同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00233

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 23

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00233

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00233 Chr05 30747195-32361941 Chr04 46673623-48183072 mixed High 23 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00233`	Chr05:30747195-32361941	Chr04:46673623-48183072	mixed	23	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 23 · 当前范围 1–23 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA05G115160 → LXL04_019996

88.2%

TkA05G115170 → LXL04_019997

100.0%

TkA05G115510 → LXL04_019998

95.3%

TkA05G115630 → LXL04_019999

100.0%

TkA05G115970 → LXL04_020000

97.7%

TkA05G116330 → LXL04_020002

87.7%

TkA05G116590 → LXL04_020002

92.0%

TkA05G116820 → LXL04_020003

91.9%

TkA05G116880 → LXL04_020004

98.0%

TkA05G117110 → LXL04_020017

72.3%

TkA05G117410 → LXL04_020010

90.4%

TkA05G117420 → LXL04_020030

84.8%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G115160`	`LXL04_019996`	`JCVI_TKOH_00233`	88.2	99.631 / 99.468	待复核
`TkA05G115170`	`LXL04_019997`	`JCVI_TKOH_00233`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G115510`	`LXL04_019998`	`JCVI_TKOH_00233`	95.3	80.556 / 97.623	Complex
`TkA05G115630`	`LXL04_019999`	`JCVI_TKOH_00233`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G115970`	`LXL04_020000`	`JCVI_TKOH_00233`	97.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G116330`	`LXL04_020002`	`JCVI_TKOH_00233`	87.7	87.124 / 20.417	Complex
`TkA05G116590`	`LXL04_020002`	`JCVI_TKOH_00233`	92.0	100.0 / 97.812	Probable
`TkA05G116820`	`LXL04_020003`	`JCVI_TKOH_00233`	91.9	100.0 / 100.0	Probable
`TkA05G116880`	`LXL04_020004`	`JCVI_TKOH_00233`	98.0	100.0 / 79.767	Probable
`TkA05G117110`	`LXL04_020017`	`JCVI_TKOH_00233`	72.3	99.25 / 79.741	待复核
`TkA05G117410`	`LXL04_020010`	`JCVI_TKOH_00233`	90.4	92.517 / 50.752	待复核
`TkA05G117420`	`LXL04_020030`	`JCVI_TKOH_00233`	84.8	90.055 / 93.75	Complex
`TkA05G117740`	`LXL04_020026`	`JCVI_TKOH_00233`	79.8	97.906 / 62.258	待复核
`TkA05G117960`	`LXL04_020029`	`JCVI_TKOH_00233`	100.0	100.0 / 94.958	待复核
`TkA05G117980`	`LXL04_020030`	`JCVI_TKOH_00233`	73.3	89.944 / 100.0	Complex
`TkA05G118170`	`LXL04_020010`	`JCVI_TKOH_00233`	92.5	74.074 / 30.075	Complex
`TkA05G118180`	`LXL04_020030`	`JCVI_TKOH_00233`	88.2	99.219 / 72.159	Complex
`TkA05G118840`	`LXL04_020010`	`JCVI_TKOH_00233`	92.4	80.864 / 49.624	Complex
`TkA05G118850`	`LXL04_020030`	`JCVI_TKOH_00233`	77.8	86.029 / 66.477	Complex
`TkA05G121020`	`LXL04_020030`	`JCVI_TKOH_00233`	79.2	98.361 / 68.182	Complex
`TkA05G121990`	`LXL04_020033`	`JCVI_TKOH_00233`	98.9	55.108 / 100.0	待复核
`TkA05G122250`	`LXL04_020041`	`JCVI_TKOH_00233`	95.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G122460`	`LXL04_020043`	`JCVI_TKOH_00233`	99.6	100.0 / 100.0	Strict