同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00137

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 16

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00137

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00137 Chr03 62962997-66337089 Chr02 78931780-82267960 mixed High 16 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00137`	Chr03:62962997-66337089	Chr02:78931780-82267960	mixed	16	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 16 · 当前范围 1–16 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G253950 → LXL04_007996

98.8%

TkA03G254730 → LXL04_007998

100.0%

TkA03G256260 → LXL04_008001

98.0%

TkA03G257350 → LXL04_008002

100.0%

TkA03G258050 → LXL04_008006

82.5%

TkA03G258360 → LXL04_008010

97.7%

TkA03G258760 → LXL04_008013

96.1%

TkA03G259870 → LXL04_008015

96.4%

TkA03G260000 → LXL04_008016

78.4%

TkA03G260260 → LXL04_008016

83.3%

TkA03G260600 → LXL04_008033

100.0%

TkA03G261000 → LXL04_008035

99.3%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G253950`	`LXL04_007996`	`JCVI_TKOH_00137`	98.8	100.0 / 92.857	待复核
`TkA03G254730`	`LXL04_007998`	`JCVI_TKOH_00137`	100.0	100.0 / 76.101	Probable
`TkA03G256260`	`LXL04_008001`	`JCVI_TKOH_00137`	98.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G257350`	`LXL04_008002`	`JCVI_TKOH_00137`	100.0	100.0 / 95.517	Strict
`TkA03G258050`	`LXL04_008006`	`JCVI_TKOH_00137`	82.5	100.0 / 82.374	待复核
`TkA03G258360`	`LXL04_008010`	`JCVI_TKOH_00137`	97.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G258760`	`LXL04_008013`	`JCVI_TKOH_00137`	96.1	97.368 / 92.922	Strict
`TkA03G259870`	`LXL04_008015`	`JCVI_TKOH_00137`	96.4	100.0 / 95.883	Strict
`TkA03G260000`	`LXL04_008016`	`JCVI_TKOH_00137`	78.4	95.161 / 35.387	Complex
`TkA03G260260`	`LXL04_008016`	`JCVI_TKOH_00137`	83.3	100.0 / 42.18	Complex
`TkA03G260600`	`LXL04_008033`	`JCVI_TKOH_00137`	100.0	99.8 / 58.775	待复核
`TkA03G261000`	`LXL04_008035`	`JCVI_TKOH_00137`	99.3	96.903 / 100.0	Strict
`TkA03G261050`	`LXL04_008037`	`JCVI_TKOH_00137`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G261840`	`LXL04_008040`	`JCVI_TKOH_00137`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G264010`	`LXL04_008040`	`JCVI_TKOH_00137`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA03G267890`	`LXL04_008045`	`JCVI_TKOH_00137`	97.8	100.0 / 100.0	Strict