同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00369

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00369

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00369 ChrUn 3607477-4202312 Chr01 45713961-46305287 - High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00369`	ChrUn:3607477-4202312	Chr01:45713961-46305287	-	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG014060 → LXL04_002329

100.0%

TkAUNG014070 → LXL04_002328

100.0%

TkAUNG014080 → LXL04_002327

100.0%

TkAUNG014220 → LXL04_002324

99.0%

TkAUNG014350 → LXL04_002322

100.0%

TkAUNG014670 → LXL04_002320

99.8%

TkAUNG014790 → LXL04_002318

99.2%

TkAUNG015030 → LXL04_002315

85.4%

TkAUNG015310 → LXL04_002313

99.9%

TkAUNG015320 → LXL04_002312

100.0%

TkAUNG015360 → LXL04_002311

69.4%

TkAUNG015370 → LXL04_002310

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG014060`	`LXL04_002329`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	52.486 / 71.97	待复核
`TkAUNG014070`	`LXL04_002328`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	54.167 / 25.896	Complex
`TkAUNG014080`	`LXL04_002327`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	100.0 / 98.824	Strict
`TkAUNG014220`	`LXL04_002324`	`JCVI_TKOH_00369`	99.0	82.906 / 77.912	Probable
`TkAUNG014350`	`LXL04_002322`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkAUNG014670`	`LXL04_002320`	`JCVI_TKOH_00369`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG014790`	`LXL04_002318`	`JCVI_TKOH_00369`	99.2	82.639 / 100.0	待复核
`TkAUNG015030`	`LXL04_002315`	`JCVI_TKOH_00369`	85.4	65.926 / 60.959	Complex
`TkAUNG015310`	`LXL04_002313`	`JCVI_TKOH_00369`	99.9	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG015320`	`LXL04_002312`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	23.118 / 28.477	Complex
`TkAUNG015360`	`LXL04_002311`	`JCVI_TKOH_00369`	69.4	95.349 / 57.716	Complex
`TkAUNG015370`	`LXL04_002310`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG015580`	`LXL04_002304`	`JCVI_TKOH_00369`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG015590`	`LXL04_002303`	`JCVI_TKOH_00369`	97.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG015770`	`LXL04_002301`	`JCVI_TKOH_00369`	99.2	100.0 / 100.0	Complex