRK。 暂无已核实直接文献
At5g01890 富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶，可能参与维管组织发育。 暂无已核实直接文献
At1g12460 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g12460。 暂无已核实直接文献
At2g35620 参与细胞壁功能和纤维素生物合成相关的信号转导；该信号可能涉及1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC，乙烯前体）。
Two leucine-rich repeat receptor kinases mediate signaling, linking cell wall biosynthesis and ACC synthase in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.063354

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0090511 periclinal cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G31500
ath:AT3G28040
ath:AT3G56370
dosa:Os07g0568600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · TkA02G421570 · TK1151
内质网0.089
排名 2 · TkA02G421570 · TK1151
细胞质0.063
排名 3 · TkA02G421570 · TK1151
细胞核0.050
排名 4 · TkA02G421570 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA02G421570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_229-69 aa
PF29594LRR_SKP273-135 aa
PF00560LRR_177-96 aa
PF12799LRR_479-113 aa
PF23598LRR_1490-138 aa
PF23952LRR_EndoS92-155 aa
PF13855LRR_893-132 aa
PF14580LRR_993-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G421570PF08263LRRNT_229695.9e-1452.8
TkA02G421570PF29594LRR_SKP2731352e-1247.7
TkA02G421570PF00560LRR_177968.9e-54168.5
TkA02G421570PF12799LRR_4791136.4e-30103.2
TkA02G421570PF23598LRR_14901383e-2899.3
TkA02G421570PF23952LRR_EndoS921555.28.0
TkA02G421570PF13855LRR_8931324e-47158.5
TkA02G421570PF14580LRR_9931511.19.5
TkA02G421570PF13516LRR_6961111.5e-1041.0
TkA02G421570PF24758LRR_At5g56370961551.3e-0628.9
TkA02G421570PF23211LRR_LRWD1961331.4e-0525.6
TkA02G421570PF12799LRR_4971316.4e-30103.2
TkA02G421570PF00560LRR_1981188.9e-54168.5
TkA02G421570PF24141LRR_ComC1101891.6e-0525.5
TkA02G421570PF24048LRR_NXF1-51201825.4e-0523.6
TkA02G421570PF12799LRR_41211586.4e-30103.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRT1拟南芥sp|Q9LRT1|Y3804_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g2804070.700%Swiss-Prot高置信
Q9LY03拟南芥sp|Q9LY03|IRK_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK44.900%Swiss-Prot低置信
Q9LZV7拟南芥sp|Q9LZV7|PXC2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC242.000%Swiss-Prot低置信
C0LGE4拟南芥sp|C0LGE4|Y1124_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1246045.300%Swiss-Prot低置信
C0LGL9拟南芥sp|C0LGL9|FEI2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 242.300%Swiss-Prot低置信

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