公共表达完整矩阵与复现材料

Coverage、FPKM、TPM 各含 98,473 个固定重建位点和 109 个公共 RNA-seq Run;提供完整矩阵、样本来源、固定模型、校验值与核验/重建脚本。

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支持处理后数据复核与从 StringTie 输出重建矩阵。本轮未重跑原始 RNA-seq;不同研究的样本不能直接视作同一组生物学重复。

统一模型转录组 v4

统一固定模型 v4:109 样本、98,473 基因;Coverage、FPKM、TPM 三矩阵已独立逐值验收。旧 TK1151 矩阵与派生缓存已隔离。不同研究不能未经实验设计核对合并做差异分析。

已验收的新数据

109/109样本完成
98,473固定模型基因
3/3矩阵逐值验收

TK1151_UNIFORM_V4_20261003 · 2026-10-03T08:13:08.521949+00:00

模型基于 TK1151 / GWHBCHF;全体样本使用同一固定基因与转录本身份。基因 TPM、FPKM 是固定转录本实际输出之和;Coverage 沿用已验收的修复口径。三种单位分别发布,不提供本版本 counts/CPM,也不把旧值补入新数据。

指标 / 文件样本列SHA256下载
COVERAGE
TK1151_uniform_coverage_matrix.tsv
109d6f21ad1ac0322dafa3e027b2482defa6990d4a634a2df3495ee3a45f6e51ecaTSV
FPKM
TK1151_uniform_fpkm_matrix.tsv
109adbf1e60097207700fac9f09c644d26456db10f8472a031a5df2a9e255c3c90fTSV
TPM
TK1151_uniform_tpm_matrix.tsv
109499a3298df26fc29a72a53cecf5cb51427b03bdb530da56be3768ba0aa3b3dd1TSV

查询统一模型表达 下载 109 样本清单

身份映射与旧数据隔离

TKU 是统一模型的固定基因编号,不会重编号网站已有原始 ID。参考 ID 只作为映射关系;仅无歧义且未被隔离的一对一映射可作为查询别名。九个此前隔离的参考 ID 及一对多映射不自动恢复、不求和合并,可用明确的 TKU 编号查询各实际模型基因。新模型位点不等同于已注释蛋白编码基因。

旧 TK1151 表达层、四类合并矩阵入口、旧单样本导出及其共表达缓存已退出公开查询。原始文件保留在隔离记录中,用于追溯和受控回滚。OH-1004 与文献原始表达数据保留为明确独立的数据集,不与本模型合并。统一模型的新共表达网络尚未重算,旧 TK1151 网络不作为新模型结果展示。

统一基因身份 TSV · 参考映射关系 TSV · 版本清单 JSON · 入库验收 JSON