同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00268

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 25

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00268

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00268 Chr06 11697587-12165767 Chr05 115576569-116050957 + High 25 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00268`	Chr06:11697587-12165767	Chr05:115576569-116050957	+	25	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 25 · 当前范围 1–25 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G043270 → LXL04_025704

67.2%

TkA06G043520 → LXL04_025706

92.4%

TkA06G043580 → LXL04_025707

100.0%

TkA06G043640 → LXL04_025708

99.9%

TkA06G043650 → LXL04_025709

100.0%

TkA06G043680 → LXL04_025710

100.0%

TkA06G043720 → LXL04_025712

100.0%

TkA06G043730 → LXL04_025713

99.8%

TkA06G043860 → LXL04_025714

99.0%

TkA06G043900 → LXL04_025715

98.7%

TkA06G044280 → LXL04_025717

91.4%

TkA06G044290 → LXL04_025718

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G043270`	`LXL04_025704`	`JCVI_TKOH_00268`	67.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G043520`	`LXL04_025706`	`JCVI_TKOH_00268`	92.4	100.0 / 90.801	Complex
`TkA06G043580`	`LXL04_025707`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G043640`	`LXL04_025708`	`JCVI_TKOH_00268`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G043650`	`LXL04_025709`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	99.048 / 92.035	Complex
`TkA06G043680`	`LXL04_025710`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G043720`	`LXL04_025712`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G043730`	`LXL04_025713`	`JCVI_TKOH_00268`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G043860`	`LXL04_025714`	`JCVI_TKOH_00268`	99.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G043900`	`LXL04_025715`	`JCVI_TKOH_00268`	98.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G044280`	`LXL04_025717`	`JCVI_TKOH_00268`	91.4	100.0 / 95.044	Complex
`TkA06G044290`	`LXL04_025718`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G044420`	`LXL04_025719`	`JCVI_TKOH_00268`	86.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G044450`	`LXL04_025720`	`JCVI_TKOH_00268`	98.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G044470`	`LXL04_025721`	`JCVI_TKOH_00268`	68.5	100.0 / 74.933	Complex
`TkA06G044480`	`LXL04_025722`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G044550`	`LXL04_025723`	`JCVI_TKOH_00268`	78.0	99.543 / 48.873	待复核
`TkA06G044560`	`LXL04_025725`	`JCVI_TKOH_00268`	98.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G044590`	`LXL04_025726`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G044600`	`LXL04_025727`	`JCVI_TKOH_00268`	91.5	96.486 / 77.666	Complex
`TkA06G044650`	`LXL04_025728`	`JCVI_TKOH_00268`	89.3	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G044660`	`LXL04_025729`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	65.385 / 31.925	待复核
`TkA06G044700`	`LXL04_025730`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 87.135	Complex
`TkA06G044820`	`LXL04_025733`	`JCVI_TKOH_00268`	99.6	86.513 / 71.467	Complex
`TkA06G044850`	`LXL04_025735`	`JCVI_TKOH_00268`	100.0	100.0 / 100.0	Complex