同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00089
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 9
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00089

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00089 Chr02 95754663-95953121 Chr03 42454762-42794107 mixed High 9 anchors
Chr02 95754663-95953121 Chr03 42454762-42794107 JCVI_TKOH_00089 · 9 gene pairs TkA02G376340 | LXL04_014131 | 94.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G376350 | LXL04_014132 | 87.9% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkA02G376420 | LXL04_014133 | 100.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G376460 | LXL04_014136 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G376670 | LXL04_014136 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G376710 | LXL04_014137 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G377010 | LXL04_014140 | 99.1% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G377020 | LXL04_014141 | 93.4% | non_reciprocal_best_hit | Complex TkA02G377030 | LXL04_014142 | 94.2% | multi_source_to_OH1004 | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00089 Chr02:95754663-95953121 Chr03:42454762-42794107 mixed 9 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 9 · 当前范围 1–9 · 页码 1/1

TkA02G376340 → LXL04_014131
94.0%
TkA02G376350 → LXL04_014132
87.9%
TkA02G376420 → LXL04_014133
100.0%
TkA02G376460 → LXL04_014136
100.0%
TkA02G376670 → LXL04_014136
100.0%
TkA02G376710 → LXL04_014137
100.0%
TkA02G377010 → LXL04_014140
99.1%
TkA02G377020 → LXL04_014141
93.4%
TkA02G377030 → LXL04_014142
94.2%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA02G376340LXL04_014131JCVI_TKOH_0008994.089.665 / 50.0Complex
TkA02G376350LXL04_014132JCVI_TKOH_0008987.997.704 / 64.877待复核
TkA02G376420LXL04_014133JCVI_TKOH_00089100.095.612 / 69.815Complex
TkA02G376460LXL04_014136JCVI_TKOH_00089100.091.667 / 37.643待复核
TkA02G376670LXL04_014136JCVI_TKOH_00089100.091.667 / 37.643待复核
TkA02G376710LXL04_014137JCVI_TKOH_00089100.0100.0 / 58.125待复核
TkA02G377010LXL04_014140JCVI_TKOH_0008999.192.241 / 23.094待复核
TkA02G377020LXL04_014141JCVI_TKOH_0008993.477.344 / 94.203Complex
TkA02G377030LXL04_014142JCVI_TKOH_0008994.291.195 / 91.124Complex