同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00131
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 36
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00131当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00131 |
Chr03:35073187-38388365 | Chr02:39345514-42058755 | mixed | 36 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 36 · 当前范围 1–36 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA03G137290 | LXL04_007205 | JCVI_TKOH_00131 | 100.0 | 93.789 / 93.789 | Strict |
TkA03G137480 | LXL04_007206 | JCVI_TKOH_00131 | 98.5 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA03G137600 | LXL04_007207 | JCVI_TKOH_00131 | 98.5 | 100.0 / 82.09 | Complex |
TkA03G137870 | LXL04_007211 | JCVI_TKOH_00131 | 86.5 | 58.796 / 97.872 | Complex |
TkA03G137900 | LXL04_007212 | JCVI_TKOH_00131 | 99.4 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA03G137910 | LXL04_007213 | JCVI_TKOH_00131 | 100.0 | 87.978 / 100.0 | Complex |
TkA03G140920 | LXL04_007217 | JCVI_TKOH_00131 | 98.5 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA03G140940 | LXL04_007218 | JCVI_TKOH_00131 | 99.6 | 100.0 / 87.218 | Strict |
TkA03G141100 | LXL04_007220 | JCVI_TKOH_00131 | 98.8 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA03G141130 | LXL04_007221 | JCVI_TKOH_00131 | 98.8 | 100.0 / 91.707 | Complex |
TkA03G141680 | LXL04_007222 | JCVI_TKOH_00131 | 89.2 | 66.935 / 24.058 | Complex |
TkA03G141690 | LXL04_007222 | JCVI_TKOH_00131 | 92.8 | 87.113 / 52.174 | 待复核 |
TkA03G142280 | LXL04_007223 | JCVI_TKOH_00131 | 98.8 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA03G142430 | LXL04_007225 | JCVI_TKOH_00131 | 80.6 | 96.677 / 59.568 | 待复核 |
TkA03G142550 | LXL04_007226 | JCVI_TKOH_00131 | 100.0 | 100.0 / 55.944 | 待复核 |
TkA03G142570 | LXL04_007227 | JCVI_TKOH_00131 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA03G142580 | LXL04_007228 | JCVI_TKOH_00131 | 98.3 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA03G143900 | LXL04_007231 | JCVI_TKOH_00131 | 100.0 | 90.515 / 98.817 | Strict |
TkA03G144280 | LXL04_007232 | JCVI_TKOH_00131 | 99.8 | 98.165 / 100.0 | 待复核 |
TkA03G144680 | LXL04_007232 | JCVI_TKOH_00131 | 99.4 | 98.165 / 100.0 | Complex |
TkA03G145280 | LXL04_007239 | JCVI_TKOH_00131 | 55.1 | 100.0 / 64.484 | Complex |
TkA03G145430 | LXL04_007240 | JCVI_TKOH_00131 | 77.6 | 100.0 / 94.855 | 待复核 |
TkA03G145460 | LXL04_007241 | JCVI_TKOH_00131 | 95.4 | 100.0 / 31.665 | 待复核 |
TkA03G145470 | LXL04_007241 | JCVI_TKOH_00131 | 84.2 | 86.0 / 9.19 | Complex |
TkA03G146310 | LXL04_007247 | JCVI_TKOH_00131 | 96.1 | 72.028 / 9.131 | Complex |
TkA03G146320 | LXL04_007248 | JCVI_TKOH_00131 | 98.1 | 78.195 / 63.03 | Complex |
TkA03G146330 | LXL04_007249 | JCVI_TKOH_00131 | 77.6 | 100.0 / 47.574 | Complex |
TkA03G146570 | LXL04_007247 | JCVI_TKOH_00131 | 96.2 | 98.996 / 98.316 | Strict |
TkA03G146580 | LXL04_007248 | JCVI_TKOH_00131 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA03G146590 | LXL04_007249 | JCVI_TKOH_00131 | 77.4 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA03G147940 | LXL04_007251 | JCVI_TKOH_00131 | 98.3 | 78.829 / 100.0 | Probable |
TkA03G148980 | LXL04_007254 | JCVI_TKOH_00131 | 99.6 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA03G149650 | LXL04_007255 | JCVI_TKOH_00131 | 94.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA03G149730 | LXL04_007255 | JCVI_TKOH_00131 | 94.2 | 100.0 / 100.0 | Complex |
TkA03G149920 | LXL04_007256 | JCVI_TKOH_00131 | 99.3 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA03G149930 | LXL04_007257 | JCVI_TKOH_00131 | 86.4 | 96.296 / 54.128 | 待复核 |