同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00168
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 12
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00168

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00168 Chr03 113812521-114275614 Chr07 42649331-43123431 mixed High 12 anchors
Chr03 113812521-114275614 Chr07 42649331-43123431 JCVI_TKOH_00168 · 12 gene pairs TkA03G455810 | LXL04_033396 | 99.2% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA03G456100 | LXL04_033394 | 98.4% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA03G456160 | LXL04_033396 | 96.3% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G456170 | LXL04_033397 | 99.7% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G456180 | LXL04_033398 | 90.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G456760 | LXL04_033401 | 96.2% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA03G456990 | LXL04_033400 | 99.3% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G457560 | LXL04_033402 | 98.8% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA03G457570 | LXL04_033403 | 96.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G457630 | LXL04_033404 | 81.5% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA03G457680 | LXL04_033405 | 87.9% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkA03G457770 | LXL04_033406 | 60.2% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00168 Chr03:113812521-114275614 Chr07:42649331-43123431 mixed 12 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 12 · 当前范围 1–12 · 页码 1/1

TkA03G455810 → LXL04_033396
99.2%
TkA03G456100 → LXL04_033394
98.4%
TkA03G456160 → LXL04_033396
96.3%
TkA03G456170 → LXL04_033397
99.7%
TkA03G456180 → LXL04_033398
90.0%
TkA03G456760 → LXL04_033401
96.2%
TkA03G456990 → LXL04_033400
99.3%
TkA03G457560 → LXL04_033402
98.8%
TkA03G457570 → LXL04_033403
96.0%
TkA03G457630 → LXL04_033404
81.5%
TkA03G457680 → LXL04_033405
87.9%
TkA03G457770 → LXL04_033406
60.2%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA03G455810LXL04_033396JCVI_TKOH_0016899.2100.0 / 47.917待复核
TkA03G456100LXL04_033394JCVI_TKOH_0016898.498.514 / 96.185Probable
TkA03G456160LXL04_033396JCVI_TKOH_0016896.3100.0 / 95.833Complex
TkA03G456170LXL04_033397JCVI_TKOH_0016899.7100.0 / 100.0Complex
TkA03G456180LXL04_033398JCVI_TKOH_0016890.085.849 / 75.676Complex
TkA03G456760LXL04_033401JCVI_TKOH_0016896.2100.0 / 100.0Probable
TkA03G456990LXL04_033400JCVI_TKOH_0016899.3100.0 / 100.0Complex
TkA03G457560LXL04_033402JCVI_TKOH_0016898.8100.0 / 100.0Probable
TkA03G457570LXL04_033403JCVI_TKOH_0016896.097.826 / 67.909Complex
TkA03G457630LXL04_033404JCVI_TKOH_0016881.5100.0 / 54.735Complex
TkA03G457680LXL04_033405JCVI_TKOH_0016887.998.228 / 100.0待复核
TkA03G457770LXL04_033406JCVI_TKOH_0016860.2100.0 / 100.0待复核