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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_001367
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 25005335-25007730 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1077 bp · LXL04_001367|LXL04_001367|OH1004|cDNA

ATGTCTCAGGTAAACGAGAAAGATGCCGCGGCCAAGCCTGCCACAGCCACGGttttgtttttttatatatatatgtttttctTTTCCCATGCAGAAGAAAAGAAACCAGCCTCTGAATCAAGCTCCTCAGATACACAACCTGGAAGCATACCTCCCATGCCTTCCATGCCTGGAGCTGGATTCCCTGCAAATCCATTTGACTTTTCATCCATGGCTGGTCTACTCAACGACCCTAGCATTAAGGAATTAGCGGAACAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1077 bp · LXL04_001367|LXL04_001367|OH1004|CDS

ATGTCTCAGGTAAACGAGAAAGATGCCGCGGCCAAGCCTGCCACAGCCACGGTTTTGTTTTTTTATATATATATGTTTTTCTTTTCCCATGCAGAAGAAAAGAAACCAGCCTCTGAATCAAGCTCCTCAGATACACAACCTGGAAGCATACCTCCCATGCCTTCCATGCCTGGAGCTGGATTCCCTGCAAATCCATTTGACTTTTCATCCATGGCTGGTCTACTCAACGACCCTAGCATTAAGGAATTAGCGGAACAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

358 aa · LXL04_001367|LXL04_001367|OH1004|PROTEIN

MSQVNEKDAAAKPATATVLFFYIYMFFFSHAEEKKPASESSSSDTQPGSIPPMPSMPGAGFPANPFDFSSMAGLLNDPSIKELAEQIAKDPSFNQMAEQLQQTFHAPDEGVPQFDTQQYYSTMQQVMQNPQFMTMAERLGNAMMQDPSMSQMLESLSNPAQKDQLEERMARIKEDPSLKPILEEIESGGPTAMMRYWNDQDVLKKLGEAMGLAVSEDATAASAGNEPEEDTNEDESIVHQTASVGDVEGLKKALESGADK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_001367
TK1151 IDTkA01G542520
OH-1004 IDLXL04_001367
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_001367
位置Chr01:25005335-25007730 (-)
描述Similar to AKR2B: Ankyrin repeat domain-containing protein 2B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17390 对叶绿体外膜、线粒体外膜、内质网膜和过氧化物酶体蛋白表现出分子伴侣活性，通过招募含单个跨膜结构且与 AKR2A 结合序列（ABS）相关的特定蛋白，并随后结合存在于目标细胞器膜中的糖脂（例如单半乳糖二酰基甘油（MGDG）和磷脂酰甘油（PG））。 暂无已核实直接文献
At4g35450 对叶绿体外膜、线粒体外膜、内质网膜和过氧化物酶体蛋白表现出分子伴侣活性，通过招募含单个跨膜结构且与 AKR2A 结合序列（ABS）相关的特定蛋白，并随后结合存在于目标细胞器膜中的糖脂（例如单半乳糖二酰基甘油（MGDG）和磷脂酰甘油（PG））。
An ankyrin repeat-containing protein plays a role in both disease resistance and antioxidation metabolism.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01205.x
AKR2A-mediated import of chloroplast outer membrane proteins is essential for chloroplast biogenesis.2008 · DOI: 10.1038/ncb1683
ANKYRIN REPEAT-CONTAINING PROTEIN 2A is an essential molecular chaperone for peroxisomal membrane-bound ASCORBATE PEROXIDASE3 in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.065979

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001367 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000209 protein polyubiquitination 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0016055 Wnt signaling pathway 生物过程
GO:0018105 peptidyl-serine phosphorylation 生物过程
GO:0018107 peptidyl-threonine phosphorylation 生物过程
GO:0032210 regulation of telomere maintenance via telomerase 生物过程
GO:0032212 positive regulation of telomere maintenance via telomerase 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17390
ath:AT4G35450
hsa:8658
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.444
排名 1 · LXL04_001367 · OH-1004
过氧化物酶体0.277
排名 2 · LXL04_001367 · OH-1004
线粒体0.244
排名 3 · LXL04_001367 · OH-1004
细胞核0.179
排名 4 · LXL04_001367 · OH-1004
内质网0.104
排名 5 · LXL04_001367 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17830.7STI1-HOP_DP167-211 aa
PF12796.14Ank_2226-295 aa
PF24521.3Ank_KRIT1232-346 aa
PF12796.14Ank_2239-329 aa
PF13637.13Ank_4245-287 aa
PF00023.37Ank267-298 aa
PF13637.13Ank_4274-320 aa
PF13857.13Ank_5286-340 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_001367PF17830.7STI1-HOP_DP1672113.6e-1453.1
LXL04_001367PF12796.14Ank_22262951.6e-39135.1
LXL04_001367PF24521.3Ank_KRIT12323463.5e-0730.8
LXL04_001367PF12796.14Ank_22393291.6e-39135.1
LXL04_001367PF13637.13Ank_42452876.5e-2174.6
LXL04_001367PF00023.37Ank2672982.2e-1969.2
LXL04_001367PF13637.13Ank_42743206.5e-2174.6
LXL04_001367PF13857.13Ank_52863401.2e-1351.8
LXL04_001367PF12796.14Ank_22913521.6e-39135.1
LXL04_001367PF00023.37Ank2993302.2e-1969.2
LXL04_001367PF13606.13Ank_33003264.8e-1348.6
LXL04_001367PF13637.13Ank_43043526.5e-2174.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q29Q26拟南芥Ankyrin repeat domain-containing protein 2B69.069%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SAR5拟南芥Ankyrin repeat domain-containing protein 2A70.358%Swiss-Prot强数据库同源证据

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