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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G191150
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 48991381-48994446 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1311 bp · TkA02G191150|TK1151|cDNA

CAATCCCCACGATTTTAGCTGGACTCCAAAACATTTCAAAGCGTTATCTTCTCAACCTCACCTCTGGCAGCCGATCTTCCCTCCGCGAATCACTCCGCGATCAACCTTTATCAACACCATCTGCCACCACTATCGCACCACTCAACCTCCTATCTCTTTCTACACAGATACCAACATCCAACAATAATCGCGACGGAGATGAAGTCATTAGTGTACAAGTCAGTCGTTTCTCATCATAAGGTTAAGAAGGTTTGATGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

663 bp · TkA02G191150|TK1151|CDS

ATGGAGAGTGTGTTAACTGACTGTGTACAGAATAGTCTGCGACATCTATTATACCGCAATGCAATTTTCATGTGTGAACGCCTTTGCTCTGAGTTTCCCTCAGAGGCAAACTTGCAGTTGTTAGCTGCATGTTACTTGCAAAGCAATCAAGCTTACTCGGCTTACCATATTTTAAAGGGAACACAAATGCCTCAGTCCAGATACTTGTTTGCAATATCATGCTTCCAAATGGATCTCCTAAATGAAGCAGAAATGGCATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

220 aa · TkA02G191150|TK1151|PROTEIN

MESVLTDCVQNSLRHLLYRNAIFMCERLCSEFPSEANLQLLAACYLQSNQAYSAYHILKGTQMPQSRYLFAISCFQMDLLNEAEMALCPSNEPSAEVPNGAAGHYLLGLIYRYTDRMKSVVHQFNQALSLDPLLWAAYEELCKLGAAGEARSVFGESASECIHRNKPGIRVFIRALINVVTRFFNLSFKNISEGQSTLALQVNRRILLQFNLLNYCFFKL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G191150
TK1151 IDTkA02G191150
OH-1004 IDLXL04_027512
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 74.545 / OH-1004 21.551
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G191150
位置Chr02:48991381-48994446 (-)
描述Similar to CDC27B: Cell division cycle protein 27 homolog B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g20000 后期促进复合物/环体 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。
Specialization of CDC27 function in the Arabidopsis thaliana anaphase-promoting complex (APC/C).2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03312.x
At3g16320 后期促进复合物/环体 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。
Specialization of CDC27 function in the Arabidopsis thaliana anaphase-promoting complex (APC/C).2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03312.x
Overexpression of the Arabidopsis anaphase promoting complex subunit CDC27a increases growth rate and organ size.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9525-7

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027512 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007091 metaphase/anaphase transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0007346 regulation of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0010071 root meristem specification 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048829 root cap development 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051445 regulation of meiotic cell cycle 生物过程
GO:0070936 protein K48-linked ubiquitination 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G20000
ath:AT3G16320
bta:540660
hsa:996
rno:360643
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.524
排名 1 · TkA02G191150 · TK1151
细胞核0.349
排名 2 · TkA02G191150 · TK1151
高尔基体0.111
排名 3 · TkA02G191150 · TK1151
线粒体0.090
排名 4 · TkA02G191150 · TK1151
内质网0.081
排名 5 · TkA02G191150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12895ANAPC316-88 aa
PF29407CFAP70_TPR_C18-96 aa
PF13428TPR_1418-43 aa
PF14559TPR_1918-59 aa
PF04049ANAPC834-67 aa
PF07719TPR_239-50 aa
PF13181TPR_840-50 aa
PF00515TPR_141-49 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G191150PF12895ANAPC316882.5e-2073.3
TkA02G191150PF29407CFAP70_TPR_C18960.0009319.5
TkA02G191150PF13428TPR_1418430.04415.2
TkA02G191150PF14559TPR_1918590.05814.5
TkA02G191150PF04049ANAPC834670.02914.6
TkA02G191150PF07719TPR_239500.007817.0
TkA02G191150PF13181TPR_840500.01316.3
TkA02G191150PF00515TPR_141490.002418.3
TkA02G191150PF14559TPR_1964840.05814.5
TkA02G191150PF13181TPR_866860.01316.3
TkA02G191150PF00515TPR_171760.002418.3
TkA02G191150PF04049ANAPC8991470.02914.6
TkA02G191150PF00515TPR_11011320.002418.3
TkA02G191150PF07719TPR_21011320.007817.0
TkA02G191150PF13428TPR_141031440.04415.2
TkA02G191150PF12895ANAPC31041562.5e-2073.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LGU6拟南芥sp|Q8LGU6|CD27B_ARATH Cell division cycle protein 27 homolog B76.200%Swiss-Prot高置信
Q06AN9拟南芥sp|Q06AN9|CD27A_ARATH Cell division cycle protein 27 homolog A61.600%Swiss-Prot高置信

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