ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 42 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA04G019510
Chr04:4887242-4888457 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_023058
Chr05:21373163-21375389 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
47.500 查询 87.162 / 对象 98.431 |
TkA04G019510 | |
|
TkA04G019820
Chr04:4962556-4963146 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036869
Chr08:49479472-49480062 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G019820 |
|
TkA04G020260
Chr04:5123198-5126239 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036863
Chr08:49262025-49264007 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G020260 |
|
TkA04G020560
Chr04:5225719-5229942 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036855
Chr08:49184827-49188031 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.571 / 对象 51.101 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G020560 |
|
TkA04G020680
Chr04:5261190-5263527 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036851
Chr08:49155102-49165289 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
75.200 查询 99.048 / 对象 53.783 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G020680 |
|
TkA04G020880
Chr04:5311309-5315812 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036851
Chr08:49155102-49165289 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 93.750 / 对象 16.871 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G020880 |
|
TkA04G020980
Chr04:5338081-5338635 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036843
Chr08:49077333-49080723 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
77.800 查询 58.065 / 对象 68.182 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G020980 |
|
TkA04G021040
Chr04:5353601-5354432 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_018303
Chr04:11091625-11092516 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G021040 | |
|
TkA04G021150
Chr04:5369621-5370068 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_002452
Chr01:49054539-49054986 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.300 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G021150 | |
|
TkA04G022250
Chr04:5646465-5652609 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036826
Chr08:48859724-48860655 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G022250 |
|
TkA04G022750
Chr04:5766754-5773849 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036819
Chr08:48802209-48805466 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.900 查询 89.352 / 对象 32.657 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G022750 |
|
TkA04G022910
Chr04:5840928-5842316 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_016355
Chr03:120103001-120104219 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.200 查询 89.726 / 对象 78.916 |
TkA04G022910 | |
|
TkA04G022960
Chr04:5859883-5860458 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_006622
Chr02:20000011-20002373 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 92.670 / 对象 23.351 |
TkA04G022960 | |
|
TkA04G023040
Chr04:5879524-5881749 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036830
Chr08:48938966-48945802 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
67.100 查询 64.352 / 对象 41.518 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G023040 |
|
TkA04G023530
Chr04:6050443-6052691 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036817
Chr08:48784930-48792338 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.100 查询 100.000 / 对象 51.105 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G023530 |
|
TkA04G023860
Chr04:6152929-6155104 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_031273
Chr07:3798447-3800620 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G023860 | |
|
TkA04G023890
Chr04:6163034-6167110 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036804
Chr08:48616327-48619487 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.900 查询 98.827 / 对象 82.903 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G023890 |
|
TkA04G023940
Chr04:6196729-6197298 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036802
Chr08:48585828-48586646 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 82.174 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G023940 |
|
TkA04G023960
Chr04:6208994-6213741 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_000873
Chr01:16000880-16009297 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
63.200 查询 69.403 / 对象 99.211 |
JCVI_TKOH_00173 | TkA04G023960 |
|
TkA04G024620
Chr04:6379255-6379566 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036785
Chr08:48311955-48312191 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
85.500 查询 73.786 / 对象 97.436 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G024620 |
|
TkA04G024710
Chr04:6416992-6417567 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036781
Chr08:48248547-48250021 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.400 查询 100.000 / 对象 32.055 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G024710 |
|
TkA04G024780
Chr04:6445187-6445952 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036779
Chr08:48221389-48223336 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.300 查询 80.714 / 对象 37.542 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G024780 |
|
TkA04G024890
Chr04:6467167-6467781 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_030885
Chr06:124568350-124568976 (-)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
47.800 查询 33.824 / 对象 33.173 |
TkA04G024890 | |
|
TkA04G025030
Chr04:6525871-6528231 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036774
Chr08:48152441-48157403 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 100.000 / 对象 52.151 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025030 |
|
TkA04G025040
Chr04:6529052-6530994 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036774
Chr08:48152441-48157403 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.600 查询 88.704 / 对象 47.849 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025040 |
|
TkA04G025190
Chr04:6586291-6587541 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036764
Chr08:48096364-48100758 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 43.600 / 对象 26.521 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025190 |
|
TkA04G025420
Chr04:6642980-6643282 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036760
Chr08:48016094-48024233 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 43.478 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025420 |
|
TkA04G025490
Chr04:6658490-6659400 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_000576
Chr01:10449686-10450267 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA04G025490 | |
|
TkA04G025540
Chr04:6668871-6675401 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036759
Chr08:48003804-48004943 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.700 查询 96.649 / 对象 98.945 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025540 |
|
TkA04G025580
Chr04:6686047-6686770 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036762
Chr08:48026971-48032444 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 32.542 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025580 |
|
TkA04G025700
Chr04:6719558-6721073 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036756
Chr08:47965271-47967763 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.300 查询 69.267 / 对象 69.267 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G025700 |
|
TkA04G025750
Chr04:6741713-6744453 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_029349
Chr06:88124762-88128235 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 97.214 / 对象 84.409 |
TkA04G025750 | |
|
TkA04G026110
Chr04:6839680-6840893 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036751
Chr08:47843656-47844869 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G026110 |
|
TkA04G026270
Chr04:6891014-6891852 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036746
Chr08:47748640-47749488 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G026270 |
|
TkA04G026360
Chr04:6909651-6911933 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036745
Chr08:47741822-47744371 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
68.000 查询 100.000 / 对象 89.517 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G026360 |
|
TkA04G026420
Chr04:6930104-6934730 (-)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036742
Chr08:47725655-47727779 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G026420 |
|
TkA04G026430
Chr04:6932931-6936238 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036741
Chr08:47721795-47722467 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 58.333 / 对象 46.667 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G026430 |
|
TkA04G026950
Chr04:7105612-7106534 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036735
Chr08:47527971-47547604 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 8.755 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G026950 |
|
TkA04G027290
Chr04:7216643-7219639 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036728
Chr08:47340850-47343423 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.800 查询 100.000 / 对象 68.514 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G027290 |
|
TkA04G027980
Chr04:7380677-7383271 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036716
Chr08:46995484-46997543 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00189 | TkA04G027980 |
|
TkA04G028120
Chr04:7430993-7433488 (+)
GWHBCHF00000005
|
LXL04_036712
Chr08:46913660-46915703 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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JCVI_TKOH_00189 | TkA04G043610 |