同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00059
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 9
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00059

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00059 Chr01 147137758-147242810 Chr08 53685757-53797687 - Medium 9 anchors
Chr01 147137758-147242810 Chr08 53685757-53797687 JCVI_TKOH_00059 · 9 gene pairs TkA01G585110 | LXL04_037135 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA01G585120 | LXL04_037133 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA01G585150 | LXL04_037132 | 98.9% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA01G585170 | LXL04_037131 | 85.2% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA01G585210 | LXL04_037130 | 94.2% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA01G585380 | LXL04_037129 | 99.5% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkA01G585390 | LXL04_037128 | 99.4% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA01G585430 | LXL04_037127 | 97.8% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA01G585440 | LXL04_037126 | 100.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00059 Chr01:147137758-147242810 Chr08:53685757-53797687 - 9 中等置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 9 · 当前范围 1–9 · 页码 1/1

TkA01G585110 → LXL04_037135
100.0%
TkA01G585120 → LXL04_037133
100.0%
TkA01G585150 → LXL04_037132
98.9%
TkA01G585170 → LXL04_037131
85.2%
TkA01G585210 → LXL04_037130
94.2%
TkA01G585380 → LXL04_037129
99.5%
TkA01G585390 → LXL04_037128
99.4%
TkA01G585430 → LXL04_037127
97.8%
TkA01G585440 → LXL04_037126
100.0%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA01G585110LXL04_037135JCVI_TKOH_00059100.0100.0 / 100.0Probable
TkA01G585120LXL04_037133JCVI_TKOH_00059100.0100.0 / 100.0Probable
TkA01G585150LXL04_037132JCVI_TKOH_0005998.9100.0 / 100.0Complex
TkA01G585170LXL04_037131JCVI_TKOH_0005985.2100.0 / 93.802Complex
TkA01G585210LXL04_037130JCVI_TKOH_0005994.2100.0 / 100.0Complex
TkA01G585380LXL04_037129JCVI_TKOH_0005999.5100.0 / 100.0待复核
TkA01G585390LXL04_037128JCVI_TKOH_0005999.4100.0 / 100.0Complex
TkA01G585430LXL04_037127JCVI_TKOH_0005997.860.135 / 72.951Complex
TkA01G585440LXL04_037126JCVI_TKOH_00059100.0100.0 / 82.955Complex