基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_025735
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 116049018-116050957
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1383 bp · LXL04_025735|LXL04_025735|OH1004|cDNA
ATGGGTTGTTTTTCTTGTTTCGATTCGAGGGCTGATGAAAAATCGAATCCTCAAAAAGTTGGGGCTGATCGTTCTGAAGTCCACCCATCCGCCCCCTCCAATATCTCAAGATTACCTTCCGGTGTTGATAGACTGAAATCTAGAAATAATGTGAGTTTAAGAAGGGAATCTTCGGGTCCAAAAGACAATCCATATAGTCAAATCGCTGCCCAAACATTCACTTTCCGTGAGCTGGCAGCTGCCACAAACAATTTTAGCCC...
CDS
下载 CDS FASTA1383 bp · LXL04_025735|LXL04_025735|OH1004|CDS
ATGGGTTGTTTTTCTTGTTTCGATTCGAGGGCTGATGAAAAATCGAATCCTCAAAAAGTTGGGGCTGATCGTTCTGAAGTCCACCCATCCGCCCCCTCCAATATCTCAAGATTACCTTCCGGTGTTGATAGACTGAAATCTAGAAATAATGTGAGTTTAAGAAGGGAATCTTCGGGTCCAAAAGACAATCCATATAGTCAAATCGCTGCCCAAACATTCACTTTCCGTGAGCTGGCAGCTGCCACAAACAATTTTAGCCC...
460 aa · LXL04_025735|LXL04_025735|OH1004|PROTEIN
MGCFSCFDSRADEKSNPQKVGADRSEVHPSAPSNISRLPSGVDRLKSRNNVSLRRESSGPKDNPYSQIAAQTFTFRELAAATNNFSPDCFLGEGGFGHVYRGRLQSSGQVVAVKQLDRNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLIGYCADGDQRLLVYEFMPLGSLEDHLHDLPPDREALDWNTRMKIAAGAAKGLEFLHDKANPPVIYRDFKSSNILLGEGFQPKLSDFGLAKLGPTGDKSHVSTRVMGTYGYCAPEY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_025735 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_025735 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:116049018-116050957 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to PBS1: Serine/threonine-protein kinase PBS1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程 GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程 GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G07870 ath:AT5G02800 ath:AT5G13160 ath:AT5G18610 dosa:Os05g0372100 osa:4338592 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.722
细胞质0.230
细胞核0.228
内质网0.036
高尔基体0.027
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase90-294 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr91-292 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_025735 | PF00069.32 | Pkinase | 90 | 294 | 1.9e-42 | 146.2 |
| LXL04_025735 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 91 | 292 | 3e-43 | 148.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FE20 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase PBS1 | 76.026% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q1PDV6 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase PBL27 | 61.240% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q0WRY5 | 拟南芥 | Probable serine/threonine-protein kinase PBL7 | 76.266% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LQQ8 | 拟南芥 | Probable serine/threonine-protein kinase PBL5 | 71.197% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q6I5Q6 | 水稻 | Receptor-like cytoplasmic kinase 185 | 63.563% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |