同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00245

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 24

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00245

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00245 Chr05 107084984-107794334 Chr04 138669809-139124490 mixed High 24 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00245`	Chr05:107084984-107794334	Chr04:138669809-139124490	mixed	24	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 24 · 当前范围 1–24 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA05G429350 → LXL04_021885

99.3%

TkA05G429360 → LXL04_021884

96.9%

TkA05G429410 → LXL04_021874

100.0%

TkA05G429460 → LXL04_021878

97.9%

TkA05G429530 → LXL04_021874

100.0%

TkA05G429540 → LXL04_021873

95.6%

TkA05G429570 → LXL04_021872

89.1%

TkA05G429630 → LXL04_021870

98.0%

TkA05G429720 → LXL04_021868

99.2%

TkA05G429740 → LXL04_021867

100.0%

TkA05G430000 → LXL04_021865

100.0%

TkA05G430030 → LXL04_021864

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G429350`	`LXL04_021885`	`JCVI_TKOH_00245`	99.3	100.0 / 60.835	待复核
`TkA05G429360`	`LXL04_021884`	`JCVI_TKOH_00245`	96.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G429410`	`LXL04_021874`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 82.812	待复核
`TkA05G429460`	`LXL04_021878`	`JCVI_TKOH_00245`	97.9	94.236 / 93.3	Complex
`TkA05G429530`	`LXL04_021874`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 82.812	Complex
`TkA05G429540`	`LXL04_021873`	`JCVI_TKOH_00245`	95.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G429570`	`LXL04_021872`	`JCVI_TKOH_00245`	89.1	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G429630`	`LXL04_021870`	`JCVI_TKOH_00245`	98.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G429720`	`LXL04_021868`	`JCVI_TKOH_00245`	99.2	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G429740`	`LXL04_021867`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 71.849	Probable
`TkA05G430000`	`LXL04_021865`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G430030`	`LXL04_021864`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G430400`	`LXL04_021862`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 93.368	Strict
`TkA05G430420`	`LXL04_021861`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G430430`	`LXL04_021860`	`JCVI_TKOH_00245`	99.0	98.113 / 22.366	待复核
`TkA05G430450`	`LXL04_021860`	`JCVI_TKOH_00245`	97.0	97.115 / 21.72	待复核
`TkA05G430470`	`LXL04_021859`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G430500`	`LXL04_021858`	`JCVI_TKOH_00245`	98.1	98.165 / 92.609	Complex
`TkA05G430590`	`LXL04_021857`	`JCVI_TKOH_00245`	97.3	99.678 / 49.411	待复核
`TkA05G430600`	`LXL04_021857`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	99.482 / 45.247	待复核
`TkA05G430620`	`LXL04_021856`	`JCVI_TKOH_00245`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G430760`	`LXL04_021854`	`JCVI_TKOH_00245`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G430770`	`LXL04_021853`	`JCVI_TKOH_00245`	99.1	93.603 / 50.751	待复核
`TkA05G431300`	`LXL04_021852`	`JCVI_TKOH_00245`	98.5	94.138 / 76.111	Complex