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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G542520
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 136106196-136109100 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1554 bp · TkA01G542520|TK1151|cDNA

TTTCGTCAGGCTGGACTGCTGGAGGATTGACGTGGCCCACGCCTTCACCCATCTCTCTACTTCATCGTCTCCTTCCCTCATCCCTGAGTTTTATCAAAAACCTCGCTACTCCAATCACTCATTCCAGATTTCTCGATCTACAATTCTTAATTTATTATTCTTTACATCACTTTGATCGTTATGTCTCAGGTAAACGAGAAAGATGCCGCGGCCAAGCCTGCCACAGCCACGGAAAAGAAACCAGCCTCTGAATCAAGCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1032 bp · TkA01G542520|TK1151|CDS

ATGTCTCAGGTAAACGAGAAAGATGCCGCGGCCAAGCCTGCCACAGCCACGGAAAAGAAACCAGCCTCTGAATCAAGCTCCTCAGATACACAACCTGGAAGCATACCTCCCATGCCTTCCATGCCTGGAGCTGGATTCCCTGCAAATCCTTTTGACTTTTCATCCATGGCTGGTCTACTCAACGACCCTAGCATTAAGGAATTAGCGGAACAAATAGCAAAAGATCCATCATTCAACCAAATGGCAGAACAACTTCAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

343 aa · TkA01G542520|TK1151|PROTEIN

MSQVNEKDAAAKPATATEKKPASESSSSDTQPGSIPPMPSMPGAGFPANPFDFSSMAGLLNDPSIKELAEQIAKDPSFNQMAEQLQQTFHAPDEGVPQFDTQQYYSTMQQVMQNPQFMTMAERLGNAMMQDPSMSQMLESLSNPAQKDQLEERMARIKEDPSLKPILEEIESGGPTAMMRYWNDQDVLKKLGEAMGLAVSEDATAASAGNEPEEDTNEDESIVHQTASVGDVEGLKKALESGADKDEEDSEGRTALHFAC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G542520
TK1151 IDTkA01G542520
OH-1004 IDLXL04_001367
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G542520
位置Chr01:136106196-136109100 (+)
描述Similar to AKR2B: Ankyrin repeat domain-containing protein 2B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17390 对叶绿体外膜、线粒体外膜、内质网膜和过氧化物酶体蛋白表现出分子伴侣活性，通过招募含单个跨膜结构且与 AKR2A 结合序列（ABS）相关的特定蛋白，并随后结合存在于目标细胞器膜中的糖脂（例如单半乳糖二酰基甘油（MGDG）和磷脂酰甘油（PG））。 暂无已核实直接文献
At4g35450 对叶绿体外膜、线粒体外膜、内质网膜和过氧化物酶体蛋白表现出分子伴侣活性，通过招募含单个跨膜结构且与 AKR2A 结合序列（ABS）相关的特定蛋白，并随后结合存在于目标细胞器膜中的糖脂（例如单半乳糖二酰基甘油（MGDG）和磷脂酰甘油（PG））。
An ankyrin repeat-containing protein plays a role in both disease resistance and antioxidation metabolism.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01205.x
AKR2A-mediated import of chloroplast outer membrane proteins is essential for chloroplast biogenesis.2008 · DOI: 10.1038/ncb1683
ANKYRIN REPEAT-CONTAINING PROTEIN 2A is an essential molecular chaperone for peroxisomal membrane-bound ASCORBATE PEROXIDASE3 in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.065979

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001367 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000209 protein polyubiquitination 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0016055 Wnt signaling pathway 生物过程
GO:0018105 peptidyl-serine phosphorylation 生物过程
GO:0018107 peptidyl-threonine phosphorylation 生物过程
GO:0032210 regulation of telomere maintenance via telomerase 生物过程
GO:0032212 positive regulation of telomere maintenance via telomerase 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17390
ath:AT4G35450
hsa:8658
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.725
排名 1 · TkA01G542520 · TK1151
细胞核0.311
排名 2 · TkA01G542520 · TK1151
过氧化物酶体0.150
排名 3 · TkA01G542520 · TK1151
线粒体0.118
排名 4 · TkA01G542520 · TK1151
内质网0.074
排名 5 · TkA01G542520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16550RPN13_C55-93 aa
PF29340RsmA_N57-88 aa
PF17830STI1-HOP_DP58-81 aa
PF25575TPR_BSK1_C59-148 aa
PF07319DnaI_N65-84 aa
PF01984dsDNA_bind84-172 aa
PF25179LMF1_C95-148 aa
PF16550RPN13_C97-145 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G542520PF16550RPN13_C55930.212.5
TkA01G542520PF29340RsmA_N57880.04115.0
TkA01G542520PF17830STI1-HOP_DP58812.9e-1453.4
TkA01G542520PF25575TPR_BSK1_C591480.1412.8
TkA01G542520PF07319DnaI_N65840.04115.2
TkA01G542520PF01984dsDNA_bind841720.1513.0
TkA01G542520PF25179LMF1_C951480.2212.3
TkA01G542520PF16550RPN13_C971450.212.5
TkA01G542520PF17830STI1-HOP_DP1061192.9e-1453.4
TkA01G542520PF07319DnaI_N1061590.04115.2
TkA01G542520PF17898GerD1061550.05914.0
TkA01G542520PF29340RsmA_N1201430.04115.0
TkA01G542520PF17830STI1-HOP_DP1271452.9e-1453.4
TkA01G542520PF17830STI1-HOP_DP1521962.9e-1453.4
TkA01G542520PF29340RsmA_N1551700.04115.0
TkA01G542520PF12796Ank_22152809.7e-40135.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q29Q26拟南芥sp|Q29Q26|AKR2B_ARATH Ankyrin repeat domain-containing protein 2B63.400%Swiss-Prot高置信
Q9SAR5拟南芥sp|Q9SAR5|AKR2A_ARATH Ankyrin repeat domain-containing protein 2A53.700%Swiss-Prot中等置信

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