同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00017

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 17

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00017

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00017 Chr01 72628303-75519584 Chr01 94063768-97117184 mixed High 17 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00017`	Chr01:72628303-75519584	Chr01:94063768-97117184	mixed	17	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 17 · 当前范围 1–17 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G291450 → LXL04_003717

86.8%

TkA01G293340 → LXL04_003711

100.0%

TkA01G295170 → LXL04_003709

99.8%

TkA01G295810 → LXL04_003707

95.1%

TkA01G295820 → LXL04_003706

100.0%

TkA01G295850 → LXL04_003705

98.4%

TkA01G296040 → LXL04_003704

99.6%

TkA01G296480 → LXL04_003684

99.1%

TkA01G298100 → LXL04_003689

98.7%

TkA01G298240 → LXL04_003692

100.0%

TkA01G298250 → LXL04_003693

100.0%

TkA01G298270 → LXL04_003694

93.5%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G291450`	`LXL04_003717`	`JCVI_TKOH_00017`	86.8	99.286 / 54.513	待复核
`TkA01G293340`	`LXL04_003711`	`JCVI_TKOH_00017`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G295170`	`LXL04_003709`	`JCVI_TKOH_00017`	99.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G295810`	`LXL04_003707`	`JCVI_TKOH_00017`	95.1	68.212 / 26.142	Complex
`TkA01G295820`	`LXL04_003706`	`JCVI_TKOH_00017`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G295850`	`LXL04_003705`	`JCVI_TKOH_00017`	98.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G296040`	`LXL04_003704`	`JCVI_TKOH_00017`	99.6	99.867 / 97.287	Strict
`TkA01G296480`	`LXL04_003684`	`JCVI_TKOH_00017`	99.1	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G298100`	`LXL04_003689`	`JCVI_TKOH_00017`	98.7	98.177 / 100.0	Complex
`TkA01G298240`	`LXL04_003692`	`JCVI_TKOH_00017`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G298250`	`LXL04_003693`	`JCVI_TKOH_00017`	100.0	82.222 / 97.368	待复核
`TkA01G298270`	`LXL04_003694`	`JCVI_TKOH_00017`	93.5	94.055 / 93.83	Probable
`TkA01G300120`	`LXL04_003697`	`JCVI_TKOH_00017`	100.0	88.073 / 24.552	待复核
`TkA01G302380`	`LXL04_003694`	`JCVI_TKOH_00017`	27.9	68.398 / 41.915	Complex
`TkA01G303360`	`LXL04_003683`	`JCVI_TKOH_00017`	95.6	100.0 / 71.165	Probable
`TkA01G303370`	`LXL04_003681`	`JCVI_TKOH_00017`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G303760`	`LXL04_003680`	`JCVI_TKOH_00017`	99.2	100.0 / 100.0	Strict