同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00312
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 40
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00312当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00312 |
Chr07:95438577-97247323 | Chr06:108842459-110980414 | mixed | 40 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 40 · 当前范围 1–40 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA07G380780 | LXL04_030134 | JCVI_TKOH_00312 | 98.7 | 100.0 / 98.551 | Complex |
TkA07G380800 | LXL04_030135 | JCVI_TKOH_00312 | 85.1 | 98.723 / 29.668 | Complex |
TkA07G380810 | LXL04_030135 | JCVI_TKOH_00312 | 76.1 | 99.604 / 42.008 | 待复核 |
TkA07G380820 | LXL04_030136 | JCVI_TKOH_00312 | 95.4 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G381060 | LXL04_030140 | JCVI_TKOH_00312 | 95.4 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G381440 | LXL04_030141 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA07G381490 | LXL04_030142 | JCVI_TKOH_00312 | 93.9 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA07G381550 | LXL04_030143 | JCVI_TKOH_00312 | 67.7 | 96.124 / 45.091 | Complex |
TkA07G381560 | LXL04_030143 | JCVI_TKOH_00312 | 99.0 | 100.0 / 69.818 | 待复核 |
TkA07G381680 | LXL04_030144 | JCVI_TKOH_00312 | 89.1 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA07G381720 | LXL04_030146 | JCVI_TKOH_00312 | 99.1 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G382660 | LXL04_030152 | JCVI_TKOH_00312 | 94.3 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA07G382670 | LXL04_030153 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 96.0 / 53.659 | 待复核 |
TkA07G383050 | LXL04_030161 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 37.786 / 28.696 | 待复核 |
TkA07G383060 | LXL04_030162 | JCVI_TKOH_00312 | 96.9 | 98.246 / 96.79 | Complex |
TkA07G383340 | LXL04_030167 | JCVI_TKOH_00312 | 99.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA07G383410 | LXL04_030169 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 100.0 / 98.586 | Strict |
TkA07G383750 | LXL04_030170 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G383880 | LXL04_030172 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G384220 | LXL04_030173 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 100.0 / 72.159 | Complex |
TkA07G384310 | LXL04_030176 | JCVI_TKOH_00312 | 100.0 | 93.312 / 46.434 | 待复核 |
TkA07G384320 | LXL04_030177 | JCVI_TKOH_00312 | 99.3 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G384330 | LXL04_030178 | JCVI_TKOH_00312 | 99.3 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G384340 | LXL04_030179 | JCVI_TKOH_00312 | 99.8 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G384350 | LXL04_030180 | JCVI_TKOH_00312 | 99.1 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G384360 | LXL04_030183 | JCVI_TKOH_00312 | 98.6 | 98.884 / 90.353 | Strict |
TkA07G384400 | LXL04_030184 | JCVI_TKOH_00312 | 90.8 | 94.631 / 22.329 | Complex |
TkA07G384440 | LXL04_030185 | JCVI_TKOH_00312 | 98.2 | 99.743 / 44.495 | 待复核 |
TkA07G385710 | LXL04_030188 | JCVI_TKOH_00312 | 89.9 | 100.0 / 74.194 | 待复核 |
TkA07G385890 | LXL04_030191 | JCVI_TKOH_00312 | 96.9 | 100.0 / 69.492 | 待复核 |
TkA07G385940 | LXL04_030192 | JCVI_TKOH_00312 | 97.0 | 100.0 / 84.08 | Strict |
TkA07G386130 | LXL04_030196 | JCVI_TKOH_00312 | 96.5 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G386140 | LXL04_030197 | JCVI_TKOH_00312 | 94.0 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA07G386620 | LXL04_030200 | JCVI_TKOH_00312 | 98.6 | 100.0 / 80.077 | Strict |
TkA07G386750 | LXL04_030202 | JCVI_TKOH_00312 | 92.6 | 100.0 / 100.0 | Probable |
TkA07G386760 | LXL04_030203 | JCVI_TKOH_00312 | 99.4 | 100.0 / 88.481 | Strict |
TkA07G387440 | LXL04_030209 | JCVI_TKOH_00312 | 99.6 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA07G387480 | LXL04_030210 | JCVI_TKOH_00312 | 99.9 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA07G387500 | LXL04_030211 | JCVI_TKOH_00312 | 96.7 | 61.0 / 31.282 | Complex |
TkA07G387750 | LXL04_030213 | JCVI_TKOH_00312 | 90.6 | 70.833 / 57.432 | Complex |