ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 48 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G298440
Chr04:75498796-75499501 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_007488
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.300 查询 100.000 / 对象 45.370 |
TkA04G298440 | |
|
TkA04G298580
Chr04:75531621-75532298 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_025969
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CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.800 查询 68.376 / 对象 67.227 |
TkA04G298580 | |
|
TkA04G300020
Chr04:75880086-75881851 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_032521
Chr07:24704335-24705745 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G300020 | |
|
TkA04G301960
Chr04:76323674-76324222 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037406
Chr09:9887096-9887647 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 99.454 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G301960 |
|
TkA04G303290
Chr04:76600232-76601787 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_005271
Chr01:159402059-159403676 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G303290 | |
|
TkA04G304840
Chr04:76988641-76989297 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_019252
Chr04:27368255-27370885 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.800 查询 86.000 / 对象 20.379 |
TkA04G304840 | |
|
TkA04G305740
Chr04:77190012-77195387 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_033254
Chr07:39397075-39403340 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.800 查询 55.862 / 对象 37.156 |
TkA04G305740 | |
|
TkA04G305750
Chr04:77196272-77204192 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037425
Chr09:10705511-10716783 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 59.985 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G305750 |
|
TkA04G305850
Chr04:77232216-77232683 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_011109
Chr02:157989441-157989983 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
80.200 查询 52.258 / 对象 45.000 |
TkA04G305850 | |
|
TkA04G306370
Chr04:77333665-77344037 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037425
Chr09:10705511-10716783 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.100 查询 99.808 / 对象 40.015 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G306370 |
|
TkA04G306430
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GWHBCHF00000005
|
LXL04_037426
Chr09:10754206-10757869 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.200 查询 91.228 / 对象 43.515 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G306430 |
|
TkA04G306590
Chr04:77388824-77390058 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039865
ChrUn:190828-192062 (+)
JAJTUU010000055.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G306590 | |
|
TkA04G307420
Chr04:77576029-77577464 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037428
Chr09:10892420-10895277 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 100.000 / 对象 46.204 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G307420 |
|
TkA04G307430
Chr04:77578586-77579171 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037428
Chr09:10892420-10895277 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 24.512 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G307430 |
|
TkA04G307640
Chr04:77628797-77629270 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_018085
Chr04:6403402-6404112 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.300 查询 74.522 / 对象 49.576 |
TkA04G307640 | |
|
TkA04G308120
Chr04:77721170-77722859 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_017688
Chr03:157185613-157186086 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 90.345 / 对象 83.439 |
TkA04G308120 | |
|
TkA04G308220
Chr04:77759790-77761187 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_017741
Chr04:612679-614077 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G308220 | |
|
TkA04G308230
Chr04:77762763-77766872 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037436
Chr09:11067458-11071262 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G308230 |
|
TkA04G308300
Chr04:77786427-77792311 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037439
Chr09:11091453-11092067 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G308300 |
|
TkA04G308480
Chr04:77837418-77841186 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_014711
Chr03:55303771-55307038 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.400 查询 94.279 / 对象 63.823 |
TkA04G308480 | |
|
TkA04G308930
Chr04:77926307-77928008 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037443
Chr09:11235369-11241266 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 99.198 / 对象 66.369 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G308930 |
|
TkA04G309010
Chr04:77954353-77954926 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_038246
Chr09:35181199-35187727 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 22.989 / 对象 12.461 |
TkA04G309010 | |
|
TkA04G309270
Chr04:78024926-78025696 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039776
ChrUn:62582-66222 (+)
JAJTUU010000040.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 89.262 / 对象 36.740 |
JCVI_TKOH_00216 | TkA04G309270 |
|
TkA04G309280
Chr04:78025939-78032452 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039776
ChrUn:62582-66222 (+)
JAJTUU010000040.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 85.165 / 对象 42.818 |
JCVI_TKOH_00216 | TkA04G309280 |
|
TkA04G309290
Chr04:78041664-78042461 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037448
Chr09:11342747-11343683 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 88.889 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G309290 |
|
TkA04G309440
Chr04:78075975-78076283 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_026230
Chr05:123448373-123448741 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 96.078 / 对象 80.328 |
TkA04G309440 | |
|
TkA04G309460
Chr04:78080041-78083156 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_026229
Chr05:123441104-123444926 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 95.783 / 对象 44.789 |
TkA04G309460 | |
|
TkA04G309730
Chr04:78144352-78147325 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037461
Chr09:11436356-11438526 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 65.079 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G309730 |
|
TkA04G309770
Chr04:78149932-78150308 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037462
Chr09:11441133-11441509 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G309770 |
|
TkA04G309850
Chr04:78163052-78163438 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039617
ChrUn:106328-106714 (+)
JAJTUU010000019.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00216 | TkA04G309850 |
|
TkA04G311280
Chr04:78450438-78453473 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037469
Chr09:11751041-11754080 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G311280 |
|
TkA04G311530
Chr04:78521301-78524881 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037471
Chr09:11808547-11811983 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 91.667 / 对象 69.291 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G311530 |
|
TkA04G311590
Chr04:78542767-78545755 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039624
ChrUn:507073-509220 (+)
JAJTUU010000019.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.100 查询 100.000 / 对象 63.536 |
JCVI_TKOH_00217 | TkA04G311590 |
|
TkA04G311620
Chr04:78550201-78550574 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039627
ChrUn:513667-514040 (+)
JAJTUU010000019.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00217 | TkA04G311620 |
|
TkA04G312440
Chr04:78697469-78700913 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037483
Chr09:11958398-11961527 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.400 查询 96.000 / 对象 55.522 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G312440 |
|
TkA04G312770
Chr04:78768367-78770530 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037484
Chr09:12024073-12025563 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 97.468 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G312770 |
|
TkA04G313890
Chr04:79049615-79051225 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037495
Chr09:12201817-12203846 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 78.884 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G313890 |
|
TkA04G313940
Chr04:79064459-79068062 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_021202
Chr04:124400540-124404229 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G313940 | |
|
TkA04G315280
Chr04:79477682-79479279 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_037516
Chr09:12659851-12661448 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00198 | TkA04G315280 |
|
TkA04G315460
Chr04:79554889-79555610 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_039636
ChrUn:264560-278227 (-)
JAJTUU010000020.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 16.322 |
TkA04G315460 | |
|
TkA04G317620
Chr04:80208802-80210450 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_008477
Chr02:100659255-100659959 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 94.872 |
TkA04G317620 | |
|
TkA04G317650
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100.000 查询 100.000 / 对象 70.157 |
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CM104807.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.700 查询 100.000 / 对象 57.764 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.300 查询 98.279 / 对象 96.939 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA04G337670
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GWHBCHF00000005
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Chr09:19147648-19148925 (-)
CM104807.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
61.200 查询 100.000 / 对象 66.920 |
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TkA04G338610
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.000 查询 100.000 / 对象 97.115 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 38.621 / 对象 60.215 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
96.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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TkA04G339840 | |
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CM104807.1
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
78.500 查询 72.789 / 对象 41.154 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.900 查询 73.592 / 对象 98.419 |
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92.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.700 查询 98.101 / 对象 43.601 |
JCVI_TKOH_00199 | TkA04G341680 |