同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00379

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00379

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00379 ChrUn 22128356-22540042 Chr01 167899844-168391741 mixed High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00379`	ChrUn:22128356-22540042	Chr01:167899844-168391741	mixed	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG077080 → LXL04_005540

95.4%

TkAUNG077390 → LXL04_005542

77.7%

TkAUNG077410 → LXL04_005542

84.7%

TkAUNG077420 → LXL04_005543

91.9%

TkAUNG077510 → LXL04_005544

97.4%

TkAUNG077950 → LXL04_005546

100.0%

TkAUNG078040 → LXL04_005547

99.6%

TkAUNG078100 → LXL04_005548

100.0%

TkAUNG078380 → LXL04_005549

98.0%

TkAUNG078510 → LXL04_005550

98.0%

TkAUNG078640 → LXL04_005553

98.5%

TkAUNG078650 → LXL04_005554

99.5%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG077080`	`LXL04_005540`	`JCVI_TKOH_00379`	95.4	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG077390`	`LXL04_005542`	`JCVI_TKOH_00379`	77.7	89.071 / 65.448	Complex
`TkAUNG077410`	`LXL04_005542`	`JCVI_TKOH_00379`	84.7	97.34 / 28.702	Complex
`TkAUNG077420`	`LXL04_005543`	`JCVI_TKOH_00379`	91.9	100.0 / 69.816	Complex
`TkAUNG077510`	`LXL04_005544`	`JCVI_TKOH_00379`	97.4	97.854 / 35.404	待复核
`TkAUNG077950`	`LXL04_005546`	`JCVI_TKOH_00379`	100.0	97.576 / 96.988	Complex
`TkAUNG078040`	`LXL04_005547`	`JCVI_TKOH_00379`	99.6	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG078100`	`LXL04_005548`	`JCVI_TKOH_00379`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG078380`	`LXL04_005549`	`JCVI_TKOH_00379`	98.0	92.661 / 38.403	待复核
`TkAUNG078510`	`LXL04_005550`	`JCVI_TKOH_00379`	98.0	82.353 / 63.226	Complex
`TkAUNG078640`	`LXL04_005553`	`JCVI_TKOH_00379`	98.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG078650`	`LXL04_005554`	`JCVI_TKOH_00379`	99.5	99.746 / 89.318	Complex
`TkAUNG078740`	`LXL04_005556`	`JCVI_TKOH_00379`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG078750`	`LXL04_005557`	`JCVI_TKOH_00379`	98.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkAUNG078780`	`LXL04_005558`	`JCVI_TKOH_00379`	98.9	100.0 / 100.0	待复核