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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_007247
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 40994817-40998203 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3387 bp · LXL04_007247|LXL04_007247|OH1004|cDNA

ATGCGTCAACGTCCACCGCCGTTAATGGCGACTATTGTTTTGCTCTTCTTTCTCCTCCTCACGTCCGCCACTTTGCAAACGTACGCTGATAGTTCTCCGGAAACTCAATCAGAGATAGATGCACTTGTGGATTTCAAGCTTAAGCTTTATGATCCGCTTGGTGCGCTTACTAGCTGGGACCGAGCAACTGCGTCGGCGCCATGCGACTGGCGCGGTGTCGGTTGCTCCGATGGCCACGTCAGTGATATTCGACTTCCTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

3387 bp · LXL04_007247|LXL04_007247|OH1004|CDS

ATGCGTCAACGTCCACCGCCGTTAATGGCGACTATTGTTTTGCTCTTCTTTCTCCTCCTCACGTCCGCCACTTTGCAAACGTACGCTGATAGTTCTCCGGAAACTCAATCAGAGATAGATGCACTTGTGGATTTCAAGCTTAAGCTTTATGATCCGCTTGGTGCGCTTACTAGCTGGGACCGAGCAACTGCGTCGGCGCCATGCGACTGGCGCGGTGTCGGTTGCTCCGATGGCCACGTCAGTGATATTCGACTTCCTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1128 aa · LXL04_007247|LXL04_007247|OH1004|PROTEIN

MRQRPPPLMATIVLLFFLLLTSATLQTYADSSPETQSEIDALVDFKLKLYDPLGALTSWDRATASAPCDWRGVGCSDGHVSDIRLPRLQLRGILSRKLGDLRMLRRLSLRSNSFNGSIPSSLGKCDLLQYAFLQDNSFSGHIPPEISNLNELLIFNVAGNNISGEVPKNIPLSLRYLDLSSNSLSGELPGNLADLAGLQLINLSYNLFTGAIPERYGALQKLQFLWLDHNQLQGTLPSAIANCTSLVHFSADGNAIGGVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_007247
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_007247
位置Chr02:40994817-40998203 (+)
描述Similar to At4g36180: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g36180 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g36180。 暂无已核实直接文献
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献
At5g46330 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0576900 在器官发育的早期阶段通过调节细胞分裂速率发挥功能。
XIAO is involved in the control of organ size by contributing to the regulation of signaling and homeostasis of brassinosteroids and cell cycling in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04877.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007247 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090696 post-embryonic plant organ development 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程
GO:2000067 regulation of root morphogenesis 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G36180
ath:AT5G07280
ath:AT5G44700
dosa:Os04g0576900
osa:4336741
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.874
排名 1 · LXL04_007247 · OH-1004
内质网0.079
排名 2 · LXL04_007247 · OH-1004
细胞质0.064
排名 3 · LXL04_007247 · OH-1004
细胞核0.043
排名 4 · LXL04_007247 · OH-1004
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · LXL04_007247 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_236-76 aa
PF13855.13LRR_8173-232 aa
PF23598.2LRR_14173-249 aa
PF13855.13LRR_8297-358 aa
PF23598.2LRR_14314-423 aa
PF13855.13LRR_8367-405 aa
PF23598.2LRR_14387-473 aa
PF13855.13LRR_8419-478 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_007247PF08263.18LRRNT_236763.6e-1040.7
LXL04_007247PF13855.13LRR_81732321.9e-57191.6
LXL04_007247PF23598.2LRR_141732499.1e-46156.9
LXL04_007247PF13855.13LRR_82973581.9e-57191.6
LXL04_007247PF23598.2LRR_143144239.1e-46156.9
LXL04_007247PF13855.13LRR_83674051.9e-57191.6
LXL04_007247PF23598.2LRR_143874739.1e-46156.9
LXL04_007247PF13855.13LRR_84194781.9e-57191.6
LXL04_007247PF23598.2LRR_144625229.1e-46156.9
LXL04_007247PF13855.13LRR_84665241.9e-57191.6
LXL04_007247PF12799.14LRR_44675043e-43145.6
LXL04_007247PF23598.2LRR_144867369.1e-46156.9
LXL04_007247PF13855.13LRR_85385981.9e-57191.6
LXL04_007247PF12799.14LRR_45876253e-43145.6
LXL04_007247PF13855.13LRR_86086461.9e-57191.6
LXL04_007247PF12799.14LRR_46126503e-43145.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGS2拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3618065.031%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FIZ3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO234.944%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LYN8拟南芥Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS133.027%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FL28拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS233.027%Swiss-Prot中等数据库同源证据
G9LZD7水稻Probable inactive leucine-rich repeat receptor kinase XIAO54.930%Swiss-Prot强数据库同源证据

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